Geri Dön

Türkiye'de yayılış gösteren Salvia L. cinsinin bazı türlerinin iPBS-retrotranspozon DNA markörleri ile genetik çeşitliliğin belirlenmesi

Determination of genetic diversity of some species of the genus Salvia L. distributed in Turkey using iPBS-retransposon DNA markers

PDF İndir

  1. Tez No: 921845
  2. Yazar: ESRA NUR ÇİFTCİ
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. DENİZ ULUKUŞ, DOÇ. DR. ARAS TÜRKOĞLU
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Genetik, Biyoteknoloji, Biyoloji, Genetics, Biotechnology, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Filogenetik, Moleküler genetik, PCR, Phylogenetic, Molecular genetic
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Selçuk Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Biyoteknoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu tez çalışması, Türkiye'de yayılış gösteren Salvia cinsine ait 25 türdeki toplam 96 genotipin genetik çeşitliliğini iPBS-retrotranspozon DNA markörleri kullanarak belirlemeyi amaçlamaktadır. Araştırmada, iPBS işaretçileri ile genotiplerin genetik yapıları incelenmiş ve türler arasındaki genetik farklılıklar analiz edilmiştir. Çalışma kapsamında kullanılan 83 iPBS primerinden 16'sı analizlere uygun bulunmuş ve bu primerler toplam 255 bant üretmiştir. Primer başına gözlemlenen allel sayısı 21 ile 63 arasında değişirken, ortalama polimorfizm bilgi içeriği (PIC) değeri 0.414 olarak hesaplanmıştır. Genetik çeşitlilik analizi sonucunda ortalama etkin allel sayısı (ne) 1.666, genetik çeşitlilik indeksi (h) 0.397 ve Shannon bilgi indeksi (I) 0.585 olarak bulunmuştur. Elde edilen veriler NTSYSpc (Dice benzerlik matrisi), POPGEN1.32 ve STRUCTURE yazılımları kullanılarak detaylı şekilde analiz edilmiştir. Kümeleme analizi ve temel bileşen analizi (PCoA), genotipleri genetik benzerliklerine göre gruplandırmıştır. Genetik yapı analizi, genotiplerin popülasyon düzeyinde üç farklı alt gruba ayrıldığını göstermiştir. Sonuçlar, iPBS-retrotranspozon markörlerinin, Salvia türlerinin genetik çeşitliliğini aydınlatmada etkili bir yöntem olduğunu göstermektedir. Çalışma, Salvia cinsine yönelik genetik, filogenetik ve koruma odaklı çalışmalara değerli bilgiler sunmakta ve bu alandaki araştırmalar için bir temel oluşturmaktadır

Özet (Çeviri)

This thesis study aims to determine the genetic diversity of 96 genotypes belonging to 25 species of the Salvia genus distributed in Turkey using iPBS-retrotransposon DNA markers. The genetic structures of the genotypes were examined using iPBS markers, and genetic differences between the species were analyzed. Among the 83 iPBS primers used in the study, 16 were deemed suitable for analysis, producing a total of 255 bands. The observed allele number per primer ranged from 21 to 63, with an average polymorphism information content (PIC) value of 0.414. The genetic diversity analysis revealed an average effective allele number (ne) of 1.666, a genetic diversity index (h) of 0.397, and a Shannon information index (I) of 0.585. The data were thoroughly analyzed using NTSYSpc (Dice similarity matrix), POPGEN1.32, and STRUCTURE software. Cluster analysis and principal coordinate analysis (PCoA) grouped the genotypes based on their genetic similarities. Genetic structure analysis demonstrated that the genotypes were divided into three distinct subgroups at the population level. The results indicate that iPBS-retrotransposon markers are an effective method for elucidating the genetic diversity of Salvia species. This study provides valuable insights into genetic, phylogenetic, and conservation-oriented studies on the Salvia genus, establishing foundation for future research in this field.

Geri Dön