Kanser ilacı uygulanmış hela hücresinin görüntü işleme yöntemleriyle incelenmesi
Image processing analysis of cancer drug-treated hela cells
- Tez No: 868226
- Danışmanlar: DOÇ. DR. UĞUR ERKAN, DOÇ. DR. BAHAR YILMAZ ALTINOK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Karamanoğlu Mehmetbey Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 93
Özet
Kadınlarda yaygın olarak teşhis edilen kanser türleri meme, kolorektal, endometrial, serviks (rahim ağzı) ve over kanserleridir. Dünya genelinde kadınların en sık karşılaştığı dördüncü kanser türü serviks kanseridir. Serviks, rahmin alt kısmında bulunan ve vajinaya açılan dar bir kanaldır. Serviks kanseri, rahim ağzındaki hücrelerin anormal bir şekilde büyümesi ve çoğalması sonucu ortaya çıkan bir kanser türüdür. Serviks kanseri genellikle yavaş gelişir ve başlangıçta belirtiler göstermez. 2020'de 600.000'den fazla yeni vaka ve 340.000'den fazla ölüm kaydedilmiştir. Servikal kanserde kemoterapötik ajanlarla gerçekleştirilen tedavi yöntemlerinde kullanılan ilaçların kanserli hücreleri hızlı bir şekilde ölü hücre haline getirmesi önemlidir. Ayrıca uygulanan ilacın ne kadar kanserli hücreyi öldürdüğü de anlam ifade etmektedir. Bu çalışmada görüntü işleme yöntemleri ile ilgili kanserin ilaç uygulama aşamalarında kullanılması amacıyla, serviks kanser tedavisinde sık kullanılan ilaçlar (Cisplatin, docetaxel, taxol ve gemstabine) HeLa hücre hattına uygulanarak hücrede yaptığı değişiklikler ve etkilerinin tespit edilmesi için görüntü işleme yöntemleri kullanılmıştır. Çalışma üç kısımdan oluşmaktadır. İlk aşama kanser ilaçlarının HeLa hücrelerine uygulanmasıdır. Bu aşamada, Hela hücre hattı kullanarak kontrol ve ilaç uygulanan hücrelerin görüntüsü mikroskop ve kamera yardımıyla alınmıştır. İkinci aşamada, YOLOv4 ile bölütleme ve ölü hücreleri sayma yapabilmek için görüntü üzerindeki ölü hücreler etiketlenmiştir. YOLOv4 yardımıyla etiketlenmiş veriler 'Google colab' yardımıyla işlenmiştir. Son aşamada ise, Phyton temelli YOLOv4 kullanılarak ölü hücre sayımı gerçekleştirilmiştir. Çalışmamızda YOLOv4 ve Phyton temelinde oluşturduğumuz algoritma ile görüntü işleme teknikleri kullanılarak ölü hücre sayımı yapılmıştır ve sonuç olarak servikal kanserde, hasta için hangi ilacın daha etkin bir şekilde tedavi gerçekleştirilebileceği gösterilmiştir.
Özet (Çeviri)
The most commonly diagnosed cancers in women are breast, colorectal, endometrial, cervical and ovarian cancers. The fourth most common cancer in women worldwide is cervical cancer. The cervix is a narrow canal at the bottom of the uterus that opens into the vagina. Cervical cancer is a type of cancer caused by abnormal growth and proliferation of cells in the cervix. Cervical cancer usually develops slowly and initially shows no symptoms. In 2020, more than 600,000 new cases and more than 340,000 deaths were recorded. In the treatment of cervical cancer with chemotherapeutic agents, it is important that the drugs used quickly turn cancerous cells into dead cells. It is also meaningful how many cancerous cells are killed by the applied drug. In this study, image processing methods were used to determine the changes and effects of drugs commonly used in cervical cancer treatment (cisplatin, docetaxel, taxol and gemstabine) on the HeLa cell line in order to be used in the drug administration stages of cancer. The study consists of three parts. The first stage is the application of cancer drugs to HeLa cells. In this stage, images of control and drug-treated cells using the Hela cell line were captured using a microscope and camera. In the second stage, dead cells on the image were labeled for segmentation and dead cell counting with YOLOv4. The data affected by YOLOv4 was processed with the help of 'Google colab'. In the final stage, dead cell counting was performed using Phyton-based YOLOv4. In our study, dead cell counting was performed using image processing techniques with the algorithm we created based on YOLOv4 and Phyton, and as a result, it was shown which drug can be treated more effectively for the patient in cervical cancer.
Benzer Tezler
- CB1954 ilaç öncül madde ve nitroredüktaz (NTR) enzim kombinasyonlarının kanser hücrelerine etkisi
The effect of CB1954 prodrug and nitroreductase enzyme combinations on cancer cells
ESRA KAYA
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
BiyolojiGebze Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NİL SAYDAN
- Bazı serbest ve bazı doymamış yağ asitlerinin hela (insan servikal tümör hücresi), C6 (sıçan beyin tümörü) ve HT29 (kolon tümör) hücreleri üzerindeki antitümör aktivitesi ve sitotoksik etkilerinin araştırılması
Investigation of antitumors activity and cytoxic effects of some free and some unsaturated fatty acids on hela (human cervical tumor cell), C6 (rat brain tumor) and HT29 (colon tumor) cells
YEŞİM YUMAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NECMETTİN YILMAZ
- Investigation of the in vitro and in vivo effects of telomere-targeted new drug candidate compounds on different cancer cell lines
Telomer hedefli yeni ilaç adayı bileşiklerinin farklı kanser hücre hatlarında in vitro ve in vivo etkilerinin incelenmesi
MERVE YILMAZ
Doktora
İngilizce
2023
BiyokimyaHacettepe ÜniversitesiTıbbi Biyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZELİHA GÜNNUR DİKMEN
DR. ÖĞR. ÜYESİ SERGEI M. GRYAZNOV
- Çeşitli kanser hücreleri üzerinde sitotoksik etkili paladyum türevlerinin moleküler etki mekanizmalarının aydınlatılması
Elucidation of molecular action mechanisms of cytotoxic palladium derivatives on various cancer cells
ÖMER KAÇAR
Doktora
Türkçe
2016
Tıbbi Biyolojiİstanbul ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. EMİNE ŞEKÜRE NAZLI ARDA
DOÇ. DR. CEYDA AÇILAN AYHAN
- İnsan servikal kanser (HELA) hücreleri üzerine nanotaşıyıcı sistemlere yüklenmiş Doksorubisin'in sitotoksik etki ve bazı genlerin ekspresyon profillerinin belirlenmesi.
Cytotoxic effect of doxorubicin loaded on nanocarrier systems on human cervical cancer (HELA) cell line and determination of some genes expression profiles.
KENAN UTKU
Doktora
Türkçe
2020
BiyokimyaSivas Cumhuriyet ÜniversitesiBiyokimya Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YAVUZ SİLİĞ