Anne sütü biyoaktif peptidlerinin farklı meme kanseri hücre dizileri üzerine etkisinin biyoinformatik temelli yaklaşımlar ile biyokimyasal olarak incelenmesi
Biochemical investigation of in vitro the effects of breast milk bioactive peptides on different breast cancer cell lines with bioinformatics based approaches
- Tez No: 812089
- Danışmanlar: PROF. DR. TUĞBA AKBAY
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyokimya, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Anne sütü, Biyoinformatik, Hücre dizisi, Meme hastalıkları, Meme neoplazmları, Neoplazmlar, Peptidler, Milk-human, Bioinformatics, Cell line, Breast diseases, Breast neoplasms, Neoplasms, Peptides
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Marmara Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyokimya (ecz) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Amaç: Meme kanserinde hücre ölümünü indükleyen yeni mekanizmalara sahip kemoterapötik ajanlar ile ilgili çalışmalar günümüzde halen devam etmektedir. Bu çalışmanın amacı MCF-7 ve MDA-MB-231 meme kanseri hücre hatları üzerine, anne sütü kaynaklı biyoaktif peptitlerin olası etkilerinin in vitro ve in siliko yaklaşımlar ile incelenmesidir. Gereç ve Yöntem: Anne sütünün in vitro gastrointestinal sindirimi sonrası elde edilen anne sütü hidrolizatı MCF-7 ve MDA-MB-231 hücre hatları ile muamele edilmiştir. Hücre hatlarının canlılıkları MTT yöntemi kullanılarak analiz edilmiştir. MCF-7 ve MDA-MB-231 hücre hattı kaynaklı proteinler LC-MS/MS ile tayin edilmiştir. Bu proteinlerin anne sütü hidrolizatındaki biyoaktif peptitler ile olan etkileşimleri biyoinformatik paket programları kullanılarak tespit edilmiştir. Bulgular: Anne sütünün in vitro gastrointestinal sindirimi sonrasında elde edilen biyoaktif peptitlerin MCF-7 ve MDA-MB-231 meme kanseri hücre hatları üzerinde sırasıyla % 18 ve % 5 ölüme neden olduğu tespit edilmiştir. Bu hücre ölümlerinde galektin-1, ras baskılayıcı protein-1 ve TRIAP-1 proteinlerinin artan ekspresyonlarının ve ras protein aktivatörü-3 proteinin azalan ekspresyonunun etkili olabileceği in siliko olarak belirlenmiştir. Sonuç: Çalışmamızın sonucunda büyüme ve gelişimi destekleyen anne sütünün meme kanseri hücre hatlarının ölümünde az oranda etkili olduğu gösterilmiştir. Anne sütü kaynaklı SLPCDICK ve HMWPGDIK peptitlerinin spesifik olarak uygulanmasının meme kanseri hücrelerinin ölüm mekanizmalarında daha etkili olabileceği düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
Objective: Studies on chemotherapeutic agents with new mechanisms inducing cell death in breast cancer are still continuing today. The aim of this study is to investigate the possible effects of breast milk-derived bioactive peptides on MCF-7 and MDA-MB-231 breast cancer cell lines by in vitro and in silico approaches. Materials and Methods: Breast milk hydrolyzate obtained after in vitro gastrointestinal digestion of breast milk was treated with MCF-7 and MDA-MB-231 cell lines. The viability of the cell lines was analyzed using the MTT method. Proteins from the MCF-7 and MDA-MB-231 cell line were determined by LC-MS/MS. The interactions of these proteins with bioactive peptides in breast milk hydrolyzate were determined using bioinformatics package programs. Results: Bioactive peptides derived from in vitro gastrointestinal digestion of breast milk were found to cause 18% and 5% mortality in MCF-7 and MDA-MB-231 breast cancer cell lines, respectively. Increased expression of galectin-1, ras suppressor protein-1, and TRIAP-1 proteins, as well as decreased expression of ras protein activator-3 protein, has been shown in silico to be effective in these cell deaths. Conclusion: As a result of our study, it has been shown that breast milk, which supports growth and development, is less effective in the death of breast cancer cell lines. Breast milk-derived SLPCDICK and HMWPGDIK peptides are thought to be more effective in the death mechanisms of breast cancer cells.
Benzer Tezler
- Isıl işlem uygulamalarının biyoaktif anne sütü proteinleri üzerine etkisinin in silico ve in vitro olarak incelenmesi
In silico and in vitro analysis of heat treatment applications effects on bioactive human milk proteins
FERHAN YAPAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyoteknolojiAnkara ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHMET ALTAY ÜNAL
- Preterm bebeklerde anne sütü ile beslenme ve major morbiditelerle ilişkisi
Feeding with breast milk in preterm babies and its relationship with major morbidities
FATMA BEGÜM ÇOPUR DUYDU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Çocuk Sağlığı ve Hastalıklarıİstanbul Medeniyet ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. SERTAÇ ARSLANOĞLU
- İkiz bebek annelerinin sütündeki makro besin ögelerinin doğum haftası ve bebeğin postnatal yaşına göre değişiminin tekiz bebeklerin anne sütüyle karşılaştırılması
Comparison of the changes in macronutrient content of breast milk according to gestational age and postnatal age in mothers of twin infants versus mothers of singleton infants
İLKNUR BAKİOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıGazi ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CANAN TÜRKYILMAZ
- Anne sütündeki sitokinlerle (TGF-beta1 ve IL-10) wheezy infant arasındaki ilişki
The relation between cytokines in mother milk (TGF-Beta1 ve IL-10) and wheezy infant
NURSEL MURATOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2007
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıÇukurova ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF.DR. DERYA UFUK ALTINTAŞ
- Farklı konsantrasyonlarda süte eklenen fluoksetinin polikaprolakton esaslı ve immünosorbent özellikli filtre aracılığı ile uzaklaştırılması
Added fluoxetine in different concentrations by polycaprolactone based-immunosorbent filter
HAVA DUDU TASLAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyokimyaMarmara ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TUĞBA TUNALI AKBAY