Southern analysis of Torula thermophila genome for the multiplicity of cellulase genes
Torula thermophila genomunun selülaz gen çokluğunun tespitine yönelik southern izleştirme analizi
- Tez No: 93427
- Danışmanlar: DOÇ.DR. ZÜMRÜT B. ÖGEL, PROF.DR. UFUK GÜNDÜZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Selülaz, gen çokluğu, T. thermophila, S. thermophilum, Genler, Torula thermophila, Cellulase, gene multiplicity, T. thermophila, S. thermophilum IV, Genes, Torula thermophila
- Yıl: 2000
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada Torula thermophiîa selülaz genlerinin sayısının bu genlere özgün gen sondalan kullanılarak tespiti amaçlanmıştır. Buna yönelik olarak 100 baz çiftlik Polimeraz Zincir Tepkimesi ürünü T. reesei de Southern izleştirme yöntemiyle selülazlara özgünlüğü açısından analiz edilmiştir. Bu aşamada T. reesei endoglukanaz III geni ile homolog T. thermophiîa 100 baz çiftlik DNA fragmanı ile de heterolog izleştirme yapılmış ve bu DNA fragmanının T. thermophiîa selulaz genlerine özgünlüğü doğrulanmıştır. Selulaz genlerinin çokluğu ise T. thermophiîa da lOObp selülaz spesifik gen sondası kullanılarak homolog Southern genom izleştirmesi ile gösterilmiştir. Bunlara ek olarak 100 baz çiftlik selülaz spesifik gen sondası T. thermophiîa toplam RNA sı ile de hetrolog izleştirmeye tabi tutulmuştur.Bu analizin sonucu gen sondasının selulaz genlerinin ifade edilen bölgesine ait olduğunu göstermiş ve selülazlara özgünlüğünü doğrulamıştır.
Özet (Çeviri)
The objective of this study was analyzing of the Torula thermophila genome to determine the number of the cellulase genes with a cellulase specific probe. To achieve this the 100 bp PCR product of T. thermophila was firstly analyzed with Southern hybridisation of Trichoderma reesei with respect to its specificity. The similarity of hybridisation patterns of endoglucanase III gene of T. reesei and lOObp probe on T. thermophila indicates the specificity of the probe to cellulase genes. Multiplicity of cellulases was shown by the homologous genomic hybridisation of T. thermophila with lOObp cellulase specific probe. By performing RNA dot blot heterologous analysis with the lOObp DNA fragment of T. thermophila, specificity of the probe was confirmed and it was shown that the probe is belong to the expressed region of cellulases.
Benzer Tezler
- Trabzon Orman Bölge Müdürlüğü Torul Orman İşletme Müdürlüğü Alacadağ Orman İşletme Şefliği Saf kayın (Fagus orientalis L.) meşcerelerindeki kök ve toprak kütlesi değişimlerinin belirlenmesi
Determining the change of root and soil biomass for Fagus orientalis L. stand in Alacadag Forest Management Chiefdom of Torul Management directorate of Trabzon Regional Directorate of Forestry
ELİF KARTAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2013
Ormancılık ve Orman MühendisliğiKaradeniz Teknik ÜniversitesiOrman Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. LOKMAN ALTUN
- Sorgun Vadisi (Mersin/İçel) briyofit florası
The bryophyte flora of Sorgun Valley ((Mersin/İçel)
MEHMET DÜZGÜN
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
BiyolojiNevşehir Hacı Bektaş Veli ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RECEP KARA
- Analysis of polyphenol oxidase production by southern pine beetle associated fungi
Çam böceği ile ortak yaşam süren funguslarda polifenol oksidaz enzimi üretimi analizi
ABDUVALİ VALİEV
Yüksek Lisans
İngilizce
2007
Gıda MühendisliğiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZÜMRÜT BEGÜM ÖGEL
- Analysis of relations between the the Southern Caucasus states, Turkey, EU
Güney Kafkasya ülkeleri, Türkiye ve Avrupa Birliği ilişkilerinin analizi
İHSAN MURAT TANBOĞA
Yüksek Lisans
İngilizce
2010
Uluslararası İlişkilerMarmara ÜniversitesiAvrupa Birliği Siyaseti ve Uluslararası İlişkiler Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. İDİL TUNCER KILAVUZ
- Analysis of annual moisture changes in forest soils on the southern and northern slopes of the pieniny national park – poland
Polonya'daki pieniny milli parkı'nın güney ve kuzey yamaçlarındaki orman topraklarındaki yıllık nem değişimlerinin analizi
FARADY BANGANA
Yüksek Lisans
İngilizce
2025
ZiraatOndokuz Mayıs ÜniversitesiToprak Bilimi ve Bitki Besleme Ana Bilim Dalı
PROF. DR. TOMASZ ZALESKİ
PROF. DR. COŞKUN GÜLSER