Geri Dön

Molecular and immunological studies of respiratory syncytial virus among Iraqi pediatric patients

Iraklı pediatrik hastalarda solunum sinsityal virüsünün molekülar ve immünolojik çalışmaları

PDF İndir

  1. Tez No: 836909
  2. Yazar: NOOR MOHAMMED HANOON
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. IRMAK POLAT, DR. ÖĞR. ÜYESİ RANA ADEL HANOON
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Çankırı Karatekin Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 81

Özet

Pediatrik akut solunum enfeksiyonları (ASE), pediatrik morbidite ve mortalitenin önemli bir küresel kaynağıdır. Pediatrik akut solunum enfeksiyonları alt solunum yolu (ALT) ve üst solunum yolu (ÜST) enfeksiyonları olarak ayrılabilir. ÜST, şunları içerir: Larenjit, otitis media, sinüzit, kulak enfeksiyonları, soğuk algınlığı (rinotit) ve farenjit. ALT, bronşit ve pnömoni UST enfeksiyonlarının ALT enfeksiyonlarına bulaşması sonucu ortaya çıkabilir. Virüsler (ALTİ) büyük çoğunluğunun başlıca nedenidir, bunlar vakaların yaklaşık %40'ında tespit edilir. İnsan solunum sincytial virüsü (hRSV), bebeklerde şiddetli alt solunum yolu enfeksiyonunun özellikle yaygın bir kaynağıdır ve beş yaşın altındaki çocuklar arasında ALTİ'ler nedeniyle gelişmekte olan ülkelerde 3,4 milyon hastane yatışını hesaba katarak 3,4 milyon hastane yatışını hesaplamaktadır. hRSV'nin semptomları rinore, hapşırma, hafif ateş ve öksürüktür. Viral parçacık, 15,2 kb toplam uzunluğa sahip negatif sense RNA genomu (-ssRNA) olan bir yapıya sahiptir. Üç yüzey glikoproteini bulunur: füzyon protein F, bağlama protein G ve son glikoprotein olan küçük hidrofobik protein SH. hRSV, RSV (G) ile ilişkilendirilen dizi tabanlı özelliklere bağlı olarak RSV-A ve RSV-B olmak üzere 2 farklı kategoriye veya alt türe ayrılır. Bu çalışma, 62 erkek ve 38 dişi olmak üzere 5 yaşın altındaki 100 bebek ve çocuk üzerinde yürütüldü ve kontrol grubu 20 kişiden (14 erkek ve 6 dişi) oluşuyordu. Bu çalışmada katılımcılardan iki nazofaringeal sürüntü alındı. Ayrıca, immünolojik çalışmalar için üç mililitre kan toplandı. Klinik örneklerden viral RNA ekstraksiyonu otomatik bir makine ile gerçekleştirildi. Bundan sonra tüm klinik örnekler için tek adımlı gerçek zamanlı PCR yapıldı. Cinsiyete göre klinik örneklerin demografik dağılımı, %38 kadın ve %62 erkek (5'e karşı 17) olarak bulundu. En yaygın üç belirti ve semptom ateş (%85), rinore (%72) ve hırıltı (%66) idi. RNA otomatik ekstraksiyonu için, CT değeri 33'ten küçük olan tüm test edilen örneklerden elde edilen tüm eğrilerin görünüşü, verimli bir RNA ekstraksiyon yöntemi ve RT-PCR işleminin başarısını gösterir. Sonuçlar, hRSV enfeksiyon oranının %22 (100'den 22) olduğunu gösterdi, diğer %78 ise diğer solunum yolu enfeksiyonu ile ilişkilendirilen patojenler olarak kabul edildi, böylece diğer virüsler ve bakteriler dahil edildi. Genotipe göre, tip B hRSV, alt grup (12'ye karşı 10) olarak daha fazladır. Yaş grubu 1-6 aydaki pozitif örnek sayısı, 22'den 14'ü (%63,6) ile en yüksek sayıya sahiptir ve bu, 6-12 ay ve > 12 ay yaş gruplarıyla karşılaştırıldığında daha fazladır (her biri için 4). hRSV pozitifliği daha yüksek oranda pnömoni geçiren hastalarda gözlenmiştir (%59,09, 22'den 13), buna bronşiyolit (%31,81, 22'den 7) ve diğer göğüs enfeksiyonları (%9,09, 22'den 2) izlemektedir. Bu risk faktörlerinin etkileri istatistiksel olarak anlamlı değildi (p>0,05). T helper Th-1 fenotiplerinden (IFN-γ) koruyucu bir aracı olarak ve IL-8'i zararlı bir aracı olarak serum sitokin seviyelerini tespit etmek için katılımcılardan 22 pozitif bebek ve genç çocuk için katı bir sandviç ELISA testi uygulandı (17 erkek ve 5 dişi). IL-8 seviyesi, hRSV'li hastalarda kontrol grubuna kıyasla anlamlı bir şekilde artmıştır (p

Özet (Çeviri)

Pediatric acute respiratory infections (ARI) are a substantial global source of pediatric morbidity and mortality. Pediatric acute respiratory infections can be divided into lower (LRT) and upper (URT) respiratory tract infections. URT includes: Laryngitis, otitis media, sinusitis, ear infections, Common colds (rhinitis), and pharyngitis. LRT includes: Bronchitis and pneumonia can result from the transmission of URT infections to LRT. Viruses are the primary cause of the great majority of (LRTI), they are approximately detected in 40% of cases. Human respiratory syncytial virus (hRSV) is a particularly prevalent source of severe lower respiratory infection in newborns, accounting for 3.4 million hospital admissions in developing countries for LRTIs among children under the age of five. The symptoms of hRSV include rhinorrhea, sneezing, low-grade fever and cough. The viral particle is a non-segmented, negatively sense RNA genomic (-ssRNA) with a total length of 15.2 kb. It has three surface glycoproteins: fusion protein F, attachment protein G, and the last glycoprotein, small hydrophobic protein SH. hRSV is separated into 2 distinct categories or subtypes, RSV-A and RSV-B, dependent on sequence-based characteristics associated with RSV (G). This study was conducted on 100 infants and children under 5 years with 62 males and 38 females, and the control group was 20 (14 males and 6 females). Two nasopharengeal swaps were taken from participants in this study. Besides, three milliliters of blood were collected for immunological studies. Viral RNA Extraction from clinical samples were done by automated machine. After that one step real time PCR was done for all clinical samples. The demographic distribution of clinical samples regarding gender was 38% female and 62% male (5 vs17). The most three common signs and symptoms were fever (85%), rhinorhoea (72%), and wheezing (66%). For RNA automated extraction, the appearance of all curves from all tested samples for automated RNA extraction with CT less than 33 indicates efficient RNA extraction method and success of RT-PCR process. The results showed that infection rate with hRSV was 22% (22 out of 100), other 78% considered as other respiratory tract infection related pathogens such as other virus and bacteria. According to genotype, type B hRSV is more than a subgroub (12 vs 10). The number of positive samples in the age group 1-6 months showed the highest number 14 out of 22 (63.6%) compared to age groups 6-12 and > 12 months (4 for each). Higher percent of hRSV positivity observed in patients who had pneumonia 59.09% (13 out of 22), followed by bronchiolitis 31.81% (7 out of 22) and other chest infections 9.09% (2 out of 22). The effects of these risk factors were statistically non significant (P>0.05). The solid sandwich ELISA assay was performed for the detecting the serum levels of cytokines from the T helper Th-1 phenotypes (IFN-γ) as a protective mediator and IL-8 as a deleterious mediator in 22 positively infants and young children with hRSV infection (17 male and 5 female). The level of IL-8 was increased significantly (p

Benzer Tezler

  1. Tez No

    803106

    Irak'ta SARS-COV-2'nin moleküler ve immünolojik özelliklerinin belirlenmesi

    Molecular and immunological study of SARS-COV-2 in Iraq

    TAISIR ALI YASIR ALBOHWALA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MELDA DÖLARSLAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ AMRAN MEZHER LAWAS

  2. Tez No

    634908

    Astım hastalarında genetik yatkınlık, duyarlılık ve oksidatif stres göstergelerinin moleküler analizi

    Molecular analysis of genetic susceptibility, sensitivity and oxidative stress markers in asthma patients

    BEHNAZ KARADOĞAN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2020

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİNE ŞEKÜRE NAZLI ARDA

    PROF. DR. ASLI GELİNCİK

  3. Tez No

    612018

    Differential expression of proteins in active and inactive phases of Behçet's syndrome

    Behçet sendromunun aktif ve inaktif fazlarında farklı protein ekspresyonları

    KIYMET ASLI KİREÇTEPE AYDIN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    Moleküler Tıpİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI

  4. Tez No

    776518

    Generation of plasmid-based eukaryotic model to investigate biology of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus nucleoprotein and glycoproteins

    Kırım Kongo kanamalı ateşi virüsü nükleoproteinin ve glikoproteinlerinin biyolojisinin çalışılmasında plazmit temelli ökaryotik model oluşturulması

    NESİBE SELMA ÇETİN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    BiyoteknolojiBezm-i Alem Vakıf Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET ZİYA DOYMAZ

  5. Tez No

    539176

    Bronşiolitis obliteranslı çocuklarda serum total oksidan ve antioksidan durumun değerlendirilmesi

    Evaluation of serum total oxidants and antioxidant stability in children with bronchiolithis obliterans

    GÜLSÜM GÜZEL

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıBezm-i Alem Vakıf Üniversitesi

    Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ERKAN ÇAKIR

Geri Dön