Exploring the genetic landscape of covid-19 susceptibility among patients in Türkiye: A variant discovery study
Türkiye'deki hastalarda covid-19 duyarlılığının genetik durumunun araştırılması: Bir varyant keşfi çalışması
- Tez No: 888758
- Danışmanlar: DOÇ. DR. YEŞİM AYDIN SON
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Enformatik Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoenformatik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyoenformatik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
SARS-CoV-2 virüsünün neden olduğu COVID-19 pandemisi, hastalığa yatkınlığı etkileyen genetik faktörleri anlama ihtiyacının altını çizmiştir. Bu çalışma, Hacettepe Üniversitesi Hastanesi'ndeki hastaları kullanarak Türk toplumunda Tek Nükleotid Varyantları (SNV'ler) ile COVID-19 duyarlılığı arasındaki ilişkiyi aydınlatmayı amaçlamaktadır. Bu çalışma, COVID-19 duyarlılığı ile bağlantılı SNV'leri tanımlamak ve analiz etmek için veri odaklı bir yaklaşım benimsemektedir. Yeni nesil dizileme kullanarak, Türkiye'deki Hacettepe Üniversitesi Hastanesi'nde tedavi gören hastalara odaklanarak, çeşitli bilimsel yayınlardan SNV verilerini sistematik olarak derledik ve analiz ettik. Analiz, varyant arama, bağlantı analizi ve Finlandiya dışı Avrupa alel frekansları ile istatistiksel karşılaştırmaları içermektedir. Temel bulgular, varyantların (rs17860115, rs2298659, rs2298661, rs4290734, rs9271609, rs2532300, rs34624090, rs61299115 ve rs56106917) Avrupa popülasyonuna kıyasla farklı frekanslar sergilediğini ve Türkiye'de hastanede yatan popülasyonda hastalık duyarlılığını etkileyen potansiyel genetik yatkınlıkları gösterdiğini öne sürmektedir. Bağlantı dengesizliği analizi, belirli genetik lokuslar arasındaki güçlü korelasyonları vurgulayarak kalıtsal modellere işaret etmiştir. Çalışma, Avrupa'daki alel frekanslarından farklı olarak, Türk nüfusu içerisinde COVID-19 duyarlılığı ile ilişkili önemli genetik varyasyonları vurgulamaktadır. Bu bulgular, halk sağlığı stratejilerinde genetik çeşitliliğin dikkate alınmasının önemini vurgulamakta ve hastalığa yatkınlık ve şiddeti etkileyebilecek genetik faktörlere ilişkin anlayışımızı geliştirmektedir. Bu ilişkileri doğrulamak ve hastalık yönetimi ve önleme stratejileri üzerindeki etkilerini araştırmak için daha büyük kohortlarla daha fazla araştırma yapılması önerilmektedir.
Özet (Çeviri)
The COVID-19 pandemic, caused by the SARS-CoV-2 virus, has underscored the need to understand the genetic factors influencing disease susceptibility. This study adopts a data-driven approach to identify and analyze Single Nucleotide Variants (SNVs) associated with COVID-19 susceptibility in the Hacettepe University Hospital patient cohort. We systematically compiled and analyzed variants published in diverse scientific publications. We genotyped patients treated at the Hacettepe University Hospital (Ankara, Türkiye) using a multiplex approach with next-generation sequencing. The analysis included variant calling, linkage analysis, and statistical comparisons with non-Finnish European allele frequencies. Key findings suggest variants (rs17860115, rs2298659, rs2298661, rs4290734, rs9271609, rs2532300, rs34624090, rs61299115, and rs56106917) exhibit different frequencies compared to the European population, suggesting potential genetic predispositions affecting COVID-19 susceptibility in the hospitalized population in Türkiye. Linkage disequilibrium analysis highlighted strong correlations between specific genetic loci, indicating inherited patterns. The study highlights significant genetic variations associated with COVID-19 susceptibility within a Turkish cohort, differing from European allele frequencies. These findings emphasize the importance of considering genetic diversity in public health strategies and enhance our understanding of the genetic factors that may influence disease susceptibility and severity. Further research with larger cohorts is recommended to validate these associations and explore their implications for disease management and prevention strategies.
Benzer Tezler
- Akaryakıtla çalışan endüstriyel tav fırınlarında yanma, sıcaklık ve basıncın optimum kontrolu
Optimum control of combustion temperature and pressure in industrial tempering furnaces working with fuel-oil
MEHMET EROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
Makine MühendisliğiGazi ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YÜCEL ERCAN
- Çekirdeksiz kuru üzümde uygulanan politikanın Ege Bölgesinde üretim ve üretici açısından sonuçlarının değerlendirilmesi
Başlık çevirisi yok
GÜVEN ÖZERİN
- S.S. Çiçek yetiştirme ve satış kooperatifi İzmir mezatında aylara göre piyasaya arzedilen süs bitkileri cinsleri ve toptan fiyatlarının 1984-1985 kış sezonu (Kasım-Mayıs) içerisindeki değişimi
Başlık çevirisi yok
TANAY BİRİŞÇİ
Yüksek Lisans
Türkçe
1986
Peyzaj MimarlığıEge ÜniversitesiPeyzaj Mimarlığı Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ADNAN HATİPOĞLU
- KY-89 zeolitinde asitlik dağılımının ve bazı hidrokarbonların etkin difüzyon katsayılarının gaz kromatografi ile tayini
Başlık çevirisi yok
SEZAİ ERDEM
Yüksek Lisans
Türkçe
1987
Kimya MühendisliğiEge ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GÖNÜL GÜNDÜZ
- Renk görüntü teorisi ve televizyona uygulaması
Theories of colour vision and their application to television
MUSTAFA LAMİ TAPLAMACIOĞLU
Doktora
Türkçe
1986
Elektrik ve Elektronik MühendisliğiGazi ÜniversitesiElektrik-Elektronik Eğitimi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ATİLLA ÖZMEN