Geri Dön

Karbapenem dirençli enterobacteriaceae izolatlarında karbapenem direnç genlerinin Genexpert Carba Paneli ile değerlendirilmesi

Evaluation of carbapenem resistance genes in carbapenem-resistantenterobacteriaceae isolates with Genexpert Carba Panel

PDF İndir

  1. Tez No: 844298
  2. Yazar: CANAN DİZİLİ YELGİN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. HALİL YAZGI, DOÇ. DR. BARIŞ GÜLHAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Enterobacteriaceae, Genexpert Carba-R cihazı, Karbapenem direnci, Karbapenemazlar, Enterobacteriaceae, GeneXpert Carba device, Carbapenem resistance, Carbapenemases
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Atatürk Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 97

Özet

Amaç: Antibiyotiklere direnç tüm dünyanın önde gelen problemlerinden biridir. Direncin önlenmesi için atılacak en önemli adım direncin takip edilmesidir. Takibin kentsel, bölgesel, evrensel yapılması direnç yayılımının daha iyi anlaşılmasına olanak sağlayacaktır. Bu çalışma ile global bir sorun haline gelen antibiyotik direncine karşı verilen savaşta bölgesel veriler elde etmek hem literatüre katkı sağlamak hem de bölgemizde aktif olarak faaliyet gösteren sürveyans birimi, enfeksiyon kontrol komitesi birimi ve hekimlerimizin ampirik tedavi seçimlerine yol gösterici sonuçlara ulaşmak hedeflenmektedir. Materyal Metot: Erzincan Mengücek Gazi Eğitim Araştırma Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'nda izole edilen karbapenem dirençli 120 Enterobacteriaceae izolatı çalışmaya dahil edildi. Karbapenem direnci ve tür idendifikasyonu için MALDİ-TOF MS ve VİTEK 2 (bioMeriux, Fransa) otomatize sistemi ile yapıldı. Karbapenem direnç geni tespiti için moleküler yöntem tabanlı Genexpert Carba-R cihazında çalışıdı. Elde edilen sonuçlarla direnç genleri ve antimikrobiyal direnç durumları değerlendirildi. Bulgular: Çalışmaya dahil edilen 120 izolatın 44'ü (%36,7) dahili servislerde, 15'i (%12,5) polikliniklerde 51'i (%50,8) yoğun bakımlarda bulunan hastalardan gelen örneklerden izole edilmiştir. Enterobacteriaceae türlerinde karbapenemaz direnç̧ genlerinin dağılımında ise; izolatların 17'sinde (%14,2) tek başına KPC, üç (%2,5) OXA-48+ KPC, beş (%4,2) NDM, iki (%1,7) VIM, bir (%0,8) VIM+KPC, dört (%3,3) VIM+ OXA-48+ KPC, 78' (%65,0) OXA-48 olarak tespit edilmiştir. Sonuç: Bu çalışmada elde edilen epidemiyolojik sonuçların hastanemiz ve ülkemiz verilerine katkı sağlayacağı düşünülmektedir. Karbapenem dirençli Enterobacteriaceae izolatlarında tespit edilen karbapenemaz genleri horizontal yayılımın önlenmesinde, gen profiline bakarak tedavi planlamada aynı zamanda hastane temelli politikaların oluşmasında yol gösterici olacaktır.

Özet (Çeviri)

Aim: Resistance to antibiotics is one of the foremost global problems. The most crucial step in preventing resistance is monitoring. Conducting monitoring on urban, regional, and universal scales will provide a better understanding of the spread of resistance. With this study, the aim is to obtain regional data in the battle against antibiotic resistance, which has become a global issue. This effort not only contributes to the literature but also aims to guide the empirical treatment choices of our surveillance units, infection control committees, and physicians actively operating in our region. Materials and Methods: The study included the isolation of 120 carbapenem-resistant Enterobacteriaceae strains. MALDI-TOF MS and VITEK 2 automated systems were employed for carbapenem resistance and species identification. The Genexpert Carba-R PCR-based system was used for carbapenem resistance gene detection. The obtained results were analyzed to evaluate resistance genes and antimicrobial resistance profiles. Results: Among the 120 isolates included in the study, 44 (36.7%) were from internal services, 15 (12.5%) from clinics, and 51 (50.8%) from intensive care units. Regarding the distribution of carbapenemase resistance genes in Enterobacteriaceae isolates, 17 (14.2%) were identified with KPC, 3 (2.5%) with OXA-48 and KPC, 5 (4.2%) with NDM, 2 (1.7%) with VIM, 1 (0.8%) with VIM and KPC, and 4 (3.3%) with VIM, OXA-48, KPC. Moreover, 78 (65.0%) isolates were identified with OXA-48 alone. Conclusion: The epidemiological findings from this study are anticipated to contribute to our hospital and country-specific data. Detection of carbapenemase genes in carbapenem-resistant Enterobacteriaceae isolates can guide treatment planning, prevent horizontal spread, and influence the development of hospital-based policies. This regional approach is essential in the ongoing global battle against antibiotic resistance.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    474578

    Karbapenem dirençli klebsıella pneumonıae ve escherıchıa colı suşlarında blaOXA-48, blaKPC, blaIMP, blaVIM ve blaNDM direnç genlerinin araştırılması

    Investigation of blaOXA-48, blaKPC, blaIMP, blaVIM ve blaNDM resistance genes on carbapenem resistant klebsiella pneumoniae and escherichia coli strains

    AYLİN ÜSKÜDAR GÜÇLÜ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıSağlık Bilimleri Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET BAYSALLAR

  2. Tez No

    810815

    Karbapenem dirençli enterobacteriaceae ilişkili kan dolaşımı infeksiyonlarının moleküler epidemiyolojisi ve risk faktörlerinin değerlendirilmesi

    Evaluation of molecular epidemiology and risk factors of carbapenem resistant enterobacteriaceae associated bloodstream infections

    EMİNE COŞKUN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıPamukkale Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SUNA SEÇİL ÖZTÜRK DENİZ

  3. Tez No

    765944

    Karaciğer nakli yapılan hastaların kan kültüründe üreyen karbapenem dirençli enterobacteriacea suşlarında fosfomisin duyarlılığı ve fosfomisin direnç genlerinin araştırılması

    Investigation of phosphomycin sensitivity and phosphomycin resistance genes in carbapenem-resistant enterobacteriacea strains in the blood culture of liver transplant patients

    YAKUP GEZER

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıklarıİnönü Üniversitesi

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon Hastalıkları Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAŞAR BAYINDIR

  4. Tez No

    665398

    Klinik örneklerden izole edilen enterobacteriaceae izolatlarında plazmid aracılı kolistin direncinin moleküler yöntemler ile araştırılması

    Investigation of plasmid mediated colistin resistance by molecular methods in enterobacteriaceae isolates isolated from clinical samples

    TOLGA TOROL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    Eczacılık ve FarmakolojiMersin Üniversitesi

    Farmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ MAHMUT ÜLGER

  5. Tez No

    862740

    Enterobacterıaceae izolatlarında karbapenem heterodirencinin araştırılması

    Investigation of carbapenem heteroresistance in enterobacteriaceae isolats

    SARE KAYA DAŞTAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    MikrobiyolojiOndokuz Mayıs Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. YELİZ TANRIVERDİ ÇAYCI

Geri Dön