Karbon kaynaklarının salmonella typhimurium'da biyofilm oluşumu üzerindeki etkinliğinin matematiksel modellemesi
Mathematical modeling of the efficacy of carbon sources on biofilm formation in salmonella typhimurium
- Tez No: 885601
- Danışmanlar: PROF. DR. MUSTAFA AKÇELİK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Matematik, Mikrobiyoloji, Biology, Mathematics, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ankara Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 80
Özet
Salmonella dünya genelinde gıda kaynaklı hastalıkların büyük bir çoğunluğuna sebep olan bir patojendir. Çok-hücreli benzeri yapılar olarak adlandırılan ve genetik ve fizyolojik açılardan planktonik formlardan farklılık gösteren biyofilm yapıları, antibakteriyel tedavilere ve çeşitli eradikasyon yöntemlerine karşı büyük oranda direnç geliştirme yeteneğindedirler. Biyofilm yapıları ile başa çıkabilmek için Salmonella metabolizmasını ve fizyolojisini detaylı bir şekilde anlamak önem teşkil etmektedir. Bu çalışmada çoğunluğu gıda endüstrisinde yer alan yedi tane karbon kaynağı (glukoz, fukoz, ramnoz, sitrat, suksinik asit, malik asit, asetik asit), ve bu karbon kaynaklarının çeşitli konsantrasyonlarının (%0,1-%0,6) Salmonella biyofilm oluşumuna etkileri araştırılmıştır. Deneysel süreçlerin takibinde, Gecikmeli Lojistik Diferansiyel Denklemler kullanılarak Salmonella biyofilm yörüngelerinin matematiksel modelleri geliştirilmiştir. Modelin, çok fazla miktarda veri olmadan dahi Salmonella biyofilm oluşumunu modellemek için etkili olduğu çalışmada ortaya konulmuştur. Bu tez çalışmasında elde edilen veriler, Salmonella karbon metabolizmasının ve Salmonella biyofilm yapılarının daha iyi bir şekilde anlaşılması ve biyofilm eradikasyon yöntemlerinin geliştirilmesine katkı sağlaması açısından önem taşımaktadır.
Özet (Çeviri)
Salmonella is a pathogen that causes the majority of foodborne illnesses worldwide. Biofilm structures, which are called multicellular-like structures and differ from planktonic forms in genetic and physiological aspects, are capable of developing great resistance to antibacterial treatments and various eradication methods. In order to deal with biofilm structures, it is important to understand Salmonella metabolism and physiology in detail. In this study, the effects of seven carbon sources (glucose, fucose, rhamnose, citrate, succinic acid, malic acid, acetic acid) and various concentrations of these carbon sources (0,1%-0,6%) on Salmonella biofilm formation were investigated. Following the experimental processes, mathematical models of Salmonella biofilm trajectories were developed using Delayed Logistic Differential Equations. It is demonstrated that the model is effective for modelling Salmonella biofilm formation even without a large amount of data. The data obtained in this thesis are important in terms of better understanding of Salmonella carbon metabolism and Salmonella biofilm structures and contributing to the development of biofilm eradication methods.
Benzer Tezler
- Yüzey sularından aktif karbon ve ultrafiltrasyon teknolojileri ile içilebilir su eldesi
Drinking water production from surface water using activated carbon and ultrafiltration technologies
BÜŞRA KARAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Kimya Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELEK TÜTER
- Sürdürülebilir atık yönetimi kapsamında organik atıkların solucan ile kompostlaştırılması: İTÜ Ayazağa kampüsü örneği
Composting organic wastes with worms within the scope of sustainable waste management: The case of ITU Ayazaga campus
AYŞE NUR USTA
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HÜSEYİN GÜVEN
- Investigations on the effects of carbon sources and pH on exo-polygalacturonase production by Aspergillus sojae
Karbon kaynaklarının ve pH'nın Aspergillus sojae ile ekzo-poligalakturonaz üretimine etkileri üzerine araştırmalar
GULTEN KURU
Yüksek Lisans
İngilizce
2013
Biyomühendislikİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoteknoloji Bölümü
YRD. DOÇ. DR. ALİ OĞUZ BÜYÜKKİLECİ
- Effects of carbon sources and feeding strategies on human growth hormone production by metabolically engineered Pichia pastoris
Karbon kaynaklarının ve besleme stratejilerinin rekombinant Pichia pastoris ile insan büyüme hormonu üretimine etkisi
EDA AÇIK
Yüksek Lisans
İngilizce
2009
BiyomühendislikOrta Doğu Teknik ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PINAR ÇALIK
PROF. DR. TUNÇER ÖZDAMAR
- Microbial community and metabolism of enhanced biological phosphorus removal
Biyolojik aşırı fosfor gideriminin mikrobiyal türleri ve metabolizması
GÜLSÜM EMEL ZENGİN
Doktora
İngilizce
2009
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiÇevre Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NAZİK ARTAN
PROF. DR. TAKASHİ MİNO