Gastrointestinal şikâyeti olan hastalarda bağırsak patojeni protozoonların prevalansının mikroskopi ve multipleks real-time PCR ile araştırılması
Investigation of the prevalence of pathogenic intestinal protozoans in patients with gastrointestinal complaints via microscopy and multiplex real-time PCR
- Tez No: 916480
- Danışmanlar: PROF. DR. ÖZDEN BORAL, PROF. DR. GÜLAY İMADOĞLU YETKİN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Parazitoloji, Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji, Microbiology, Parasitology, Infectious Diseases and Clinical Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Bağırsak patojenleri, Mikroskopi, PCR, Prevalans, Protozoonlar, Intestine pathogens, Microscopy, Prevalence
- Yıl: 2024
- Dil: Türkçe
- Üniversite: İstanbul Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmanın amacı, hem gastrointestinal şikâyeti olan hastalarda bağırsak patojeni protozoonların prevalansını tespit ederek sürveyans verilerine katkı sağlamak hem de mikroskopi ve multipleks real-time PCR yöntemlerinin performansını karşılaştırmalı olarak değerlendirmektir. Çalışmaya, en az bir gastrointestinal şikâyeti olan 40 yetişkin (18 yaş ve üzeri) ve 40 çocuk (5-12 yaşları arasında) gönüllü hasta dâhil edilmiştir. Her hastadan günaşırı olarak üç kez alınan gaita örnekleri; Nativ-Lugol, modifiye formol-eter çöktürme, Wheatley'in trikrom boyama ve modifiye Ziehl-Neelsen boyama teknikleri uygulandıktan sonra ışık mikroskobunda incelenmiştir. Ayrıca, ilk olarak alınan gaita örnekleri, DNA ekstraksiyon prosedürü uygulandıktan sonra Allplex™ GI Parasite Assay paneli kullanılarak multipleks real-time PCR ile test edilmiştir. Mikroskopi ve multipleks real-time PCR yöntemlerinin duyarlılıkları ve özgüllükleri arasındaki farklılıklar, Fisher'in kesin ki-kare testiyle analiz edilmiştir. p değerinin <0,05 olması, istatistiksel olarak anlamlı kabul edilmiştir. Bağırsak patojeni protozoonların prevalansının yetişkin grubunda %25, çocuk grubunda ise %35 olduğu belirlenmiştir. Yöntemlerin duyarlılıkları ve özgüllükleri arasında istatistiksel olarak anlamlı bir farklılık gözlemlenmemiştir (p = 0,999). Allplex™ GI Parasite Assay paneli kullanılarak gerçekleştirilen multipleks real-time PCR yönteminin performansının yalnızca ilk örneğin test edilmesiyle bile etkili bulunmuş olması, bu yöntemin bağırsak patojeni protozoonların rutin tanısında kullanılabileceğini düşündürmektedir.
Özet (Çeviri)
This study aimed to contribute to surveillance data by determining the prevalence of pathogenic intestinal protozoans in patients with gastrointestinal complaints and by comparatively evaluating the performance of microscopy and multiplex real-time PCR methods. Forty adults (18 years and older) and 40 children (aged 5 to 12 years), all of whom had at least one gastrointestinal complaint and who volunteered, were included in the study. Three stool samples, collected every other day from each patient, were examined under a light microscope using Native-Lugol, modified formol-ether concentration, Wheatley's modified trichrome staining, and modified Ziehl-Neelsen staining techniques. In addition, the first stool samples were tested using multiplex real-time PCR with the Allplex™ GI Parasite Assay panel after DNA extraction. Differences in the sensitivities and specificities of the methods were analysed using Fisher's exact test. A p-value of <0.05 was considered statistically significant. The prevalence of pathogenic intestinal protozoans was determined to be 25% in adults and 35% in children. No statistically significant differences in the sensitivities or specificities between the methods were observed (p = 0.999). The performance of multiplex real-time PCR using the Allplex™ GI Parasite Assay panel was found to be effective even with just the first sample tested, suggesting that this method could be used for the routine diagnosis of pathogenic intestinal protozoans.
Benzer Tezler
- Kronik ürtikerli hastaların odağı yönünden değerlendirilmesi
To assessment in respect to focus of infection the patients with chronic urticaria
MUSTAFA KULAÇ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2002
Dermatolojiİstanbul ÜniversitesiDermatoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. ESEN ÖZKAYA BAYAZIT
- Kronı̇k kabızlık şı̇kayetı̇ olan hastalarda Lactobacıllus rhamnosus GG suşu ve hı̇drolı̇ze guar gum'ın klı̇nı̇k seyı̇r ve bağırsak mı̇krobı̇yotası üzerı̇ne etkı̇lerı̇
Effects of Lactobacillus rhamnosus GG and hydrolyzed guar gum suspension on clinical course and intestinal microbiota in patients with chronic constipation complaints
ŞADİYE ELİF ÇETİN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıSağlık Bilimleri ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ŞİRİN GÜVEN
- Sağlık Bilimleri Üniversitesi Van Eğitim ve Araştırma Hastanesine gastrointestinal şikayetlerle başvuran hastalarda bağırsak parazitlerinin yayılışı
Prevalence of intestinal parasites in patients applying to Health Sciences University Van Training and Research Hospital with gastrointestinal complaints
CANSU GÜNAY
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ParazitolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiParazitoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ ABDURRAHMAN EKİCİ
- Dispeptik şikayetleri olan hastalarda helicobacter pylori ile zonulin arasındaki ilişki
The relationship between helicobacter pylori and zonulin in patients with dispeptic complaints
SAADET YILMAZ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2020
İç HastalıklarıOrdu Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. YASEMİN KAYA
- Türkiyede irritabl barsak sendromunun gastroösofajeal reflu şikayeti olan hastalardaki birlikteliği ve muhtemel etkenleri
The frequency of irritable bowel syndrome in Turkish gastroesofageal reflux disease patients with possible causes and clinicopathological associations
MURAD EL-HELİAWİ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
GastroenterolojiHacettepe Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BÜLENT SİVRİ