Investigation of PVRIG as a potential target of LRBA
LRBA'nın potansiyel bir hedefi olarak PVRIG'in incelenmesi
- Tez No: 832219
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET BATU ERMAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Allerji ve İmmünoloji, Biyoloji, Allergy and Immunology, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Boğaziçi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 111
Özet
Yeni T hücresi ko-inhibitörlerinin tespiti ve hücre içi regülasyonlarına yönelik mekanizmaların belirlenmesi, yeni immün kontrol noktası engelleme terapilerinin geliştirilmesi açısından büyük önem taşımaktadır. LRBA, kritik bir T hücresi ko-inhibitör reseptörü olan CTLA-4'ün hücre yüzeyine trafiğinin düzenleyicisi olarak önemli bir rol oynamaktadır. LRBA, internalize olmuş CTLA-4'ü hücre yüzeyine geri yönlendirerek ve lizozomal degradasyonunu engelleyerek immün homeostazı sürdürmekte ve otoimmüniteyi önlemektedir. Bugüne kadar, LRBA'nın CTLA-4 dışında diğer T hücresi ko-reseptör hedefleri belirlenmemiştir. Laboratuvarımızdaki önceki çalışmalarda, PVRIG adlı yeni bir T hücresi ko-inhibitör reseptörünün, LRBA geni silinmiş Jurkat T hücresi yüzeyinde belirgin bir şekilde düşük seviyede olduğu tespit edilmiştir. Bu tez çalışmasında, LRBA'nın CTLA-4'ü düzenlediği mekanizmalar gibi, PVRIG'i de benzer şekilde düzenleyip düzenlemediğini daha ayrıntılı olarak araştırmayı amaçladık. Bu amaçla, endojen PVRIG ve LRBA proteinlerinin fiziksel etkileşimini incelemek için ko-immünopresipitasyon deneyleri gerçekleştirdik. Ayrıca, LRBA'nın CTLA-4 ile bağlantı kurabilen PH-BEACH bölgesiyle PVRIG'e bağlanıp bağlanamayacağını anlamaya çalıştık. LRBA'nın Flag etiketli PH-BEACH bölgesinin, c-Myc/His etiketli tam uzunluklu PVRIG, kuyruksuz PVRIG ve sadece kuyruklu PVRIG yapısıyla birlikte ko-immünopresipite edilebildiğini gösterdik. Ancak, ko-immünopresipitasyon sonuçlarının spesifikliğini tam olarak doğrulayamadık. PVRIG ve LRBA arasındaki bağlanmanın başka tekniklerle araştırılmasına ihtiyaç vardır. Ayrıca, PVRIG proteininin glikolizasyona uğrayabildiğini gösterdik. Bu, PVRIG'in hücre içindeki genel fonksiyonu üzerinde etkili bir faktör olabilir. Bu çalışma, PVRIG'in LRBA tarafından regülasyonuna yönelik değerli bilgiler sağlamaktadır.
Özet (Çeviri)
Identifying novel T-cell co-inhibitors and the mechanism of their regulation is of great importance for the development of novel immune checkpoint blockade therapies. LRBA is a key surface trafficking regulator of CTLA-4, which is a crucial T-cell co-inhibitory receptor. LRBA maintains immune homeostasis and prevents autoimmunity by directing internalized CTLA-4 back to the cell surface and preventing its lysosomal degradation. To date, the role of LRBA in the regulation of other T-cell co-receptors besides CTLA-4 have not been identified. In previous studies in our laboratory, a novel T-cell co-inhibitory receptor, PVRIG was found to be significantly downregulated on the surface of LRBA knockout Jurkat T-cells. In this thesis, we aimed to investigate this finding in more detail to find out whether LRBA regulates PVRIG through similar mechanisms as it regulates CTLA-4. To this end, we performed several co-immunoprecipitation experiments to investigate the physical interaction between endogenous PVRIG and LRBA proteins. In addition, we tried to understand whether LRBA could bind to PVRIG with its PH-BEACH domain, which is sufficient for CTLA-4 binding. We showed that the Flag-tagged PH-BEACH domain of LRBA co-immunoprecipitated with various constructs of PVRIG, including full length PVRIG, Tailless PVRIG, and TM-Tail PVRIG, all carrying c-Myc/His epitope tags. However, we could not fully confirm the specificity of these co-immunoprecipitation results. Therefore, there is a need for further investigation of the PVRIG and LRBA interaction using additional techniques. We also showed that PVRIG protein can undergo glycosylation, which may have implications on its overall function. This study adds valuable insights towards the regulation of PVRIG by LRBA.
Benzer Tezler
- Sıvı tedavisinde hastaya verilen pozisyonun santral venöz basınç ?y? dalgası değerine olan etkisinin araştırılması
Investigation of effects of patients? position on central venous pressure?s ?y? wave value during the fluid therapy
FATMA KOÇYİĞİT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2009
Anestezi ve ReanimasyonFırat ÜniversitesiAnesteziyoloji ve Reanimasyon Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET AKİF YAŞAR
- Terkos havzasında tuzlu su girişimlerinin geçici elektromanyetik ve doğru akım özdirenç yöntemleriyle araştırılması
Investigation of saltwater intrusion in terkos basin using transient electromagnetic and direct current resistivity methods
AYÇA SULTAN ARDALI
Doktora
Türkçe
2014
Jeofizik Mühendisliğiİstanbul ÜniversitesiJeofizik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYSAN GÜRER
- Sıçan dalağında marjinal bölge makrofajlarının incelenmesi (ışık mikroskobu, enzimhistokimya gösterimleri)
Investigation of marginal zone macrophages at rat spleen (light microscopy, enzyme-histochemistry demonstrations)
DENİZ ERGENECİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1996
Histoloji ve EmbriyolojiAnkara ÜniversitesiHistoloji ve Embriyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NURŞEN SAYIN
- Deri ve yumuşak doku enfeksiyonu etkeni olan toplum ve hastane kaynaklı staphylococcus aureus izolatlarının antimikrobiyal duyarlılık durumlarının ve panton valentıne leukocıdın toksini sıklığının araştırılması
Investigation of panton valentine leukocidin toxin frequency and antimicrobial susceptibilities of community and hospital acquired staphylococcus aureus isolates related with skin and soft tissue infections
TÜLİN DEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. NİLAY ÇÖPLÜ
- Alloksan ile diyabet oluşturulmuş tavşanlarda resveratrolün endotel fonksiyonu üzerine etkisinin incelenmesi
Investigation of resveratrol on endothelial function in alloxan-induced diabetic rabbits
MEHMET BİLGEHAN PEKTAŞ