Geri Dön

Bakteri kültüründe karbapenemazların tespiti için kullanılan hızlı tanı test kitleri sonuçları ve pcr sonuçlarının karşılaştırılması

Comparison of results of rapid diagnostic test kits and pcr results for the detection of carbapenemases in bacterial cultures

PDF İndir

  1. Tez No: 904243
  2. Yazar: ALPER KENAN ERKMEN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. HADİYE DEMİRBAKAN
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2024
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Sanko Üniversitesi
  10. Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: 73

Özet

Karbapenemler, Gram negatif bakterilere karşı yüksek düzeyde etkinlik gösteren antimikrobiyal ajanlardır ve bu patojenlerin neden olduğu enfeksiyonların tedavisinde son seçenek olarak kullanılırlar. Ancak bu antibiyotiklerin yanlış ve aşırı kullanımı sonucunda karbapenem direncine sahip suşlar ortaya çıkmıştır. Son yıllarda Türkiye de dahil olmak üzere karbapenem dirençli suşlar dünya çapında artmaktadır. Oluşan bu direnç tedaviyi zorlaştırmaktadır. Özellikle karbapenemaz dirençli Klebsiella pneumoniae' nın %40-50 oranında ölüm oranına yol açması nedeniyle karbapenemazların hızlı ve doğru tanımlanmasını sağlamak, karbapenemaz üreten Enterobacterales türlerinin yayılmasını izlemek, önlemek tedavi için kritik öneme sahiptir. Karbapenemazların tespitinde Modifiye Hodge testi, karbapenemaz inaktivasyon yöntemi (CIM) ve CIM' in modifiye edilmiş versiyonu (mCIM), CarbaNP testi, MALDI-TOF MS, immünokromatografik lateral flow testi ve PCR gibi çeşitli fenotipik ve genotipik yöntemler vardır. CIM ve mCIM, sonuç için bir gece inkübasyon gerektirir ve bu testler yalnızca karbapenem hidrolizlerini tespit ederken enzim türünü belirleyemez. PCR, karbapenemaz tespiti için altın standart yöntem olarak kabul edilir. Ancak ek ekipman ve personele ihtiyaç duyulması PCR' ın laboratuvarlarda rutin olarak kullanımını kısıtlar. Son yıllarda karbapenemaz üreten Enterobacterales türlerini tanımlayabilen hızlı tanı testleri geliştirilmiştir. Bu çalışmada, Aralık 2021- Aralık 2023 tarihleri arasında iki yıllık süreçte laboratuvarda izole edilerek otomatize sistem ile EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) kriterlerine göre meropeneme dirençli (R) ve yüksek dozda duyarlı (I) saptanan, 54 K. pneumoniae izolatı, konvansiyonel PCR ve lateral flow hızlı test yöntemleriyle karbapenemazların varlığı açısından değerlendirilerek, iki yöntem sonuçları karşılaştırılmıştır. Çalışmamızda lateral flow (Coris BioConcept O.K.N.V.I. RESIST-5, Belçika) in vitro hızlı tanı testi; OXA-48, KPC, NDM ve VIM tipi karbapenemazları tespit etmede yüksek duyarlılık göstermiştir. Ancak literatürde belirtildiği üzere özellikle NDM ile ilgili yalancı negatif sonuçlarla karşılaşılabileceği akılda tutulmalıdır.

Özet (Çeviri)

Carbapenems are antimicrobial agents that exhibit high levels of effectiveness against Gram negative bacteria and are used as a last resort in the treatment of infections caused by these pathogens. However, due to the misuse and overuse of these antibiotics, strains resistant to carbapenems have emerged. In recent years, carbapenem-resistant strains have been increasing globally, including in Turkey. This resistance complicates treatment. It is critical to rapidly and accurately identify carbapenemases, particularly since carbapenemase-resistant Klebsiella pneumoniae is associated with a 40-50% mortality rate. Monitoring and preventing the spread of carbapenemase-producing Enterobacterales species is crucial for effective treatment. Various phenotypic and genotypic methods are available for the detection of carbapenemases, such as the Modified Hodge test, carbapenem inactivation method (CIM) and its modified version (mCIM), CarbaNP test, MALDI-TOF MS, immunochromatographic lateral flow test, and PCR. CIM and mCIM require overnight incubation and can only detect carbapenem hydrolysis but cannot determine the type of enzyme. PCR is considered the gold standard for carbapenemase detection; however, the need for additional equipment and personnel limits its routine use in laboratories. In recent years, rapid diagnostic tests capable of identifying carbapenemase-producing Enterobacterales species have been developed. In this study, 54 K. pneumoniae isolates which were isolated in the laboratory between December 2021 and December 2023 and identified as meropenem-resistant (R) and susceptible at high doses (I) according to EUCAST (European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing) criteria using an automated system were evaluated for the presence of carbapenemases using conventional PCR and lateral flow rapid test methods and the results of the two methods were compared. In our study, the in vitro rapid diagnostic test lateral flow (Coris BioConcept O.K.N.V.I. RESIST-5, Belgium) showed high sensitivity and specificity in detecting OXA-48, KPC, NDM and VIM-type carbapenemases. However, it should be kept in mind that false-negative results can occasionally occur with NDM.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    762176

    Enterobacterales türlerinde karbapenemaz üretiminin bd CPO panel ile araştırılması ve real time PCR yöntemiyle karşılaştırılması

    Investigation of carbapenemase production in enterobacterales species with BD CPO panel and comparison with real time PCR method

    BURAK KÜÇÜK

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    MikrobiyolojiKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MURAT ARAL

  2. Tez No

    781081

    Irak Salah Eldin Hastanesinde farklı kaynaklardan izole edilen Staphylococcus spp. direnç genlerinin genotiplendirilmesi ve tespiti

    Genotyping and detection of Staphylococcus spp. resistance genes isolated from different sources at Salah Eldin Hospital–Iraq

    ALHAMZAH QAHTAN NAJI NAJI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2022

    BiyolojiÇankırı Karatekin Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MELDA DÖLARSLAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ RAFEA ZAİDAN MUKHİLF ALSUGMAINY

  3. Tez No

    242512

    Bazik aminoasit türevlerinin transaktivatör transkripsiyon aktivitesi üzerine etkilerinin araştırılması

    Study of basic aminoacide derivatives that may effect tat transcription activity

    ESRA CAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyokimyaErciyes Üniversitesi

    Eczacılık Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN DEMİRHAN

  4. Tez No

    171730

    Kadın olgularda asemptomatik seyirli cinsel yolla bulaşan hastalıkların sıklığının araştırılması

    Investigation of frequency of sexually transmitted diseases showing no symptom in women

    SELMA SÖNMEZOĞLU MARAKLI

    Tıpta Uzmanlık

    Türkçe

    Türkçe

    2006

    DermatolojiÇukurova Üniversitesi

    Dermatoloji Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. ALPASLAN ACAR

  5. Tez No

    797151

    Lokal endemik Stachys euadenia P.H. Davis (Lamiaceae)'dan sentezlenen zno nanoparçacıkların antibakteriyel aktivitelerinin incelenmesi

    Investigation of antibacterial activities of zno nanoparticles synthesized from local endemic Stachys euadenia P.H. Davis (Lamiaceae)

    EMİNE ADAM

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    BiyoteknolojiSelçuk Üniversitesi

    Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MURAT YILDIRIM

    DOÇ. DR. CANAN BAŞLAK

Geri Dön