Doğal enfekte mandalarda toxocara vitulorum'un mikroskobik ve moleküler yöntemlerle araştırılması ve filogenetik analizi
Phlogenethic analysis and investigation of toxocara vitulorum in naturally infected water buffaloes by microscobic and molecular methods
- Tez No: 816542
- Danışmanlar: PROF. DR. KÜRŞAT ALTAY
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Toxocara vitulorum, PCR, DNA dizi analizi, Filogeni, Manda, Sivas, Toxocara vitulorum, PCR, DNA sequence, Phylogeny, Water buffalo, Sivas
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Veterinerlik Parazitolojisi Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 134
Özet
DOĞAL ENFEKTE MANDALARDA TOXOCARA VİTULORUM'UN MiKROSKOBİK VE MOLEKÜLER YÖNTEMLERLE ARAŞTIRILMASI VE FİLOGENETİK ANALİZİ Osman Furkan URHAN Erciyes Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü (Sivas Cumhuriyet Üniversitesi Ortak) Veteriner Parazitoloji Anabilim Dalı Doktora Tezi, Temmuz 2023 Danışman: Prof. Dr. Kürşat ALTAY ÖZET Toxocara vitulorum, sığır ve mandaları enfekte edebilen patojenik bir nematod türüdür. Bu nematod, özellikle tropikal ve subtropikal ülkelerde geniş coğrafi dağılıma sahiptir. Toxocara vitulorum buzağı ve malaklarda şiddetli klinik enfeksiyonlara yol açar. Ayrıca bu nematod, malaklarda buzağılara göre daha patojenik bir etkiye sahip olup tedavi edilmediği takdirde ölümlere neden olabilmektedir. Türkiye'de mandalarda (Bubalus bubalis) T. vitulorum'un varlığı ve yaygınlığı hakkında neredeyse hiçbir veri yoktur. Bu çalışma mikroskobik ve moleküler teknikler kullanarak farklı yaşlardaki mandalarda T. vitulorum'un prevalansını, dağılımını ve filogenisini değerlendirmeyi amaçlamıştır. Bu amaçla, Türkiye'nin önemli manda yetiştirme merkezlerinden biri olan Sivas ilinin farklı yörelerinde yetiştiriciliği yapılan mandalardan dışkı (n:510) ve süt (n:100) örnekleri alınmıştır. Dışkı örneklerinin mikroskobik muayenesi sonucunda, 510 mandanın 42 (%8,23)'sinin dışkısında T. vitulorum yumurtası saptanırken, polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) sonucunda aynı numunelerin 54 (%10,58)'ünde pozitif amplifikasyon ürünü elde edilmiştir. Toxocara vitulorum prevalansı 0-6 aylık hayvanlarda diğer gruplara göre daha yüksek bulunmuştur. 0-6 aylık hayvanlar kendi içlerinde gruplandırıldığında 1-3 aylık hayvanlarda T. vitulorum prevalansı hem 1 aydan küçük hem de 3 aydan büyük hayvanlara göre daha yüksek saptanmıştır. Toxocara vitulorum enfeksiyonlarının yayılışı üzerinde cinsiyetin etkisi incelendiğinde, 105 erkek malağın mikroskobik olarak 21 (%20,00)'inin, moleküler olarak 23 (%21,90)'ünün; 105 dişi malağın mikroskobik olarak 18 (%17,14)'inin, moleküler olarak ise 19 (%18,09)'unun T. vitulorum yönünden enfekte olduğu saptanmıştır. Altı aylıktan büyük hayvanlardan alınan dışkı örneklerinde de, T. vitulorum saptanmıştır. Kolostrum/süt örneklerinde mikroskobik ve moleküler tekniklerle sırasıyla %4,00 ve %10,00 oranında T. vitulorum larvası bulunmuştur. Larvalar doğum sonrası 2. ve 28. günler arasında anneden alınan kolostrum/süt örneklerinde tespit edilmiştir. Bu çalışmada, rastgele seçilen 11 PCR-pozitif numunenin ITS-1 geni sekanslanmıştır. Elde edilen sekanslar GenBank'a yüklenerek OQ733339-OQ733349 erişim numaraları alınmıştır. Bu çalışmada elde edilen T. vitulorum sekans verileri ile daha önce GenBank veri tabanına yüklenen sekans verileri arasında %98,99-100 nükleotid özdeşliği belirlenmiştir. Sonuç olarak, bu çalışmada elde edilen veriler T. vitulorum'un epidemiyolojisine katkı sağlamıştır. Ayrıca 6 aydan büyük hayvanların dışkısında T. vitulorum yumurtalarının saptanması veteriner hekimlerin parazitlerle mücadelede sadece genç hayvanları değil yaşlı hayvanları da dikkate alması gerektiğini ortaya koymaktadır.
Özet (Çeviri)
PHLOGENETHIC ANALYSIS AND INVESTIGATION OF TOXOCARA VITULORUM IN NATURALLY INFECTED WATER BUFFALOES BY MICROSCOBIC AND MOLECULAR METHODS Osman Furkan URHAN Sivas Cumhuriyet University, Graduate School of Health Science (Partner with Sivas Cumhuriyet University) Department of Veterinary Parasitology PhD Thesis, July 2023 Supervisor: Prof. Dr. Kürşat ALTAY ABSTRACT Toxocara vitulorum is a pathogenic nematode species that can infect cattle and water buffalo. This nematode has wide geographic distributions, especially in tropical and subtropical countries. Toxocara vitulorum leads to severe infection in cattle and water buffalo calves. Furthermore, this nematode has a more pathogenic effect in water buffalo calves compared to cattle calves, even causing death if not treated. There is almost no data on the presence and prevalence of T. vitulorum in buffaloes (Bubalus bubalis) in Turkey.This work aimed to assess the prevalence, distributions, and phylogeny of T. vitulorum in water buffaloes of different ages using microscopic and molecular techniques. For this purpose, stool (n:510) and milk (n:100) samples were obtained from different parts of Sivas province, which is one of the important buffalo breeding areas in Türkiye. In this study, T. vitulorum was found in 42 (8,23%) and 54 (10,58%) stool samples using microscopic and molecular techniques, respectively. The prevalence of T. vitulorum was higher in animals aged between 0 and 6 months compared to other groups. In the current work, when animals aged 0 to 6 months were grouped within themselves, the prevalence of T. vitulorum in 1-3 month-old animals was higher than in both younger than one month and older than three months. When the effect of gender on the spread of T. vitulorum infections was examined, it was determined that 21 (20%) of 105 male water buffalo calves were microscopically and 23 (21.90%) of 105 male were moleculary infected in terms of T. vitulorum. Whereas, 18 (17.14%) of 105 female water buffalo calves were microscopically and 19 (18.10%) of 105 female were moleculary infected. T. vitulorum was detected in stool samples obtained from animals older than six months. In colostrum/milk samples, T. vitulorum larvae were found in 4% and 10% with microscopic and molecular techniques, respectively. The larvae were detected in colostrum/milk samples from the mother between the 2nd and 28th days postpartum. In this study, the ITS-1 gene of randomly selected 11 PCR-positive samples was sequenced. The obtained sequences was uploaded to the GenBank under accession numbers: OQ733339-OQ733349. The 98,99-100% nucleotide identity was determined between T. vitulorum obtained in this study and those present in the GenBank database. In conclusion, the data obtained in this study contributed to the epidemiology of T. vitulorum. Furthermore, these data revealed that veterinarians should take into account not only young animals but also older animals in the fight against parasites due to the detection of T. vitulorum eggs in the stool of animals older than 6 months.
Benzer Tezler
- Investigations of Aspergillus fumigatus RNA silencing mechanisms and pathogenicity in the presence of dsRNA mycoviruses
Aspergillus fumigatus RNA susturma mekanizmalarının ve patojenitesinin dsRNA mikovirüsler varlığında araştırılması
SELİN ÖZKAN KOTİLOĞLU
Doktora
İngilizce
2015
BiyolojiImperial College LondonMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PIETRO SPANU
DOÇ. DR. ROBERT H.A. COUTTS
- Doğal enfekte paratüberkülozisli saanen keçilerinde bazı akut faz proteinleri, sitokinler ve hepsidin düzeylerinin değerlendirilmesi
Evaluation of some acute phase proteins, cytokines and hepcidin levels in naturally infected saanen goats with paratuberculosis
NECMETTİN SARP SEVGİSUNAR
Doktora
Türkçe
2017
Veteriner HekimliğiMehmet Akif Ersoy Üniversitesiİç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞİMA ŞAHİNDURAN
- Doğal enfekte koyun uterus, meme ve böbreklerinde leptospiral antijenlerin immünohistokimyasal immünofloresan ve ELISA yöntemleriyle araştırılması ve patolojik bulgular
Investigation of leptospiral antigens in naturally infected sheep uterus, mammary and kidneys by immunohistochemical immunofluorescence and ELISA methods and pathological findings
GİZEM ESER
Doktora
Türkçe
2024
Veteriner HekimliğiAtatürk ÜniversitesiPatoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAVUZ SELİM SAĞLAM
- Doğal enfekte kriptosporidiozisli buzağılarda bazı akut faz proteinlerinin değerlendirilmesi
Evaluation of some acute phase proteins in calves with naturally infected cryptosporidosis
İLKER YUSUF AKINCI
Doktora
Türkçe
2023
Veteriner HekimliğiBurdur Mehmet Akif Ersoy Üniversitesiİç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. METİN KORAY ALBAY
- Doğal enfekte köpek uteruslarında leptospiral antijenlerin immunohistokimyasal ve ELISA yöntemleri ile belirlenmesi
Determination of leptospiral antigens in naturally infected dog uteruses by immunohistochemical and ELISA methods
İSMAİL BOLAT
Doktora
Türkçe
2022
Veteriner HekimliğiAtatürk ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAVUZ SELİM SAĞLAM