Evaluating the Interaction of Appendiceal Adenocarcinoma and the Immune Microenvironment
Apendiks Kanserinin İmmün Mikroçevresiyle Etkileşiminin İncelenmesi
- Tez No: 832478
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. JOHN PAUL SHEN, PROF. DR. Jonathan Sleeman
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Onkoloji, Moleküler Tıp, Oncology, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Adenokarsinom, Apendiks, Dizi analizi-RNA, Genom bilimi, Nadir hastalıklar, Omik veri, Periton hastalıkları, RNA dizileme, Transkriptomlar, İmmünoterapi, Adenocarcinoma, Appendix, Sequence analysis-RNA, Genomics, Rare diseases, Omics data, Peritoneal diseases, RNA sequencing, Transcriptomics, Immunotherapy
- Yıl: 2023
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Ruprecht-Karls-Unıversıtat-Heıdelberg
- Enstitü: Yurtdışı Enstitü
- Ana Bilim Dalı: Tıp Bilimleri Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Translasyonel Onkoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Apendiks adenokarsinomu (AA), kolorektal kansere (KRK) kıyasla farklı klinik ve biyolojik özelliklere sahip nadir bir malignitedir. Erken evre AA cerrahi olarak tedavi edilirken, metastatik hastalık genellikle sitoredüktif cerrahi ve adjuvan kemoterapi ile KRK gibi yönetilir. Bununla birlikte, önceki çalışmalar AA'nın benzersiz mutasyonel profilini ve KRK kemoterapisine zayıf yanıt verdiğini ortaya koymuştur. Bu çalışmada, tek hücre RNA dizilemesi, 3 AA hastasından alınan örnekler üzerinde AA'nın tümör içi heterojenitesini karakterize etmek için ilk kez kullanıldı. 45.682 tekil hücrenin analizi immün, stromal ve epitelyal hücreler olmak üzere üç ana kompartmanı ortaya çıkarmıştır. Daha ileri incelemeler immün mikroçevrenin beş ana immün hücre grubundan oluştuğunu göstermiştir: T hücreleri, B hücreleri, plazma B hücreleri, miyeloid hücreler ve mast hücreleri. Ortalama olarak, AA %57 stroma, %41 immün ve sadece %2 epitel hücrelerinden oluşurken, sağlıklı apendiks %73 immün, %29 epitel ve %25 stromal hücrelerden oluşuyordu. Bu diferansiyel kompozisyon, apendiks adenokarsinomunun sağlıklı apendikse kıyasla nispeten daha fazla epitelyal ve stromal hücreye sahip olduğunu gösteren toplu RNA dizilimli örneklerden oluşan bağımsız bir kohortta doğrulanmıştır. Ayrıca, tedaviye yanıtta rol oynayan moleküler ve biyolojik süreçleri daha iyi anlamak için apendiks adenokarsinomu üzerinde ilk kez pozitif tedavi yanıtı alınan klinik çalışmanın immünoterapi öncesi ve sonrası toplu RNA dizilimi sonuçları analiz edilmiştir. AA'nın mutasyonel heterojenitesinin, diferansiyel tümör mikroçevresi kompozisyonunun ve immünojenitesinin tek hücre dizilimi gibi tekniklerle daha fazla analiz edilmesi, özel yönetim yaklaşımlarının geliştirilmesi ve hasta sonuçlarının iyileştirilmesi için kritik öneme sahiptir. Bu çalışmadan elde edilen bulgular, AA'nın KRK'dan biyolojik farklılıkları hakkında yeni bilgiler sağlamakta ve bu nadir tümörün daha iyi anlaşılmasına yönelik önemli bir adımı temsil etmektedir.
Özet (Çeviri)
Appendiceal adenocarcinoma (AA) is a rare malignancy with distinct clinical and biological characteristics compared to colorectal cancer (CRC). While early-stage AA is treated surgically, metastatic disease is often managed like CRC, with cytoreductive surgery and adjuvant chemotherapy. However, previous studies revealed AA's unique mutational landscape and poor response to CRC chemotherapy. In this study, single cell RNA sequencing was performed for the first time on samples from 3 AA patients to characterize intratumor heterogeneity. Analysis of 45,682 single cells revealed three major compartments - immune, stromal, and epithelial cells. Further examination showed the immune microenvironment comprised five major immune cell groups: T cells, B cells, plasma B cells, myeloid cells, and mast cells. On average, AA constituted 57% stroma, 41% immune and only 2% epithelial cells, whereas healthy appendix comprised 73% immune, 29% epithelial, and 25% stromal cells. This differential composition was validated in an independent cohort of bulk RNA-sequenced samples, which showed appendiceal adenocarcinoma had relatively more epithelial and stromal cells compared to healthy appendix. Also, analysis of pre and post-immunotherapy results of first time ever positive clinical trial conducted on appendiceal adenocarcinoma were analyzed to better understand molecular and biological processes plays a role in treatment response. Further analysis of AA's mutational heterogeneity, differential tumor microenvironment composition, and immunogenicity through techniques like single cell sequencing is critical to develop specialized management approaches and improve patient outcomes. Findings from this study provide new insights into AA's biological distinctions from CRC and represent a crucial step toward better understanding this rare malignancy.
Benzer Tezler
- İzmir'de bazı yolların kapatılarak yaya bölgeleri oluşturma da kent peyzajını geliştirme açısından yeniden planlanması üzerinde araştırmalar
Başlık çevirisi yok
BAHAR TÜRKYILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1985
Şehircilik ve Bölge PlanlamaEge ÜniversitesiŞehir ve Bölge Planlama Ana Bilim Dalı
- İsmayıl Hakkı Baltacıoğlu'nun kültür ve eğitim kavramı üzerine bir inceleme
An Examination of the concepts of culture and education of Ismayıl Hakkı Baltacıoğlu
ABDULLAH DİKİCİ
Doktora
Türkçe
1986
Eğitim ve ÖğretimUludağ ÜniversitesiEğitim Bilimleri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SUAT ANAR
- Gebelik ve doğum olgularında prolaktin düzeylerinin değerlendirilmesi
The Evaluation of prolactin values during pregnancy labour and in deliveries
TÜLİN AKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1987
Kadın Hastalıkları ve DoğumGazi ÜniversitesiKadın Hastalıkları ve Doğum Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. MÜLAZIM YILDIRIM
- Yenileme yatırımları
Başlık çevirisi yok
OSMAN NURİ FİLİZ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
İşletmeGazi ÜniversitesiEndüstri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OSMAN OKKA