Geri Dön

Aspergilloz etkenlerinde azol direncinin gradient test ve agar plak yöntemleriyle araştırılması

Investigation of azol resistance in Aspergillosis caused by gradient test and agar plaque methods

PDF İndir

  1. Tez No: 845132
  2. Yazar: ZEYNEP YAZGAN
  3. Danışmanlar: PROF. DR. REYHAN ÇALIŞKAN, PROF. DR. GÖKHAN AYGÜN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Aspergillus, agar plak, azol direnci, cyp51A, cypA-L98H, cypA-M220, Aspergillus, agar plate, azole resistance, cyp51A, cypA-L98H, cypA-M220
  7. Yıl: 2023
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: İstanbul Aydın Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 180

Özet

Amaç: İnvaziv fungal enfeksiyonlar özellikle immün sistemi baskılanmış hastalarda morbidite ve mortalite açısından ciddi bir tehdittir. En sık izole edilen etkenler Aspergillus cinsi mantarlar olup, tedavide ilk tercih azollere duyarlılık azalmaktadır. Çalışmamızda, Aspergillus spp. türlerinde azol direncinin belirlenmesinde agar plak tarama yönteminin hızlı, kolay ve pratik bir yöntem olarak kullanımının araştırılması amaçlanmıştır. Yöntemler: Çalışmamız; çeşitli klinik örneklerden üretilen 125 Aspergillus spp. izolatıyla yürütülmüştür. Aspergillus spp. izolatları konvansiyonel yöntemlerle tür tanımı yapılarak, gradient test ve agar plak tarama yöntemiyle azol direnci belirlenmiştir. Dirençli izolatlarda broth mikrodilüsyon yöntemi uygulanmış, cyp51A geninde CypA-L98H ve CypA-M220 mutasyonları araştırılmıştır. Bulgular: Çalışmamızda 55 A.fumigatus(%44), 42 A.flavus(%33,6), 6 A.terreus(%5), 4 A.niger(%3), 18 Aspergillus spp.(%14) tanımlanmıştır. Gradient test yöntemiyle; A.fumigatus izolatlarından 1'inde(%1,8) VOR, POS'e, 3'ünde(%5,45) ITR'e direnç saptanmıştır. A.terreus izolatlarından 1'inde(%16,7) VOR-MİK 1µg/ml, A.niger izolatlarından 1'inde(%25) ITR-MİK 2µg/ml, Aspergillus spp. izolatlarından 1'inde(%5,6) ITR-MİK 4µg/ml, 2'sinde(%11) VOR-MİK ve POS-MİK sırasıyla 1,5µg/ml, >32µg/ml ve 0,5µg/ml, 8µg/ml saptanmıştır. Agar plak yöntemiyle; A.fumigatus izolatlarından 1'inde(%1,8) VOR, ITR, POS'e, A.terreus izolatlarından 1'inde(%16,7) VOR'e, A.niger izolatlarından 1'inde(%25) ITR'e, Aspergillus spp. izolatlarından 2'sinde(%11) VOR, POS'e, 1'inde(%5,6) ITR'e direnç saptanmıştır. Duyarlılık ve özgüllük A. fumigatus türlerinde VOR ve POS için %100, ITR için sırasıyla %33,3 ve %100, A. flavus türlerinde ITR için %100, A. terreus türlerinde ITR ve POS için %100 saptanmıştır. Gradient test ve/veya agar plak tarama yöntemiyle direnç saptanan 7 izolatta broth mikrodilüsyon yöntemiyle; 1 A.fumigatus ITR, VOR, POS'e dirençli, 2 A.fumigatus ITR'e dirençli, 1 A.terreus izolatında ITR ve VOR MİK 1µg/ml ve 0,5µg/ml, 1 A.niger ITR MİK 4µg/ml, 2 Aspergillus spp. ITR, VOR, POS MİK sırasıyla 2µg/ml ve 8µg/ml, 8µg/ml ve >32µg/ml, 0,5µg/ml ve 4µg/ml saptanmıştır. Bu izolatlardan 5'inde CypA-L98H, 6'sında CypA-M220 mutasyonları belirlenmiş, 1'inde mutasyon saptanmamıştır. Direnç saptanmayan 1 izolatta CypA-L98H ve CypA-M220 mutasyonları belirlenmiştir. Sonuçlar: Aspergilloz tedavisinde hızlı antifungal duyarlılık tarama testlerine ihtiyaç artmaktadır. Çalışmamızda agar plak yönteminin duyarlılığı A.fumigatus ITR için %33,3 saptanmış olsa da, diğer türlerde ITR, VOR, POS için duyarlılığı ve özgüllüğü %100 belirlenmiştir. A.fumigatus için saptanan düşük duyarlılık değeri, agar plak ilaç konsantrasyonlarının EUCAST rehberlerinin son düzenlemeleriyle uyumlu olarak güncellenmesi gerektiğini göstermiştir. Çalışmamızda saptanan CypA-L98H ve CypA-M220 mutasyonları, ülkemizde azol direnciyle ilişkili mutasyonların farklı bölgelerdeki dağılımlarının araştırılması gerektiğini düşündürmüştür. Sonuç olarak; azol direncinin saptanması için kolayca uygulanabilen agar plak yönteminin rutin kullanımda hızlı ve pratik bir yöntem olması ile hem etkili tedavi stratejilerinin belirlenmesine, hem de epidemiyolojik verilerin oluşmasına katkı sağlayabileceği düşünülmüştür.

Özet (Çeviri)

Objective: Invasive fungal infections are a serious threat in terms of morbidity and mortality, especially in immunocompromised patients. The most frequently isolated agents are Aspergillus genus fungi, and sensitivity to azoles, which are the first choice in treatment, decreases. In our study, we aimed to investigate the use of the agar plate screening method as a fast, easy and practical method in determining azole resistance in Aspergillus spp. species. Methods: Our study; was conducted with 125 Aspergillus spp. isolates produced from various clinical samples. Aspergillus spp. isolates were identified by conventional methods and azole resistance was determined by gradient test and agar plate screening method. Broth microdilution method was applied to resistant isolates, and CypA-L98H and CypA-M220 mutations in the cyp51A gene were investigated. Results: In our study, 55 A. fumigatus complex (44%), 42 A. flavus (33.6%), 6 A. terreus (5%), 4 A. niger (3%) and 18 Aspergillus spp. (14%) were identified. With the gradient test method; resistance to VOR and POS was detected in 1 (1.8%) of A.fumigatus isolates, and resistance to ITR was detected in 3 (5.45%). In 1 of the A.terreus isolates (16.7%), the VOR-MIC was 1µg/ml, in 1 of the A.niger isolates (25%), the ITR-MIC was 2µg/ml, in 1 of the Aspergillus spp. isolates (5.6%). ITR-MIC was 4µg/ml, in 2 cases (11%) VOR-MIC and POS-MIC were found to be 1.5µg/ml, >32µg/ml and 0.5µg/ml, 8µg/ml respectively. With the agar plate method; 1 of the A.fumigatus isolates (1.8%) had VOR, ITR, POS, 1 of the A.terreus isolates (16.7%) had VOR, 1 of the A.niger isolates (25%) had ITR. Resistance to VOR and POS was detected in 2 Aspergillus spp. isolates (11%), and resistance to ITR was detected in 1 (5.6%). Sensitivity and specificity were determined as 100% for VOR and POS in A. fumigatus species, 33.3% and 100% for ITR, respectively, 100% for ITR in A. flavus species, and 100% for ITR and POS in A. terreus species. By broth microdilution method in 7 isolates in which resistance was detected by gradient test and/or agar plate screening method; 1 A.fumigatus resistant to ITR, VOR, POS, 2 A.fumigatus resistant to ITR, 1 A.terreus isolate with ITR and VOR MICs of 1µg/ml and 0.5µg/ml, 1 A.niger ITR MIC of 4µg/ml, 2 Aspergillus spp. ITR, VOR, POS MICs were determined as 2µg/ml and 8µg/ml, 8µg/ml and >32µg/ml, 0.5µg/ml and 4µg/ml, respectively. CypA-L98H mutations were detected in 5 of these isolates, CypA-M220 mutations were detected in 6, and no mutation was detected in 1. CypA-L98H and CypA-M220 mutations were detected in 1 isolate for which resistance was not detected. Conclusion: The need for rapid antifungal susceptibility screening tests is increasing in the treatment of aspergillosis. Although the sensitivity of the agar plate method was determined to be 33.3% for A.fumigatus ITR in our study, its sensitivity and specificity were determined to be 100% for ITR, VOR, and POS in other species. The low sensitivity value detected for A.fumigatus showed that agar plate drug concentrations should be updated in accordance with the latest regulations of EUCAST guidelines. The CypA-L98H and CypA-M220 mutations detected in our study suggested that the distribution of azole resistance-related mutations in different regions in our country should be investigated. In conclusion; It is thought that the agar plate method, which can be easily applied to detect azole resistance, is a fast and practical method in routine use and can contribute to both the determination of effective treatment strategies and the generation of epidemiological data.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    359180

    Febril nötropenik hastalarda fungal etkenlerin varlığının farklı mikrobiyolojik yöntemlerle araştırılması

    Investigation of the presence of fungal agents in febrile neutropenic patients with different microbilogical methods

    AHU SÖNMEZ

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2014

    MikrobiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Temel Tıp Bilimleri Bölümü

    DOÇ. DR. FAHRİYE EKŞİ

  2. Tez No

    484886

    Febril nötropenik hastalarda gelişen akciğer enfeksiyonlarında fungal etkenlerin yeri, klinik ve mikrobiyolojik özellikleri

    The type, clinical and microbiological properties of fungal agents of lung infections in febrile neutropenic patients

    ZEHRA DUMAN

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2017

    Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıÇukurova Üniversitesi

    Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. BEHİCE KURTARAN

  3. Tez No

    302583

    İklimlendirme sistemlerinin yapı içi hava niteliği üzerindeki olumsuz etkileri

    The negative effects of air conditioning systems on indoor air quality

    AYGÜL CEYLAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    MimarlıkYıldız Teknik Üniversitesi

    Mimarlık Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AYŞE BALANLI

  4. Tez No

    838437

    Çiftlik şartlarında başlıca mastitis etkenlerinin spesifik ve kromojenik besiyerleri kullanılarak izolasyon ve identifikasyonunun karşılaştırmalı analizi

    Comparative analysis of isolation and identification of major mastitis agents using specific and chromogenic media under farm conditions

    ERDAL ÇERKEZOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Veteriner HekimliğiHatay Mustafa Kemal Üniversitesi

    Veteriner Doğum ve Jinekoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. YAŞAR ERGÜN

  5. Tez No

    552888

    Kalsinörin inhibitörlerinden cyclosporine A ve tacrolimus (FK-506)'un yeni antifungal tedavi stratejilerine etkilerinin araştırılması

    Investigation of the effects of cyclosporine A and tacrolimus (FK506) as calcineurin inhibitors to novel antifungal therapy strategies

    SÜMEYYE ŞEN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2018

    Mikrobiyolojiİstanbul Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÖKHAN AYGÜN

Geri Dön