Nadir konjenital nötropenilerde somatik ve kalıtsal genetik nedenlerin araştırılması
Investigation of somatic and hereditary genetic causes in rare congenital neutropenias
- Tez No: 937145
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ ARDA ÇETİNKAYA
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Genetik, Genetics
- Anahtar Kelimeler: Konjenital nötropeni, harman fenotip, ACKR1/Duffy ilişkili nötropeni (ADAN), Congenital neutropenia, blended phenotype, ACKR1/Duffy associated neutropenia (ADAN)
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Konjenital Nötropeni (KN) düşük nötrofil sayısı ve tekrarlayan enfensiyon riskiyle karakterize nadir bir hastalıktır. En sık genetik nedenleri ELANE, SBDS, HAX1, SLC37A4 ve TAFAZZIN olup nötropeni izole olabileceği gibi bir sendromun parçası da olabilir. Bu tez çalışmasında, KN'nin nadir veya henüz aydınlatılmamış genetik nedenlerini araştırmak amacıyla, sık nedenlerin dışlandığı farklı ailelerden 23 etkilenmiş bireyden oluşan tez kohortu incelendi. Öncelikle, klinik ekzom dizileme verileri kapsamlı şekilde analiz edildi ve SBDS geni dizilendi. Sonrasında, tüm ekzon dizileme ve mikrodizin yöntemleri ile kalıtsal ve somatik değişiklikler araştırıldı. Sonuç olarak bireylerin %47'sinde (11/23) otozomal resesif, dominant ya da mitokondriyal kalıtılan nedenler ile genetik etiyoloji ortaya kondu. 23 etkilenmiş bireyin 3'ünde ACKR1/Duffy ilişkili nötropeniye neden olan homozigot rs2814778 polimorfizmi gözlendi. Ayrıca, nötropeniye ek bulguları bulunan 10 bireyin 6'sında fenotipi açıklayacak birden fazla genetik değişiklik gözlendi. Bu 6 bireyin 5'inde ebeveynlerin akraba olduğu ve yüksek oranda homozigosite bölgeleri saptandığı görüldü. Bu tez çalışması, akraba evliliğinin sık görüldüğü ülkemizde konjenital nötropeninin karışık genetik etiyolojisindeki nadir nedenlere ışık tutmaktadır. Akrabalık öyküsü bulunan olgulardaki ek fenotipik özellikler, hastalıktan birden fazla genin sorumlu olabileceğinin iyi bir göstergesi olabilir. Klinik bulguları tamamen açıklayabilmek için genetik incelemelerin kapsamlı değerlendirilmesi gereklidir.
Özet (Çeviri)
Congenital neutropenia (CN) is a rare disorder characterized by reduced neutrophil counts and recurrent infections. The most common genetic causes of CN are ELANE, SBDS, HAX1, SLC37A4 and TAFAZZIN. Neutropenia can be isolated or appear as a component of a syndrome. In this thesis, a cohort of 23 affected individuals from different families where the most common causes are excluded was studied to elucidate the rare or yet unknown etiology of CN. Initially, clinical exome sequencing data was analyed comprehensively and SBDS gene was sequenced. Afterwards, whole exome sequencing and microarray analysis were performed to evaluate hereditary and somatic variants. As a result, 47% (11/23) of individuals were diagnosed with variants which are autosomal recessively, dominantly or mitochondrially inherited. In 3 of 23 affected individuals, the homozygous rs2814778 polymorphism was identified leading to ACKR1/Duffy associated neutropenia. Additionally, 6 of 10 individuals with extra clinical features unrelated to neutropenia were diagnosed with more than one genetic variant explaining the phenotype. In 5 of the 6 individuals, parents were consangineous with high rate of homozygosity regions. This study highlights the complicated rare genetic etiology of CN in a population with high consanguinity. Additional phenotypic features in individuals with consanguineous parents is a good indicator of multiple disease-causing genes. This emphasizes the need for comprehensive evaluation of genetic studies to fully explain the clinical phenotype.
Benzer Tezler
- Konjenital akciğer anomalisi nedeni ile opere olan hastaların post-op uzun dönemde solunum fonksiyon testleri ile değerlendirilmesi
Evaluating the lung functions of patients who underwent lobectomy for congenital lung malformations in long term follow up
ALİCAN DİNÇEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2019
Çocuk Sağlığı ve HastalıklarıMarmara ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BÜLENT TANER KARADAĞ
- Konjenital koanal atrezili hastalarda transnazal endoskopik cerrahi yöntemin ve stent uygulamasının cerrahi başarısına etkisi, revizyon cerrahi sıklığının değerlendirilmesi ve ek anomali mevcudiyetinin araştırılması
Congenital choanal atresia treated by transnasal endoscopic approach and stent application effects on surgery success, evaluation of revision surgery incidence and presence of additional abnormality
SECAATTİN GÜLŞEN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2015
Kulak Burun ve BoğazGaziantep ÜniversitesiKulak Burun Boğaz ve Baş-Boyun Cerrahisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. LÜTFİ SEMİH MUMBUÇ
- Konjenital adrenal hiperplazi olan çocuk ve ergenlerde otistik özellikler ve 2D:4D parmak oranlarının ilişkisi
Autistic features and 2D: 4D finger ratio relations children and adolescents with congenital adrenal hyperplasia
GİZEM MELİSSA KOCAMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
FizyolojiDüzce ÜniversitesiFizyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RECEP ÖZMERDİVENLİ
- Konjenital kifoz hastalarında cerrahi sonuçların, yaşam kalitesi skorları ile sagital, spinopelvik parametreler üzerine etkisi ve komplikasyon profili
Effect of surgical results on quality of life scores, sagittal, spinopelvic parameters and complication profile in patients with congenital kyphosis
HAKAN AKGÜN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2021
Ortopedi ve TravmatolojiSağlık Bilimleri ÜniversitesiOrtopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. DENİZ KARGIN
UZMAN ALPER KÖKSAL
- Konjenital tibia psödoartrozunun tedavisinde periosteal sarmalama, intramedüller rod ve sirküler eksternal fiksasyon uygulaması
Periosteal wrapping,intramedullary rod and circuler type external fixation application in treatment of congenital pseudoarthrosis of tibia
GÖKÇER UZER
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2008
Ortopedi ve Travmatolojiİstanbul ÜniversitesiOrtopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. İBRAHİM LEVENT ERALP