Ankilozan spondilit hastalığının tedavisine yönelik hesaplamalı ilaç geliştirme çalışmaları
Computational drug development studies for the treatment of ankylosing spondylitis disease
- Tez No: 849248
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ GÖZDE YALÇIN ÖZKAT
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Biyoteknoloji, Eczacılık ve Farmakoloji, Bioengineering, Biotechnology, Pharmacy and Pharmacology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: İleri Teknolojiler Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 44
Özet
Bu tez çalışması ile, hesaplamalı olarak yürütülen çalışmalar vasıtasıyla Ankilozan Spondilit hastalığının tedavisine yönelik yeni bir ilaç önder bileşiğinin geliştirilmesi hedeflenmiştir. Bu doğrultuda 2 basamaklı bir yöntem kullanılarak; ilk basamakta PharmMAPPER web aracı vasıtasıyla hedefe yönelik farmakofor modelleme, ikinci basamakta ise Ligandscout programı kullanılarak ligand temelli farmakofor modelleme gerçekleştirilmiştir. Ligandscout programından alınan 10 model için ZINCPharmer veri tabanı üzerinden taramalara gerçekleştirilerek 46 adet molekül elde edilmiştir. Daha sonra, bu moleküllerin in siliko ortamda ADME/Tox (Absorbsiyon, Dağılım, Metabolizma, İtrah, Toksisite) özellikleri incelenmiş ve ligand sayısı 5'e düşürülmüştür. AutoDock Vina programı vasıtasıyla, PKM2 enzimi ile 5 adet ligand molekülün moleküler kenetleme işlemi yapılarak bağlanma afiniteleri ve bağlanma profilleri belirlenmiştir. Tüm özellikler değerlendirildiğinde ZINC33366193, ZINC33686099, ZINC49539596, ZINC49539672, ZINC49539770 moleküllerinin Ankilozan Spondilit hastalığı için ilaç önder bileşikleri olabileceği ortaya konmuştur.
Özet (Çeviri)
With this thesis, it is aimed to develop a new drug lead compound for the treatment of Ankylosing Spondylitis disease through computational studies. In this direction, using a 2-step method; In the first step, target-oriented pharmacophore modeling was performed using the PharmMAPPER web tool, and in the second step, ligand-based pharmacophore modeling was performed using the Ligandscout program. 46 molecules were obtained by scanning the ZINCPharmer database for 10 models taken from the Ligandscout program. Later, the ADME/Tox (Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion, Toxicity) properties of these molecules were examined in silico environment and the number of ligands was reduced to 5. Molecular docking of 5 ligand molecules with the PKM2 enzyme was performed through the AutoDock Vina program, and their binding affinities and binding profiles were determined. When all features are evaluated, it has been revealed that ZINC33366193, ZINC33686099, ZINC49539596, ZINC49539672, ZINC49539770 molecules may be drug lead compounds for Ankylosing Spondylitis disease.
Benzer Tezler
- NON-radyografik spondilartrit ve ankilozan spondilit hastalarında serum oksitosin düzeylerinin ölçülmesi ve bu düzeylerin hastalık klinik parametreleriyle ilişkilerinin araştırılması
The measurement of serum oxytosine levels in non-radiographic spondylartrit and ancylosis spondylitis patients and the investigation of the relationship with clinical parameters
ÖZKAN YÜKSELMİŞ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2018
Fiziksel Tıp ve RehabilitasyonDicle ÜniversitesiFiziksel Tıp ve Rehabilitasyon Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHMET ÇAĞLAYAN
- İnfliksimab tedavisi alan ankilozan spondilit ve romatoid artrit hastalarında ilaca karşı antikor gelişimi, infliksimab düzeylerinin klinik parametreler ve oksidatif durum ile ilişkisi
Antibody development against to drug, infliximab levels and the relationship between clinical parameters and oxidative status in ankylosing spondylitis and rheumatoid arthritis patients receiving infliximab therapy
MELEK PALA AKDOĞAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
BiyokimyaAnkara ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ASLIHAN GÜRBÜZ
- Ülseratif kolitte yeni inflamatuar biyobelirteçlerin subkutan infliksimab tedavisinde remisyonu öngörme gücü : Tek merkezli retrospektif bir çalışma
Başlık çevirisi yok
DOĞUŞ BERK KUZUCU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
GastroenterolojiEge Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NALAN GÜLŞEN ÖZÇELİK ÜNAL
- Ankilozan spondilit hastalarının anti-TNF ilaç uyumuna mobil uygulamanın etkisi: Pilot çalışma
The effect of mobile application on anti-TNF drug adherence of ankylosing spondylitis patients: Pilot study
FÜSUN UZGÖR
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
HemşirelikEskişehir Osmangazi ÜniversitesiHemşirelik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞE ÖZKARAMAN
PROF. DR. CENGİZ KORKMAZ
- Romatoid artritli ve spondiloartropatili hastalarda tercih edilen tamamlayıcı alternatif tıp uygulamalarının karşılaştırılması
Comparison of Preferred Complementary and Alternative Medicine Practices in Patients with Rheumatoid Arthritis and Spondyloarthropathies
KÜBRA DEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
RomatolojiSağlık Bilimleri Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. ŞÜKRAN ERTEN
DOÇ. ENES SEYDA ŞAHİNER