An investigation of AKR1B1 and AKR1B10 in gastrointestinal cancers
Gastrointestinal kanserlerde AKR1B1'in ve AKR1B10'un incelenmesi
- Tez No: 831416
- Danışmanlar: PROF. DR. SREEPARNA BANERJEE
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 157
Özet
Aldo-keto redüktazlar (AKR'ler), NADPH'den gelen elektronları kullanarak birçok substratı indirgeyebilen geniş bir oksidoredüktaz ailesidir. AKR1B1 ve AKR1B10, sırasıyla poliol yolundaki ve detoksifikasyon reaksiyonlarındaki rolleri nedeniyle kapsamlı olarak incelenen insan AKR'leri arasındadır. Önceki çalışmamız, AKR1B1'in ve AKR1B10'un kolorektal kanserde farklı etkilere sahip olduğunu göstermiştir. Bu çalışmada, hastalardan alınan kolon ve rektum kanser örnekleri kullanılarak, AKR1B1 ifadesinin mezenkimal fenotip ve kötü prognoz ile ilişkili olduğu gösterilmiştir. AKR1B10 ifadesinin ise metabolik yolakların aktivasyonu ile ilişkili olduğu gösterilmiştir. Ayrıca birbirinden farklı metabolik özelliklere ve düşük endojen ifadesine sahip hepatosellüler karsinom (HCC) hücre hatları kullanılarak, AKR1B10'un metabolik olarak yeniden programlanma üzerindeki etkisi gözlemlenmiştir. Glikolize bağımlı bir hücre hattı olan SNU423, AKR1B10 ifadesi ile yağ asiti sentez sinyalleri ve reaktif oksijen türlerinde artış göstermiştir. Oksidatif olan HuH-7 hücre hattı ise, AKR1B10 ifadesi ile özellikle glikoz ve glutamin çekildiğinde, hücre ölümü ve besin sensörü olan AMPK aktivasyonu göstermiştir. AKR1B10 ifadeleyen HuH-7 hücreleri, glikoz ve glutamin açlığında, ilk defa yapılan metabolomiks çalışmasında hücre devamlılığı için olası bir şekilde artan glukoneogenez göstermiştir. Ayrıca zayıf enerji durumunun bir göstergesi olarak yavaş bir trikarboksilik asit döngüsü göstermiştir. Metabolik olarak yeniden programlama ve invazyon ile metastazın aktivasyonu kanserin başlıca özellikleri arasında nitelendirilmiştir. Genel olarak bu veriler, AKR'lerin hem metastatik yayılım artışında hem de metabolik yolakların düzensizleşmesinde kritik roller üstlenebiliceğini gösterirken, gastrointestinal kanserlerde kötü prognoz ilişkisi için mekanistik bir temel sağlayabilir.
Özet (Çeviri)
Aldo-keto reductases (AKRs) are a large family of oxidoreductases that can utilize electrons from NADPH to reduce many substrates. AKR1B1 and AKR1B10 are among the extensively studied human AKRs due to their roles in the polyol pathway and detoxification reactions, respectively. Our previous research has shown that AKR1B1 and AKR1B10 have diverse effects on colorectal cancer. Using ex vivo samples from colon and rectal tumor patients, I have shown that AKR1B1 expression was associated with a stronger mesenchymal phenotype and worse prognosis, while AKR1B10 expression was associated with the activation of metabolic pathways. Next, using hepatocellular carcinoma (HCC) cell lines with differing metabolic characteristics and low endogenous AKR1B10 expression, I aimed to understand the effect of AKR1B10 on metabolic reprogramming. Forced expression of AKR1B10 in the glycolytic cell line SNU423 activated signaling suggesting enhanced fatty acid synthesis and generation of reactive oxygen species. Overexpression of AKR1B10 in the oxidative cell line HuH-7 resulted in low viability and activation of the nutrient sensor AMPK, especially when glucose and glutamine were withdrawn. Untargeted metabolomics of glucose/glutamine starved AKR1B10 expressing HuH-7 revealed for the first time enhanced gluconeogenesis, most likely for biomass generation and a slower TCA cycle, reflecting poor energetics. Metabolic reprogramming and activation of invasion and metastasis are considered among the major hallmarks of cancer. Overall, my data suggests that AKRs may play critical roles in enhancing both metastatic spread and deregulated metabolism, providing a mechanistic basis for their association with poor prognosis in gastrointestinal cancers.
Benzer Tezler
- Birecik bölgesindeki koyunlarda bakır, çinko ve demir seviyelerinin araştırlması
An investigation of blood iron, copper and zinc levels in sheep at region of Birecik
MUSTAFA ŞAHİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
Veteriner HekimliğiHarran Üniversitesiİç Hastalıkları (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. GÜRBÜZ AKSOY
YRD. DOÇ. DR. GÜZİN ÖZKURT
- Samsun organize sanayi bölgesinde hava kalite parametrelerinin izlenmesi ve meteorolojik parametrelerle ilişkilerinin incelenmesi
An investigation of the relationshios with meteorological parameters and monitoring of air quality parameters in organized industrial region of samsun
ANDAÇ AKDEMİR
Doktora
Türkçe
2007
Çevre MühendisliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. OSMAN NURİ ERGUN
- 7 - 19 yaş aile rehberliği eğitimi programının annelerin aile tutumlarına etkisinin incelenmesi
An investigation of the effect of 7 - 19 age family guidance program on the mothers family attitudes
AHMET BAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Eğitim ve ÖğretimMevlana ÜniversitesiRehberlik ve Psikolojik Danışmanlık Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AHMET BEDEL
- Aydın kenti örneğinde gençlik parkı çocuk oyun alanının yeterliliği ve tasarım ilkeleri yönünden incelenmesi
An investigation of the youth park playground in terms of adequacy and design principles: The case of Aydın city
SEVDANUR BALLIOĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Peyzaj MimarlığıKaradeniz Teknik ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖNER DEMİREL
DOÇ. DR. ZÖHRE POLAT
- Rehberlik ve psikolojik danışma öğrencilerinin özduyarlık ve mükemmeliyetçilikleri arasındaki ilişkinin incelenmesi
An investigation of relation between self compassion and perfectionism among psychological guidence and counseling students
HATİCE TEZCAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Eğitim ve ÖğretimMarmara ÜniversitesiEğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. MUSTAFA OTRAR