Ağızda üreyen Candida türlerinin real time PCR ile belirlenmesi
Identification of Candida species growing in mouth by real time PCR
- Tez No: 878691
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET AKİF ÇÜRÜK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Oral kandidoz ağızdaki mukozayı etkileyen en önemli mantar enfeksiyonlarından biridir. Bu lezyonlara Candida türleri sebep olur. Ağız boşluğunda sık görülen beş Candida türü (Candida albicans, Candida tropicalis, Candida krusei, Candida parapsilosis ve Candida dubliniensis) vardır. Candida türlerinin doğru belirlenmesi antifungal tedavi ve epidemiyolojik yönden çok önemlidir. Bu çalışmanın amacı tıbbi önemi olan Candida türlerinin Real Time Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-PCR) ile belirlenmesi için basit bir yöntemi geliştirmekti. Bu çalışmaya sağlıklı 50 kişi katıldı. Her gönüllü kişi 15 ml distile su ile ağzını çalkaladı, örnekler 3000 rpm de 10 dakika santrifüj edildi. Çökelti 200 µL steril distile su içinde karıştırılarak CHROMAgar Candida besiyerine ekildi. Genomik DNA Quick DNA Fungal/Bacterial Miniprep kiti ile yapıldı. Gen amplifikasyonu için iki çift spesifik primer kullanıldı. Candida türlerini belirlemek için yedi referans Candida (C. albicans, C. dubliniensis, C. glabrata, C. krusei, C. parapsilosis, C. tropicalis ve C. inconspicua) DNA örneği kullanarak Real Time PCR ile değerlendirildi. Candida türlerinin belirlenmesi, birbirinden ayrılması geleneksel yöntemler ile identifikasyon 2-3 gün sürebilmektedir. Candida türlerinin bir gün içinde Real Time PCR'ı takiben erime sıcaklığı (MTA) analizi basit, ucuz ve çabuk bir yöntemdir. Bu çalışmada RT-PCR işleminden sonra erime sıcaklığı temeline dayalı metod, tıbbi önemi olan Candida türlerinin belirlenmesi için optimize edildi.
Özet (Çeviri)
Oral candidiasis is one of the most common fungal infections affecting the oral mucosa. These lesions are caused by Candida species. There are nearly five Candida species that are seen in the oral cavity (Candida albicans, Candida tropicalis, Candida krusei, Candida parapsilosis and Candida dubliniensis). Correct identification of Candida species is important for targeted antifungal therapy and for epidemiological purposes. This study aims to develop a simple method for the detection and identification of medically important Candida species by Real Time Polymerase Chain Reaction (RT PCR). A total of 50 healty adults participated in this study. Each volunteer gargled 15 ml sterile distilled water, and the samples were centrifuged at 3,000 rpm for 10 min. The pellets were suspended in 200 µL sterile distilled water and inoculated into a plate of CHROMagar Candida. Genomic DNA was purified by Quick DNA Fungal/Bacterial Miniprep kit. Two specific primers were used for gene amplification. We evaluated RT PCR assays for the detection of seven reference Candida species, namely, Candida albicans, Candida dubliniensis, Candida glabrata, Candida krusei, Candida parapsilosis, Candida tropicalis and Candida inconspicua. The detection and identification of Candida species by conventional phenotypic methods take a few days. Real Time PCR followed by melting curve analysis (MCA) is a simple, rapid and inexpensive tool to identify Candida species in a day. In this study, a methodology employing RT PCR with melting curve analysis procedure was optimized for the detection of medically important Candida species.
Benzer Tezler
- Yoğun bakım hastalarının örneklerinden soyutlanan Candida türlerinin tiplendirilmesi
Typing of Candida species isolated from clinical specimens of patients hospitalized in intensive care unit
SERHAT MAROL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
MikrobiyolojiDokuz Eylül ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF.DR. MİNE YÜCESOY
- Hasta ve sağlam muko-kutaneus'larda bulunan candidaların klinik ve mikrobiyolojik özelliklerinin incelenmesi
Başlık çevirisi yok
HASAN YILMAZ
- Yoğun bakım ünitesinde yatırılan hastalarda kolonizasyon ve kolonizasyon ile enfeksiyon ilişkisi
Colonization of patients hospitalized in intensive care unit and infection associated with colonization
FADİMANA ÇATAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÖKHAN AYGÜN
- Eksopolisakkarit üreten suşların yoğurtların çeşitli özellikleri üzerine etkileri
The effect of exopolysaccharide producing starter cultures on some properties of yoghurt
HALİL İBRAHİM GÜRAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2009
Gıda MühendisliğiYüzüncü Yıl ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. YUSUF TUNÇTÜRK
- Trakya bölgesinde farklı köylerden alınan yoğurtlardan laktik asit bakterilerinin izolasyonu, bunların EPS (ekzopolisakkarit) üretim kabiliyetlerinin belirlenmesi ve bu bakteriler kullanılarak ayran üretimine uygun kombinasyonlarının seçilmesi üzerin
A research on the isolation of lactic acid bacteria from yoğurt samples taken from different villages of Trakya region, definition of their EPS (exopolysaccharide) producing ability and choosing their best combination for ayran production
BURCU BÖLÜKBAŞI
Doktora
Türkçe
2007
Gıda MühendisliğiTrakya ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF.DR. ŞEFİK KURULTAY