Metabolik mühendisliği yaklaşımı ile mayada likopenin mikrobiyal biyosentezi
Microbial biosynthesis of lycopene in yeast with a metabolicengineering approach
- Tez No: 907309
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ VENHAR ÇELİK ÖZGEN, DR. ÖĞR. ÜYESİ MUSA TARTIK
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Fırat Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 86
Özet
Antioksidan özellikleri, gıda ve ilaç endüstrilerindeki uygulamalarıyla yaygın olarak tanınan değerli karotenoidleri üretmek için mikrobiyal biyosentez umut verici bir yoldur. Mikrobiyal biyosentez ile özellikle likopen üretimi çevre dostu, uygun maliyetli ve sürdürülebilir bir seçenektir. Bu tez, metabolik yolları ve mühendislik tekniklerini optimize ederek Saccharomyces cerevisiae'da CRISPR-Cas9 teknolojisi kullanılarak likopen üretimini amaçlamaktadır. Fırat Üniversitesi Biyomühendislik Bölümü Sentetik Biyoloji ve Metabolik Mühendisliği Laboratuvarı arşivindeki pAC-EHER-EBIidiYZ plazmidinden elde edilen crtI-crtE-crtB-idi genleriyle S. cerevisiae'da likopen eldesi için modüller tasarlanmıştır. Kullanılan farklı suşlar (IMX581 ve MT04) ve modül kombinasyonlarının likopen üretimi üzerindeki etkileri yüksek performanslı sıvı kromatografisi (HPLC)'nin likopen seviyelerini ölçmesi ile değerlendirilmiştir. 96. saatte 0,712 mg/L likopen üretimi olurken 240. saatte ise 0,750 mg/L likopen üretimi HPLC de ölçülmüştür. Bu tez çalışmasında, hem maya metabolizması anlayışı ilerletmekle hem de metabolik mühendisliğinin sentetik biyoloji ile desteklenerek endüstriyel biyoteknoloji penceresine yeni bakış açıları katmaktadır.
Özet (Çeviri)
The microbial biosynthesis of valuable carotenoids, widely recognized for their antioxidant properties and applications in the food and pharmaceutical industries, offers a promising avenue for production. Particularly, lycopene production through microbial biosynthesis presents an environmentally friendly, cost-effective, and sustainable option. This thesis aims to optimize metabolic pathways and engineering techniques to enhance lycopene production in Saccharomyces cerevisiae using CRISPR-Cas9 technology. Modules designed for lycopene production in S. cerevisiae were constructed with the crtI-crtE-crtB-idi genes obtained from the pAC-EHER-EBIidiYZ plasmid archived in the Synthetic Biology and Metabolic Engineering Laboratory of the Department of Bioengineering at Firat University. The effects of different strains (IMX581 and MT04) and module combinations on lycopene production were evaluated by measuring lycopene levels using high-performance liquid chromatography (HPLC). At 96 hours, lycopene production was measured at 0.712 mg/L, while at 240 hours, lycopene production reached 0.750 mg/L as quantified by HPLC. This thesis contributes to advancing the understanding of yeast metabolism and bringing new perspectives to the industrial biotechnology field by combining metabolic engineering with synthetic biology.
Benzer Tezler
- Making use of synthetic biology toolbox for industrial biotechnology applications: The case of enzyme production
Endüstriyel biyoteknoloji uygulamaları için sentetik biyoloji gereç kutusunun kullanımı: Enzim üretimi
FİLİZ ERÇELİK
Doktora
İngilizce
2022
BiyoteknolojiYeditepe ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ İLKEM EMRAH NİKEREL
- Genomic analysis of freeze-thaw stress-resistant Saccharomyces cerevisiae
Donma-erime stresine dirençli Saccharomyces cerevisiae'nin genomik analizi
ÇAĞLA GÜNEY
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Functional analysis of the genes in the glucose metabolic network by a system based modular approach
Glikoz metabolik ağındaki genlerin sistem bazlı modüler yaklaşım ile işlevsel analizi
OKAN YÜZÜAK
Yüksek Lisans
İngilizce
2012
BiyomühendislikBoğaziçi ÜniversitesiKimya Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BETÜL KIRDAR
YRD. DOÇ. DR. ELİF ÖZKIRIMLI ÖLMEZ
- Chronological lifespan analysis of stress-resistant yeasts
Strese dirençli mayaların kronolojik yaşam sürelerinin analizi
ASLI NUR AKAYDIN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR
- Evolutionary engineering of rapamycin-resistant yeast
Evrimsel mühendislikle rapamisine dirençli maya eldesi
ÖMER ESEN
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR