Fakültatif C4-CAM fotosentetik metabolizmasına sahip Portulaca oleracea bitkisinin abiyotik stres koşulları altında redoks sinyal yolaklarının araştırılması
Investigation of redox signaling pathways of Portulaca oleracea with facultative C4-CAM photosynthetic metabolism under abiotic stress condition
- Tez No: 913477
- Danışmanlar: PROF. DR. İSMAİL TÜRKAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Genel Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bitkilerde karbon ve su kullanımının ve dolayısıyla fotosentez sürecinin optimizasyonu, iklim değişikliği sürecinde giderek ısınan ve kuraklaşan dünyada önemli hayatta kalma stratejileridir. Bu stratejiler doğrultusunda bitkiler CO2 derişiminin arttırılması sürecinin mekansal (C4) veya zamansal (Crassulacean Asit Metabolizması, CAM) ayrımına izin veren iki ana karbon konsantrasyon mekanizması (CCM) geliştirmiştir. Her ne kadar, genel olarak uyumsuz iki mekanizma olarak kabul edilseler de bu tez çalışmasının hedef bitkisi olan Portulaca oleracea, fakültatif C4-CAM fotosentetik metabolizmasına sahip istisna bir türdür. Oksijen, hücre metabolizmasında ve yaşam aktivitelerinde önemli rol oynayan, canlı organizmaların varlığı ve gelişimi için vazgeçilmez bir moleküldür. Ancak toplu olarak reaktif oksijen türleri (ROS) olarak bilinen oksijen türevleri başta fotosentez ve solunum olmak üzere birçok fizyolojik reaksiyon sırasında üretilmekte ve toksik doğaları nedeniyle potansiyel zarar oluşturmaktadır. Potansiyel olarak zararlı etkilerine rağmen, ROS aynı zamanda canlı organizmalarda çok sayıda süreci düzenleyen sinyal molekülleri olarak da işlev görür. Bir C4 bitkisi olan P. oleracea'nın, kuraklık stresine veya fotoperiyottaki değişikliklere yanıt olarak CAM'ı indükleyebildiği gösterilmiştir. Çoğunlukla transkriptomik çalışmaların gerçekleştirildiği bu bitki ve sahip olduğu bu mekanizma çeşitli abiyotik stres koşulları altında C4 ve CAM fotosentetik mekanizmaları arasındaki karmaşık etkileşimi anlayabilmemiz için bize yeni fırsatlar sunmaktadır. Dolayısıyla, fakültatif C4-CAM fotosentetik metabolizmasına sahip hedef bitki P. oleracea'nın abiyotik stres koşulları altında redoks sinyal yolaklarının nasıl etkilendiğini araştırmak, bitkinin stres tolerans mekanizmalarını anlamamızda oldukça önemlidir. Bu çalışma kapsamında fotosentetik elektron taşıyıcılarındaki redoks değişimlerinin, mitokondrilerde oluşturulan ROS'un ve eksojen olarak uygulanan H2O2'nin P. oleracea'da C4-CAM geçişinin düzenlenmesindeki olası rollerinin belirlenmesi hedeflenmiştir. Bu hedefler doğrultusunda rotenon, metil viyolojen ve H2O2 uygulanan bitki yapraklarında olası CAM indüklenmesinin belirteci olarak total asidite analizi gerçekleştirilmiş ve C4-CAM metabolizmalarından sorumlu genlerin ifadeleri analiz edilmiştir. Bunların yansıra klorofil floresans ölçümleri yapılmış, bağıl su içerikleri belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
Optimizing carbon and water usage in plants, and thereby the process of photosynthesis, are important survival strategies in a world increasingly affected by climate change, characterized by rising temperatures and drought. In line with these strategies, plants have developed two main carbon concentration mechanisms (CCMs) that allow for spatial (C4) or temporal (Crassulacean Acid Metabolism, CAM) separation, enabling the enhancement of CO2 uptake. Although generally regarded as incompatible mechanisms, the target plant of this thesis, Portulaca oleracea, is an exceptional species with facultative C4-CAM photosynthetic metabolism. Oxygen is a crucial molecule in cellular metabolism and life activities. However, collectively known as reactive oxygen species (ROS), oxygen derivatives produced during various physiological reactions, such as photosynthesis and respiration, can pose potential harm due to their toxic nature. Despite their potentially harmful effects, ROS also function as signalling molecules regulating numerous processes in living organisms. P. oleracea, a C4 plant, has been shown to induce CAM in response to drought stress or changes in photoperiod. This plant, often studied through transcriptomic research, and its mechanism provide new opportunities to understand the complex interaction between C4 and CAM photosynthetic mechanisms under various abiotic stress conditions. Therefore, investigating how redox signalling pathways are affected in P.oleracea with facultative C4-CAM photosynthetic metabolism under abiotic stress conditions is crucial for understanding the plant's stress tolerance mechanisms. In this study, the potential roles of redox changes in photosynthetic electron carriers, ROS generated in mitochondria, and exogenously applied H2O2 in regulating C4-CAM transition in P. oleracea are aimed to be determined. Total acidity analysis has been conducted as an indicator of possible CAM induction in plant leaves treated with Rotenone, Methyl viologen, and H2O2, and the expressions of genes responsible for C4-CAM metabolisms have been analysed. Additionally, chlorophyll fluorescence measurements and relative water contents have been determined.
Benzer Tezler
- İdrar yolu enfeksiyonu hastalarından Citrobacter spp türlerinin izolasyonu ve tanımlanması
Isolation and identification of Citrobacter spp from urinary tract infection patients
RAYA SFOOG NAYEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiÇankırı Karatekin ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ORAL DÜZDEMİR
PROF. DR. IKRAM ABBAS ABOUD AL-SAMARRAAY
- Türkiye'de pirinç biti sitophilus oryza(L.)(Curculionidae:Coleoptera) popülasyonlarında moleküler tanı yöntemleri kullanarak endosimbiyont bakterilerin belirlenmesi
Determination of endosymbiotic bacteria using molecular diagnostic methods in rice weewil sitophilus oryzae (L.) (Curculionidae: Coleoptera) populations across Turkey
MEHMET OĞUZ YAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
ZiraatIsparta Uygulamalı Bilimler ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERHAN KOÇAK
- Candida albicans ile ağız florasında bulunan bazı fakültatif anaerop bakterilerin ilişkilerinin in vitro deneylerle araştırılması
In vitro research of interactions between candida albicans and some facultative anaerobic bacteria of the mouth flora
EMİNE HOŞAF
Yüksek Lisans
Türkçe
1998
MikrobiyolojiMarmara ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NİLGÜN ÇERİKÇİOĞLU
- Akvaryum suyu kökenli citrobacter freundii izolatlarının fenotipik ve moleküler karakterizasyonu
Phenotypical and molecular characterization of citrobacter freundi̇i̇ isolates of aquarium water origin
ŞENOL BASTEM
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiSu Ürünleri Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERTAN EMEK ONUK
- Fermente süt ürünlerinden izole edilen laktik asit bakterilerinin antibiyotik dirençliliklerinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle belirlenmesi
Determination of antibiotic resistance in lactic acid bacteria isolated from fermented dairy products by phenotypic and genotypic methods
MELİHCAN ÖZTEBER
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
MikrobiyolojiAdnan Menderes ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. GAMZE BAŞBÜLBÜL ÖZDEMİR