Sığır orijinli Bacillus anthracis izolatlarının antibiyotik direnç profillerinin ve multiple-locus varıable-number tandem repeat analysıs yöntemi ile genotiplerinin belirlenmesi
Determination of antibiotic resistance profiles and genotypes of bovine originated Bacillus anthracis isolates by multiple-locus variable-number tandem repeat analysis method
- Tez No: 929650
- Danışmanlar: PROF. DR. TİMUR GÜLHAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Veteriner Hekimliği, Veterinary Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Veteriner Mikrobiyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 77
Özet
Bu çalışmada 229 şarbon şüpheli sığır numunesi konvansiyonel metotlarla izole ve identifiye edildi. İzolatlar RT-PCR ile moleküler olarak identifiye edildi ve MLVA25 metodu kullanarak genotiplendirildi. 36 izolat, 4 genotip grubunda dağılım gösterdi, 1. genotip grubu içerisinde sadece Tokat ilinden izole edilen bir suş yerleşim gösterdi. Sivas ve Kayseri illerinde tespit edilen 5 adet izolat ile GG-I içerisinde Tokat ilinden izole edilen suş ile benzer profilde olduğu belirlendi. 1'i Tokat ve 2'si Samsun izolatlarının oluşturduğu GG-II grubunun MLVA'ya göre genetik profili Güney Afrika, Almanya, İtalya ve Avusturya'da izole edilen suşlar ile genetik yakınlığı saptandı. GG-III içerisinde bulunan izolatların Fransa ve İtalya ülkelerinde izole edilen suşlar ile Türkiye'den Sivas ve Mersin illerinden izole edilen suşlar ile benzer genotipik profile sahip olduğu belirlendi. Araştırmada tespit edilen en geniş genotip grubu GG-IV grubu içerisinde bulunan suşların Namibya, Fransa, İtalya ülkelerinden ve Türkiye'de ise Sivas ve Kayseri illerinden izole edilen suşların genotip profilleri ile benzer profilde oldukları tespit edildi. 36 izolatın 5'i (% 13,88) tüm antibiyotiklere duyarlı olup, 21'i (% 58,33), 8'i (% 22,22), 6'sı (% 16,66), 3'ü (% 8,33), 2'si (% 5,55) ve 1'i (% 2,77) sırasıyla sefotaksim, tigesiklin, penisilin, gentamisin, doksisiklin ve eritromisine dirençli bulundu. İzolatların tamamının (% 100) siprofloksasin, vankomisin, levofloksasin, linezolid ve daptomisine karşı duyarlı olduğu tespit edildi. Bölgedeki mihraklardan izole edilen B. anthracis izolatlarında MLVA25 sonucuna göre yaygın genotipin GG-IV olduğu görüldü ve ülkemizden ve Avrupa ülkelerinden bildirilen genotip profillerine benzer olduğu tespit edildi. Penisiline karşı hayvan izolatlarında görülen dirençli suşların dikkat çekici olduğu, bu durumun da yüksek olasılıkla hayvanlarda bilinçsiz antibiyotik kullanımı ile yakından ilişkili olduğu değerlendirildi.
Özet (Çeviri)
In this study, 229 anthrax suspected cattle samples were isolated and identified by conventional methods. The isolates were molecularly identified by RT-PCR and genotyped using the MLVA25 method. 36 isolates were distributed in 4 genotype groups, and only one strain isolated from Tokat province was located in the 1st genotype group. It was determined that 5 isolates detected in Sivas and Kayseri provinces had a similar profile to the strain isolated from Tokat province in GG-I. The genetic profile of the GG-II group, consisting of 1 isolate from Tokat and 2 isolates from Samsun, was determined to be genetically related to strains isolated in South Africa, Germany, Italy and Austria according to MLVA. It was determined that the isolates in GG-III had a similar genotypic profile to strains isolated in France and Italy and to strains isolated from Sivas and Mersin provinces in Turkey. The largest genotype group detected in the study, the GG-IV group, was found to have a similar genotype profile to the strains isolated from Namibia, France, Italy and Sivas and Kayseri provinces in Turkey. Of the 36 isolates, 5 (13.88%) were susceptible to all antibiotics, 21 (58.33%), 8 (22.22%), 6 (16.66%), 3 (8.33%), 2 (5.55%) and 1 (2.77%) were resistant to cefotaxime, tigecycline, penicillin, gentamicin, doxycycline and erythromycin, respectively. All isolates (100%) were found susceptible to ciprofloxacin, vancomycin, levofloxacin, linezolid and daptomycin. According to the MLVA25 result, the prevalent genotype in B. anthracis isolates isolated from outbreaks in the region was GG-IV and it was found to be similar to the genotype profiles reported from our country and European countries. It was evaluated that the resistant strains seen in animal isolates against penicillin were remarkable and that this situation was most probably closely related to the unconscious use of antibiotics in animals.
Benzer Tezler
- Türkiye'de insan ve hayvan orijinli bacillus anthracis izolatlarının multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA-31) ile moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of bacillus anthracis isolates of human and animal origin by multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis (MLVA-31) in Turkey
SÜLEYMAN YALÇIN
Doktora
Türkçe
2022
Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BARIŞ SAREYYÜPOĞLU
PROF. DR. SELÇUK KILIÇ
- İnsan ve sığır orijinli Staphylococcus aureus suşlarının çeşitli biyokimyasal özellikleri ile antibiyotiklere duyarlılıklarının karşılaştırılması
A Comparison of chemical properties and antibiotic suceptibility of staphylococcus aureus strains of human and bovine origin
TİMÜR GÜLHAN
Yüksek Lisans
Türkçe
1998
Veteriner HekimliğiYüzüncü Yıl ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BANUR BOYNUKARA
- Sığır orjinli Lactobacillus spp., Enterococcus faecium ve Escherichia coli izolatlarının probiyotik özelliklerinin belirlenmesi
Determination of probiotic properties of Bovine originated Lactobacillus spp., Enterococcus faecium and Escherichia coli isolates
EMİNE ÇAKIRTAŞ
Doktora
Türkçe
2024
MikrobiyolojiOndokuz Mayıs ÜniversitesiMikrobiyoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TİMUR GÜLHAN
- Mastitisli inek sütlerinden izole edilen streptokok ve stafilokok etkenlerinde genetik polimorfizmin araştırılması
Investigation of genetic polymorphisms in Streptococcus and Staphylococcus agents isolated from bovine milk samples
MURAT KARAHAN
Doktora
Türkçe
2005
MikrobiyolojiFırat ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BURHAN ÇETİNKAYA
- Koyun keçi çiçek aşısının Mdbk hücre kültüründe üretilmesi ve Lumpy Skin Disease'e karşı sığırlarda bağışıklık çalışması
Propagation of sheep and goat pox vaccine in MDBK cell culture and immunity study in cattle against Lumpy Skin Disease
SERDAR UZAR
Doktora
Türkçe
2019
Veteriner Hekimliğiİstanbul Üniversitesi-CerrahpaşaViroloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NURİ TURAN