Çok ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis suşlarının sekonder ilaçlara direnci ve dirençle ilişkili mutasyonların araştırılması
Investigation of resistance of multi-drug resistant Mycobacterium tuberculosis strains to secondary drugs and resistance-associated mutations
- Tez No: 870170
- Danışmanlar: PROF. DR. MELTEM UZUN
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Mycobacterium tuberculosis, İlaçlara direnç, Mycobacterium tuberculosis, Drug resistance
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tüberküloz, hala dünya genelinde önemli bir halk sağlığı sorunu olmaya devam etmektedir. Mycobacterium tuberculosis kompleksinin neden olduğu bu enfeksiyon, her yıl milyonlarca insanı etkilemekte, önemli bir morbidite ve mortalite nedeni olmaktadır. Çok ilaca dirençli (ÇİD) ve yaygın ilaca dirençli (YİD) suşların artışı, hastalığın tedavisini daha da zorlaştırmaktadır. Antitüberküloz ilaçların yaygın veya bilinçsiz kullanımı, Covid-19 salgını sürecindeki sağlık sistemi aksaklıkları, göç hareketleri gibi sebeplerle ÇİD suşlarda ikincil ilaçlara karşı direnç tüberkülozun kontrolü ve tedavisi için bir tehdit oluşturmaktadır. Direncin tespitinde moleküler yöntemlerin kullanımı, hızlı ve güvenilir sonuç sağlamaları nedeniyle önerilmektedir. Bu amaçla çalışmada 51 ÇİD Mycobacterium tuberculosis kompleksi suşu öncelikle türlerine ayrılmış (GenoType MTBC, Hain Lifescience, Almanya) ve tüm suşlar Mycobacterium tuberculosis/canettii olarak bulunmuştur. Bu suşların 44 (%86,2)'ünün ÇİD olduğu belirlenmiş (GenoType MTBDRplus) ve ÇİD olduğu belirlenen 44 suş için sekonder ilaçlara direnç ve dirençle ilişkili mutasyon bölgeleri (GenoType MTBDRsl) saptanmıştır. ÇİD olduğu belirlenen suşlarda en sık saptanan mutasyon bölgeleri; rpoB S531L (41/44, %93,2) ve katG S315T (37/44, %84) olarak belirlenmiştir. İkincil ilaçlara dirençli bulunan 14 suşun (14/44, %31,8) sekizinde (%18,2) florokinolonlar için en sık tespit edilen mutasyon bölgeleri gyrA A90V (4/8, %50), kalan altısında (%13,6) parenteral ilaçlar için rrs A1401G (4/6, %66,6) olarak saptanmıştır. Dört suş ÇİD olmadığı halde, ikincil ilaçlara dirençli bulunmuştur. Sonuç olarak, Mycobacterium tuberculosis suşlarında ikincil ilaçlara direnç ve dirence neden olan mutasyonların tanımlanması epidemiyolojik verilere önemli bir katkı sağlamıştır. Yapılan çalışmaların sayısı arttıkça daha farklı mutasyon bölgelerini belirlemek mümkündür. Bu çalışmayla direnç tespitinde moleküler yöntemlerin laboratuvar tanı süreçlerine entegrasyonunun önemli olduğu da ortaya koyulmuştur.
Özet (Çeviri)
Tuberculosis still remains an important public health problem worldwide, affects millions of people every year and is a significant cause of morbidity and mortality. The increase in multidrug resistant (MDR) and extensively drug resistant (XDR) strains makes the treatment of the disease more difficult. Resistance to second-line drugs in MDR strains presents a major obstacle for the control and treatment of tuberculosis. This resistance can occur due to various factors, such as the widespread or inappropriate use of antituberculosis drugs, disruptions in the healthcare system caused by the Covid-19 pandemic, and population movements and migration. Molecular methods are recommended for determining drug resistance as they provide rapid and reliable results. In this study, species-level identification made for 51 MDR Mycobacterium tuberculosis complex strains (GenoType MTBC, Hain Lifescience, Germany) and all strains were found as Mycobacterium tuberculosis/canettii. Then 44 (86.2%) of these strains were determined to be MDR (GenoType MTBDRplus) and resistance to second-line drugs and mutation sites associated with resistance were detected (GenoType MTBDRsl) for those 44 strains determined to be MDR. The most common mutation sites determined in MDR strains were rpoB S531L (41/44, 93.2%) and katG S315T (37/44, 84%). The most frequently detected mutation sites for fluoroquinolones in eight (18.2%) of 14 strains (14/44, 31.8%) found resistant to second-line drugs were gyrA A90V (4/8, 50%), in the remaining six (13.6%) rrs for parenteral drugs was determined as A1401G (4/6, 66.6%). Despite not being MDR, four strains were determined as resistant to second-line drugs. In conclusion, the detection of resistance to second-line drugs and associated mutation sites in Mycobacterium tuberculosis strains has made an important contribution to epidemiological data. As the number of studies increases, it is possible to identify more different mutation sites. With this study, it has also been demonstrated that the integration of molecular methods into laboratory diagnostic processes is important in the detection of resistance.
Benzer Tezler
- Zonguldak ilinde izole edilen mycobacterium tuberculosis suşlarının primer antitüberküloz ilaçlarına duyarlılığın BACTEC MGIT 960 sistemiyle belirlenmesi
Determination of susceptibilities of mycobacterium tuberculosis strains isolated from patients in Zonguldak to primary antituberculosis drugs by BACTEC MGIT 960
OSMAN AYDIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2006
MikrobiyolojiZonguldak Karaelmas ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. FÜSUN BEĞENDİK CÖMERT
- Farklı coğrafik bölgelere ait çok ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis izolatlarının karşılaştırmalı genom analizi
Comparative genome analysis of the multidrug resistant Mycobacterium tuberculosis isolates from different geographic regions
SERDAR ULAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyoteknolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SEZER OKAY
- Çok ilaca dirençli Mycobacterium tuberculosis suşlarının izoniazide karşı minimal inhibitör konsantrasyon dağılımlarının katalaz enzim aktiviteleri ile karşılaştırılması
Başlık çevirisi yok
KEREM OCAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2005
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. FUNDA BABACAN
- Çok ilaca dirençli mycobacterium tuberculosis suşlarının minör antitüberküloz ilaçlara duyarlılığının saptanması
The rates of resistance to second line drugs in multidrug resistant mycobacterium tuberculosis strains
REVASİYE KAYALI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2003
MikrobiyolojiSağlık BakanlığıMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NİLAY ÇÖPLÜ
- Ocak 2020-nısan 2023 tarihleri arasındaİstanbul Tıp Fakültesi Tıbbi MikrobıyolojiAnabilim Dalı'na tüberküloz şüphelihastalardan gönderilen klinikörneklerden Mycobacteriumtuberculosis kompleksi izolasyonusıklığının ve antimikobakteriyel ilaçlaraduyarlılığının retrospektif olarak değerlendirilmesi
Retrospective evaluation of the frequency of Mycobacterium tuberculosis complex isolation and its susceptibility to antimycobacterial drugs from clinical samples sent of patients with suspected tuberculosis to the Department of Medical Microbiology, Istanbul Faculty of Medicine between January 2020 and April 2023.
INARA KARIMLI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. YAŞAR NAKİPOĞLU