Staphylococcus aureus izolatlarında virulans genlerinin araştırılması
Investigation of virulence genes in staphylococcus aureus isolates
- Tez No: 896106
- Danışmanlar: PROF. DR. İBRAHİM MEHMET ALİ ÖKTEM
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 148
Özet
Staphylococcus aureus, hastanede yatan hastalardan en sık izole edilen patojen olup ayakta tedavi edilen hastalardan ise en sık izole edilen ikinci patojendir. Staphylococcus aureus'un virülans faktörleri genellikle toplum kökenli enfeksiyonlarda daha sık bir şekilde araştırılmış olmasına rağmen, hastanede yatan hastalarla ilgili veriler azdır. Bu minvalde, bu tez çalışmasında, Dokuz Eylül Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Sağlık Hizmeti ile ilgili Enfeksiyonlar'ın Moleküler Epidemiyolojisi Laboratuvarı'na 2022-2023 yılları arasında gönderilen Staphylococcus aureus izolatlarında yer alan virülans genlerinin profilinin çıkarılması amaçlanmıştır. Araştırmaya, -80°C'de saklanmış yatan hastalara ait 212 Staphylococcus aureus klinik izolatı (alt solunum yolu, idrar, kan ve yara) dahil edildi. İzolatlar canlandırıldıktan sonra MALDI-TOF MS ile tanımlandı. DNA ekstraksiyonu yapıldıktan sonra hedeflenen pvl, ebps, tsst-1, hla, sea ve eta virülans genleri in house PCR yöntemi kullanılarak araştırıldı. Daha sonra elde edilen PCR ürünlerinde araştırılan virülans genlerinin varlığının veya yokluğunun görülmesi için agaroz jel elektroforezi yöntemi ile incelendi. Pozitif virülans genlerine sahip izolatların Nucleotide-Nucleotide BLAST veri tabanı kullanılarak sekans analizi gerçekleştirildi. Veri SPSS 27.0 paket programında değerlendirildi. Anlamlılık düzeyi p
Özet (Çeviri)
Staphylococcus aureus is the most frequently isolated pathogen from hospitalized patients and the second most frequently isolated pathogen from outpatients. Although virulence factors of Staphylococcus aureus have been studied more frequently in community-acquired infections, data on hospitalized patients are scarce. In this respect, in this thesis study, Dokuz Eylül Department of Medical Microbiology, University Faculty of Medicine, Health Service to the Laboratory of Molecular Epidemiology of Infections related to 2022-2023 Staphylococcus aureus isolates sent between the years virulence genes were profiled. The study included 212 clinical isolates of Staphylococcus aureus (lower respiratory tract, urine, blood and wound) from inpatients stored at -80°C. Isolates were identified by MALDI-TOF MS after cultures were resuscitated. After DNA extraction, the targeted virulence genes pvl, ebps, tsst-1, hla, sea and eta were investigated using in house PCR. The PCR products were then analyzed by agarose gel electrophoresis to determine the presence or absence of the virulence genes. Sequence analysis of isolates with positive virulence genes was performed using the Nucleotide-Nucleotide BLAST database. Data were analyzed using SPSS 27.0 package program. Significance level p
Benzer Tezler
- Çiğ sütlerden elde edilen staphylococcus aureus izolatlarında Panton Valentine lökosidin genlerinin araştırılması
Investigation of panton valentine leukocidin genes in staphylococcus aureus strains isolated from raw milk
BUSE ARSLAN
Doktora
Türkçe
2022
Veteriner HekimliğiAnkara ÜniversitesiGıda Hijyeni ve Teknolojisi (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TARIK HALUK ÇELİK
- Investigation of the presence of the mecA gene in methicillin-resistant staphylococcus aureus isolates from patients with urinary tract and wound infections
İdrar yolu ve yara infeksiyonu olan hastalardan izole edilen metisiline dirençli staphylococcus aureus izolatlarında mecA gen varlığının araştırılması
HUSAM ABBAS SALIH AL-BAYATI
Yüksek Lisans
İngilizce
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SERDAL TARHANE
DR. ÖĞR. ÜYESİ AHMED HAMAD SALEH
- Mastitis izolatı stafilokok suşlarında vankomisin dirençliliğinin fenotipik ve genotipik olarak araştırılması
The phenotypic and genotypic investigation of vancomycine resistance among mastitis isolates of staphylococci
MEHMET ONUR GÖKDAĞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
Veteriner HekimliğiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ALPER ÇİFTCİ
- Staphylococcus aureus klinik izolatlarında panton-valentine lökosidin varlığının ve klonal ilişkisinin araştırılması
Investigation of panton-valentine leukocidin presence and the clonal relationship in the clinical strains of staphylococcus aureus
YÜCEL DUMAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2012
Mikrobiyolojiİnönü ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET SAİT TEKEREKOĞLU
- Investigation of antibiotic resistance profiles, mecA and blaZ resistance genes of staphylococcus aureus strains isolated from clinical samples at Sammara General Hospital in Iraq
Irak'ta Sammara Genel Hastanesindeki klinik örneklerden izole edilen Staphylococcus aureus çeşitlerinin antibiyotik direnç profilleri ile mecA ve blaZ direnç genlerinin araştırılması
OMAR JAMAL IBRAHIM ALFATOUH
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EBRU DERELLİ TÜFEKÇİ
DOÇ. DR. ASMAA EASA MAHMOOD