Molecular pathology and management of hemophilia a in Turkish families
Türk ailelerinde hemofili A hastalığının moleküler patolojisi ve kontrolü
- Tez No: 82987
- Danışmanlar: PROF. DR. SERVER HANDE ÇAĞLAYAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Hemofili A, Moleküler genetik, Mutasyon, Türk ailesi, Türk popülasyonu, Hemophilia A, Molecular genetic, Mutation, Turkish family, Turkish population
- Yıl: 1999
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
VI ÖZET Faktör VIII geni bugüne kadar tanımlanmış en büyük ve kompleks genlerden biridir. Hemofili A hastalığına sebep olan mutasy onların heterojen olması, klinik açıdan farklı fenotiplere yol açmaktadır. Hastalık populasyonda yeni mutasyonlann oluşumu ile devam etmektedir, dolayısıyla vakaların üçte biri sporadiktir. Türk hemofili A hastalarının moleküler patolojisini anlamak için 103 hastada denature edici gradyent gel elektroforezi (DGGE) ile mutasyon taraması yapılmıştır. Bu hastalardan 97' sinde akrabalık ilişkisi yoktur. Yapılan çalışma sonucunda 36 farklı hastanın mutasyonlan saptanmıştır. Mutasyonlann yapı-fonksiyon ve genotip-fenotip ilişkileri üzerindeki etkileri hastalığa yol açan mutasy onlar olduklarını doğrulamaktadır. Bu mutasy onlardan 21'i hemofili A veri bankasında yer almamaktadır. Ayrıca, hastalığa yol açmayan iki baz değişikliği de bulunmuştur. Mutasyonlann ve mutasyon tiplerinin cinsiyete bağlı oranlan hesaplanmış ve bu oranın erkek üreme hücrelerinde 4 kat fazla olduğu gösterilmiştir. Türk populasyonu mutasyon profilinin veri bankasındaki mutasyon profili ile karşılaştınlması sonucunda Türk populasyonunda nokta mutasyonlannm daha yüksek, büyük delesyonlann ise ender olduğu saptanmıştır. Türkiye'de hemofili A hastalığının önlenmesinde kullanılan güncel yöntemleri geliştirmek için“One-Step DGGE”olarak adlandırdığımız aileye özgü mutasyonlan kısa sürede saptamaya yönelik bir strateji uygulanmıştır. Intron 13 ve 22'de bulunan iki mikrosatelit tekran heterozigot oranını yükseltmek amacı ile kullanılmıştır. Bu iki polimorfik markörün Hind III RFLP ve St 14 VNTR markörleri ile birlikte kullanılması sonucunda Türk hemofili A ailelerinin yüzde 93 'üne moleküler tam verme olanağı sağlanmıştır. Seksensekiz bireye taşıyıcı tanısı ve 17 aileye doğum öncesi tam verilmiştir. Sonuç olarak, bu çalışma Türkiye'de hemofili A hastalığının moleküler patolojisinin aydınlatılması ve populasyondaki kontrolü için güncel moleküler yöntemlerin uygulanması ve geliştirilmesinde önemli bir rol oynamaktadır.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT Factor VIII (FVIII) gene is one of the largest and most complex genes characterized to date. Heterogeneous mutations in the gene cause hemophilia A with a mild to severe phenotype. The disease is maintained in the population by de novo, mutations; nearly one third of the cases being sporadic. To understand the molecular pathology of Turkish hemophilia A patients, 103 patients, out of which 97 were unrelated, were screened for mutations by denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). Mutations were detected in 36 unrelated patients. Structure-function and genotype- phenotype relationships confirmed that they were the causative mutations of hemophilia A in these patients. Twenty-one of the detected mutations have not been reported in the hemophilia A database. Two novel sequence changes were also identified. Male: female sex ratio of mutation (SRM) and mutation type-specific SRM were calculated. It was shown that mutations occur 4 times more frequently in male germ cells. The comparison of the mutation profile of the Turkish population with the mutation pattern in the database revealed a higher frequency of the point mutations and a much lower number of the large deletions. To improve the current approaches for the molecular management of hemophilia A in Turkish families, a“One-Step DGGE”strategy allowing the rapid identification of family-specific mutations was developed. Microsatellite repeats in introns 13 and 22 were utilized to increase the heterozygosity of females. The combined use of these two polymorphic markers with the Hind III RFLP and Stl4 VNTR markers facilitated molecular diagnosis in 93% of Turkish hemophilia A families. Carrier determinations were carried out on 88 females and 17 families were provided with prenatal diagnosis. In conclusion, this work has significant contributions to the understanding of the molecular pathology of hemophilia A and to the establishment and development of current molecular diagnostic methods for hemophilia A management in Turkey.
Benzer Tezler
- Mutational analysis of factor XI and von willebrand factor genes by high resolution melting analysis and direct DNA sequencing
Faktör XI ve von willebrand faktör genlerinin yüksek çözünürlüklü erime analizi ve doğrudan DNA dizilemesi ile mutasyon analizi
SUNAY USLUER
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
BiyolojiBoğaziçi ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. S. HANDE ÇAĞLAYAN
- Tükürük bezi tümörlerinin immünhistokimyasal sınıflandırması ve farklı immünhistokimyasal ve moleküler fenotipe sahip patolojisi aynı tümörlerde prognozun karşılaştırılması
The immunohistochemical classification of salivary gland tumors and comparing the prognosis of having same pathology and differrent immunohistochemical and different molecular phenotype tumors
MEHMET GÖCEK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Kulak Burun ve BoğazGazi ÜniversitesiKulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. UTKU AYDİL
PROF. DR. YUSUF KIZIL
- Papiller tiroid kanserinde next genereration sequencing(NGS) moleküler multiple varyant analizi, histopatolojik ve immunhistokimyasal bulguların değerlendirilmesi
Next generation sequence (NGS) molecular multiple variant analysis, evaluation of histopatological and immunhistochemical findings in papillary thyroid cancer
HASLET HÜNLER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
Moleküler TıpAydın Adnan Menderes ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM HALİL ERDOĞDU
- Primer mide adenokarsinomlarının immunohistokimya ve insitu hibridizasyon yöntemleri ile moleküler sınıflaması, TRK yolağının sınıflamadaki olası rolünün belirlenmesi, klinikopatolojik parametreler ile ilişkilerinin değerlendirilmesi
Molecular classification of gastric cancer based on immunohistochemistry and in-situ hybridization, determination of the role of tropomyosin receptor kinase (TRK) signaling pathway in gastric cancer classification and their association with clinicopathological parameters
MEDİNE ÖZGÜR GÜNAY
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
PatolojiMarmara ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÇİĞDEM ÇELİKEL
- Kolorektal adenokarsinomlarda mikrosatellit durumunun histopatolojik ve moleküler özelliklerle karşılaştırılması ve sağ kalıma etkisi
Comparison of histopathologic and molecular features of microsatellite status in colorectal adenocarcinomas and its effect on survival
BİLAL TUNÇTÜRK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2023
PatolojiDicle ÜniversitesiTıbbi Patoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ULAŞ ALABALIK