Meme kanserinin moleküler alt tiplerinde C-MYC ve TNK2 genlerinin ekspresyon düzeylerinin incelenmesi
Investigation of the expression levels of C-MYC and TNK2 genes in molecular subtypes of breast cancer
- Tez No: 889351
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET EMİN ERDAL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Tıbbi Biyoloji, Medical Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Mersin Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 59
Özet
Meme kanseri, dünya çapında kadınlarda en ölümcül malignitelerden biridir ve kadınlarda sıklık bakımından değerlendirildiğinde birinci sırada gelmektedir. Meme kanseri, meme dokusundaki hücrelerinin büyümesinden ve sağlıklı kalmasından sorumlu olan genlerdeki nokta mutasyonları, delesyonlar, translokasyonlar, kromozomal amplifikasyonlar, duplikasyonlar ve ekspresyon değişimlerini de içeren genetik anomaliklerin ilerleyen birikimi sonucu meydana gelmektedir. Meme kanseri oluşumunu tetikleyen moleküler mekanizmaların daha iyi anlaşılması, bu hastalığın teşhis, prognostik ve tedavisini geliştirmek için çok önemlidir. Meme kanseri moleküler teknikler ile bazı genlerin ekspresyon özelliklerine dayanan dört moleküler alt tipe sahiptir. Bunlar; Lüminal A, Lüminal B, HER2-pozitif ve Üçlü Negatif Tümörler (Bazal benzeri) meme kanserleridir. Araştırmamızda meme kanserinin moleküler alt tiplerinde c-MYC ve TNK2 genlerinin ekspresyon düzeylerini belirlemeyi amaçladık. Çalışma grubunu, meme kanseri tanısı almış her dört alt gruptan 50 hasta olacak şekilde toplam 200 hasta birey ile bu tanıyı almamış 50 sağlıklı birey olmak üzere toplamda 250 birey oluşturdu. Bu bireylere ait parafin blok doku örnekleri Mersin Üniversitesi Tıp Fakültesi Patoloji Anabilim Dalı arşivinden temin edildi. Total RNA izolasyonu, cDNA sentezi ve qPCR yöntemiyle analiz edildi. Çalışmamızda, hasta ve kontrol grupları arasında, Mann Whitney U ve Kruskal Wallis analizlerine göre, c-MYC gen ekspresyon düzeyleri bakımından istatistiksel olarak anlamlı bir farklılık görülmemiştir (p=0.371). TNK2 gen ekspresyon düzeyleri bakımından istatistiksel olarak anlamlı bir farklılık olduğu görülmüştür (P=0.030). Çalışmamızda; yapılan in siliko analiz sonucunda c-MYC ve TNK2 geninin etkileşimde olduğu genler gösterilmiştir. Bu genlerin meme kanseri patogenezinde rol oynadığı bilinen birden fazla biyolojik sürece ve çeşitli moleküler fonksiyona dahil olduğu görülmüştür. Sonuç olarak, elde ettiğimiz bulgulardan istatistiksel olarak anlamlı bulunan genlerin tanı belirteci ve ilaç hedefi adayı olarak değerlendirilip, gelecekte bu alanda yapılacak çalışmalara ön veri sunabileceğini düşünmekteyiz.
Özet (Çeviri)
Breast cancer is one of the deadliest malignancies in women worldwide and ranks first in terms of frequency in women. Breast cancer occurs as a result of the progressive accumulation of genetic abnormalities, including point mutations, deletions, translocations, chromosomal amplifications, duplications and expression changes in the genes responsible for the growth and health of cells in the breast tissue. A better understanding of the molecular mechanisms that trigger breast cancer formation is crucial to improve the diagnosis, prognostication and treatment of this disease. Breast cancer has four molecular subtypes based on molecular techniques and the expression characteristics of some genes. These; Luminal A, Luminal B, HER2-positive and Triple Negative Tumors (Basal-like) are breast cancers. In our research, we aimed to determine the expression levels of c-MYC and TNK2 genes in molecular subtypes of breast cancer. The study group consisted of a total of 200 patients, 50 patients from each of the four subgroups, who were diagnosed with breast cancer, and 50 healthy individuals who were not diagnosed with this diagnosis, a total of 250 individuals. Paraffin block tissue samples of these individuals were obtained from the archives of Mersin University Faculty of Medicine, Department of Pathology. Total RNA isolation was analyzed by cDNA synthesis and qPCR method. In our study, no statistically significant difference was observed between the patient and control groups in terms of c-MYC gene expression levels, according to Mann Whitney U and Kruskal Wallis analyzes (p = 0.371). It was observed that there was a statistically significant difference in terms of TNK2 gene expression levels (P = 0.030). In our study; As a result of the in silico analysis, the genes that c-MYC and TNK2 genes interact with were shown. These genes have been shown to be involved in multiple biological processes and various molecular functions known to be involved in breast cancer pathogenesis. As a result, we think that the genes found to be statistically significant from our findings can be evaluated as diagnostic markers and drug target candidates and provide preliminary data for future studies in this field.
Benzer Tezler
- Pleomorfik lobüler meme kanserinin klinikopatolojik özellikleri ve sağkalım sonuçlariı popülasyon temelli seer (surveillance, epidemiology, and end results) çalışması
Clinicopathological features and survival outcomes of pleomorphic lobular breast carcinoma: A population-based seer (surveillance, epidemiology, and end results) study
AHMET NECATİ ŞANLI
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Genel CerrahiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar ÜniversitesiGenel Senoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HALİL KARA
- Studying the role of an anti-apoptotic Bag-1 protein in healthy & tumor tissues in patients with breast carcinoma
Meme kanserli hastalardan alınan sağlıklı ve tümörlü dokularda anti-apoptotik Bag-1 proteinin rolünün çalışılması
EMİNE ARZU BAŞKALE
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. GİZEM DİNLER DOĞANAY
- Taksan kemoterapisi alan meme kanseri tanılı olgularda sistemik immün inflamatuar indeks ve prognostik nutrisyonel indeksin prediktif ve prognostik değeri
Predictive and prognostic value of systemic immune-inflammatory index and prognostic nutritional index in cases diagnosed with breast cancer receiving taksan chemotherapy
BERTUĞ BİLECEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2024
OnkolojiÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. YALÇIN ÇIRAK
- Kolorektal kanserli hastalarda interlökin-6, interlökin-18 gen polimorfizmlerinin ve plazma düzeylerinin araştırılması
The investigation of interleukin-6, interleukin 18 gene polymorphisms and their plasma levels in patiens with colorectal cancer
İREM BEKALP
- Meme kanserinin moleküler alt tiplerinde görülen dinamik kontrastlı meme MRG bulgularının bırads tanımlayıcılarına göre değerlendirilmesi
Evaluation of dynamic contrast breast MRİ findings in molecular subtypes of breast cancer according to birads descriptions
NİGAR ERKOÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Radyoloji ve Nükleer TıpSağlık Bilimleri ÜniversitesiRadyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. AYŞEGÜL AKDOĞAN GEMİCİ