Application of computational methods for investigating the role of vimentin in cancer prognosis and diagnosis
Vimentinin kanser prognozu ve teşhisinde rolünü araştırmak için hesaplamalı yöntemlerin uygulanması
- Tez No: 898674
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ATHANASIA PAVLOPOULOU
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Biyoistatistik, Biostatistics
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Dokuz Eylül Üniversitesi
- Enstitü: İzmir Uluslararası Biyotıp ve Genom Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 90
Özet
Çeşitli hücresel süreçlerde rol oynayan bir iskelet proteini olan vimentin, kanserde potansiyel bir prognostik biyomarker olarak ilgi çekmiştir. Bu çalışmada, çeşitli kanser türlerinde vimentin ekspresyonunun prognostik önemini araştırmak amacıyla sistematik bir literatür taraması ve meta-analiz çalışması yapılmıştır. Yapılan kapsamlı arama sonucunda, çeşitli kanser türlerinden 14.784 hastayı kapsayan 115 uygun çalışma tespit edilmiştir. Vimentin ekspresyonu ile hastaların sağkalım sonuçları (genel sağkalım (OS), nükssüz/hastalıksız sağkalım (RFS/DFS), ilerlemesiz/metastazsız sağkalım (PFS/MFS) ve hastalığa özgü sağkalım (DSS)) arasındaki ilişkiyi değerlendirmek için %95 güven aralıkları (CIs) ile birleşik risk oranları (HRs) hesaplanmıştır. Analizimiz, artan vimentin ekspresyonu ile birçok kanser türünde olumsuz sağkalım sonuçları arasında anlamlı bir korelasyon ortaya koymuştur. Özellikle, artan vimentin ekspresyonu olumsuz OS, RFS/DFS, PFS/MFS ve DSS ile ilişkilendirilmiştir. Bu bulgular, çeşitli kanser kohortları arasında tutarlı sonuçlar vermiştir. Ayrıca dahil edilen çalışmalar, çalışmanın yapıldığı ülkenin gelirine göre sınıflandırıldığında, düşük-orta gelir grubunda vimentinin aşırı ekspresyonu ile daha kötü genel sağkalım arasında anlamlı bir ilişki bulunmuştur. Yapılan meta-analiz çalışmasında, vimentinin geniş bir insan kanseri yelpazesinde umut verici bir prognostik biyomarker olduğunu destekleyen güçlü kanıtlar yer almaktadır. Bu bulgular, vimentinin prognostik sınıflandırmada ve kanser hastaları için kişiselleştirilmiş karar vermede potansiyel klinik faydasını vurgulamaktadır.
Özet (Çeviri)
Vimentin, a cytoskeletal protein implicated in various cellular processes, has garnered significant interest as a potential prognostic biomarker in cancer. Herein, a systematic literature review and meta-analysis was conducted in order to investigate the prognostic significance of vimentin expression across diverse cancer types through in silico approaches. A comprehensive search yielded 115 eligible studies encompassing 14,784 patients, representing a broad spectrum of cancers. Pooled hazard ratios (HRs) with 95% confidence intervals (CIs) were calculated to assess the association between vimentin expression and patients' survival outcomes, including overall survival (OS), recurrence-free/disease-free survival (RFS/DFS), progression-free/metastasis-free survival (PFS/MFS) and disease-specific survival (DSS). Our analysis revealed a significant correlation between elevated vimentin expression and adverse survival outcomes across multiple cancer types. Specifically, increased vimentin expression was associated with poorer OS, RFS/DFS, PFS/MFS and DSS. These findings were robust and consistent across diverse cancer cohorts. Furthermore, when the studies were classified based on the host country's income, a significant association was found between vimentin overexpression and poorer OS in the lower-middle income subgroup. Collectively, our meta-analysis provides compelling evidence supporting vimentin as a promising prognostic biomarker across a wide range of human cancers. These findings underscore the potential clinical utility of vimentin in prognostic stratification and personalized decision-making for cancer patients.
Benzer Tezler
- TiO2 ve ZnO kaplı zeolitlerin sentezi, karakterizasyonu ve metilen mavisi adsorpsiyonunun yapay sinir ağları ile modellenmesi
Synthesis, characterisation and artificial neural network modelling of methylene blue adsorption of TiO2 and ZnO coated zeoli̇tes
ONUR KABADAYI
- Yüksek doğru gerilim (HVDC) iletim hatlarının korona karakteristikleri ve elektromanyetik etkileri
DC corona characteristics and electromagnetic effects of HVDC transmission lines
AYTUĞ FONT
Doktora
Türkçe
2020
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiElektrik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYDOĞAN ÖZDEMİR
- HCNG yakıtlı benzin motorunda fraktal yanma modeli ile simülasyon ve parametrik optimizasyon çalışması
Simulation and parametric optimization study with fractal combustion model in HCNG fuelled gasoline engine
EREN ÖZDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ALPER TOLGA ÇALIK
- A tool oriented approach to digital making and control in design
Dijital yapma biçimleri ve tasarımda kontrole araç odaklı bir yaklaşım
GAMZE GÜNDÜZ
Doktora
İngilizce
2024
Bilim ve Teknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiBilişim Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MİNE ÖZKAR KABAKÇIOĞLU
- Çukur yapıların yüzey sürtünme direncine olan etkilerinin hesaplamalı ve deneysel olarak incelenmesi
Experimental and computational investigation of the effect of dimpled surfaces on skin friction reduction
YASİN KAAN İLTER
Doktora
Türkçe
2023
Gemi Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiGemi İnşaatı ve Gemi Makineleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. UĞUR ORAL ÜNAL