Akciğer kanserinde adaptif ekstraselüler pH değişikliklerinde COL10A1 ve SOX9 gen ifadelerinin değişiminin incelenmesi
Investigation of changes in COL10A1 and SOX9 gene expressions in adaptive extracellular pH changes in lung cancer
- Tez No: 918665
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ SEDEF HANDE AKTAŞ, DOÇ. DR. DİLARA FATMA AKIN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2023
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji ve Biyogüvenlik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 100
Özet
Akciğer kanseri insidansı ve mortalitesi tüm kanserler içinde ilk sırada yer almaktadır. Hastalık lokalize olduğunda beş yıllık sağkalımın %56 olduğu, metastaz varlığında ise bu sağkalımın sadece %5 olduğu ifade edilmektedir. Metastaz kanser prognozu açısından önemli bir patofizyolojik olaydır. Bu nedenle özellikle metastaza neden olan etmenlerin analizi hastalık özelinde son derece önemlidir. Epitelyal mezenkimal geçişin metastaza katkı sağladığı ve ekstraselüler matriksin yeniden şekillenmesinde önemli etkilerinin olduğu yapılan çalışmalarla ortaya koyulmuştur. Bu patofizyolojik durumda ise ekstraselüler matriksin önemli bileşeni olan kolajen ailesinden farklı genlerin ifadesinin pek çok kanser türünde bir biyobelirteç olarak değerlendirildiği bilinmektedir. Güncel araştırmalar COL10A1 geninin promotörü üzerinde SOX9'un bağlandığı bir bölgenin mevcut olduğunu ve bu bağlanmanın COL10A1 ifadesinin artışına neden olarak epitelyal mezenkimal geçişte rolü olduğunu ortaya koymuştur. Mevcut araştırmada akciğer metastazı için önemli değişimlerden biri olan epitelyal mezenkimal geçişe neden olduğu ifade edilen ve aynı zamanda ekstraselüler matriksin önemli bir bileşeni olan kolajen ailesinden COL10A1 ve hem epitelyal mezenkimal geçişte rolü olduğu olduğu bilinen hem de COL10A1'in yukarı regülatörü olan SOX9 genlerinin ifade değişimleri asidik tümör ortamında incelenmiştir. Bu amaçla, A549 akciğer adenokarsinom hücre hattında belirli pH seviyeleri oluşturularak kanser hücrelerinin oluşturulan pH seviyelerine adaptif hale gelmesi sağlanmıştır. Oluşturulan farklı adaptif pH seviyeleri de SOX9, COL10A1 gen ifade seviyeleri eş zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu kullanılarak analiz edilmiştir. Epitelyal mezenkimal geçişte bir epitelyal belirteç olan CDH1 geni ve mezenkimal belirteç olan VIM geni ifadesi ile araştırılmıştır. Ayrıca farklı adaptif pH koşullarında hücre proliferasyonu ve hücre göçü analizleri gerçekleştirilmiştir. Sonuç olarak, sağlıklı akciğer hücreleri ile kıyaslandığında araştırılan genler olan COL10A1 ve SOX9 genlerinin ve epitelyal mezenkimal geçişin analizi için kullanılan CDH1 ve VIM genlerinin adaptif pH 7.0 seviyelerindeki ifadeleri dikkat çekicidir.
Özet (Çeviri)
The incidence and mortality of lung cancer ranks first among all cancers. When the disease is localised, the five-year survival rate is 56%, whereas this rate is only 5% in the presence of metastasis. Metastasis is an important pathophysiological event in terms of cancer prognosis. For this reason, the analysis of the factors causing metastasis is extremely important for the specific disease. Studies have shown that epithelial mesenchymal transition (EMT) contributes to metastasis and remodelling of extracellular matrix (ECM) has important effects. In this pathophysiological situation, it is known that the expression of different collagen families, which are important components of the extracellular matrix, is evaluated as a biomarker in many cancer types. Recent studies have revealed that there is a region on the promoter of COL10A1 gene where SOX9 binds and this binding causes an increase in COL10A1 expression and plays a role in epithelial mesenchymal transition. In the present study, the expression changes of COL10A1, a member of the collagen family, which is also an important component of the ECM and is expressed to cause epithelial mesenchymal transition (EMT), which is one of the important changes for lung metastasis, and SOX9 genes, which are both known to be involved in EMT and up-regulator of COL10A1, were examined in acidic tumour environment. For this purpose, certain pH levels were created in the A549 lung adenocarcinoma cell line and cancer cells were adapted to the pH levels created. SOX9, COL10A1 gene expression levels at different adaptive pH levels were analyzed using simultaneous polymerase chain reaction. EMT was investigated by expression of CDH1 gene, an epithelial marker, and VIM gene, a mesenchymal marker. Cell proliferation and cell migration were also analyzed under different adaptive pH conditions. As a result, compared to healthy lung cells, the expression of the investigated genes COL10A1 and SOX9 and the CDH1 and VIM genes used for the analysis of EMT transition at adaptive pH 7.0 levels is remarkable.
Benzer Tezler
- Kötü prognostik faktörlere sahip lokal ileri evre veya metastatik küçük hücreli dışı akciğer kanserinde (khdak) palyasyonun sağlanmasında 10 x 3 gy radyoterapi şemasında tümör volüm değişikliklerinin retrospektif olarak değerlendirilmesi
Retrospectively analysis of tumor volume changes with 10x3 gy radiotherapy schema in providing palliation of patients with poor prognostic factors in locally advanced stage or metastatic nsclc
EVRİM DUMAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
OnkolojiAkdeniz ÜniversitesiRadyoloji Onkolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MELEK NUR YAVUZ
- Mesane kanserinde Toll-benzeri reseptörlerin ekspresyon profillerinin belirlenmesi
Determination of expression profiles of Toll-like receptors in bladder carcinoma
SEDA SABAH ÖZCAN
Doktora
Türkçe
2014
Tıbbi BiyolojiPamukkale ÜniversitesiTıbbi Biyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. VİLDAN CANER
- Pankreas kanserinde Toll-like reseptör 4 (TLR4) yolağının immün check-point VISTA üzerindeki etkilerinin araştırılması
Investigation of the effects of Toll-like receptor 4 (TLR4) pathway on immune check-point VISTA in pancreatic cancer
KÜBRA SENA BAŞ TOPCU
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
OnkolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ EMİNE NEDİME KORUCU
- Doğal lenfoid hücre grubu 2'lerin küçük hücre dışı akciğer kanser mikroçevresinde bulunan CD4+T hücrelerine olası etkilerinin araştırılması
Study of the role of innate lymphoid cell group 2 (İLC2) on cd4+ t cells in the microenvironment of non-small cell lung cancer (NSDLC)
ILHAM BAHHAR
Doktora
Türkçe
2023
Allerji ve İmmünolojiİstanbul Medipol ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ FAY CELESTE MAGNUSSON
- Küçük hücreli akciğer kanserinin 3 boyutlu konformal radyoterapi uygulamalarında adaptif radyoterapinin rolü
Role of adaptive radiotherapy during the application of three-dimensional conformal radiation therapy for small cell lung cancer
BEYZA ŞİRİN ÖZDEMİR
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2010
OnkolojiAkdeniz ÜniversitesiRadyasyon Onkolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALİ AYDIN YAVUZ