Klinik olarak tip I interferonopati tanısı alan hastalarda yeni nesil dizileme analizi, interferon imzası ve anti-viral durumun araştırılması
Investigation of next generation sequencing analysis, interferon signature and anti-viral status in patients with clinically diagnosed type I interferonopathy
- Tez No: 937824
- Danışmanlar: PROF. DR. FEYZİ İLHAN TEZCAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Allerji ve İmmünoloji, Allergy and Immunology
- Anahtar Kelimeler: CXCL10 (IP-10), interferon imzası, interferonopati, tip I interferonlar, tüm ekzom dizileme, Alerji ve immünoloji, Birincil immün yetmezlik hastalıkları, ELISA, Ekzom dizileme, Enzime bağlı immünosorbent testi, Gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR), Işık mikroskobu, Otoimmünite, Stimulator of interferon genes, Yeni nesil dizileme, CXCL10 (IP-10), interferon signature, interferonopathy, type I interferons, whole exome sequencing, Allergy and immunology, Primary immunodeficiency diseases, Exome sequencing, Enzyme-linked immunosorbent assay, Reverse transcription polimerase chain reaction, Autoimmunity, High throughput sequencing
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: İmmünoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: İmmünoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Tip I interferonopatiler (IFNopatiler), tip I interferon (IFN) yolağındaki sinyal artışı ile karakterize heterojen bir hastalık grubunu temsil etmektedir. Bu çalışmada Hacettepe Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı, İmmünoloji Bölümü ve Romatoloji Bölümüne başvuran klinik olarak tip I IFNopati tanısı düşünülen 69 hastada; RT-qPCR ile IFN imzasının değerlendirilmesi, ELISA ile serum IFN-α IFN-β ve CXCL10 düzeylerinin ölçülmesi, tüm ekzom dizileme analizi, hasta serumlarının antiviral aktivitesinin belirlenmesi, endozom belirteci RAB5a ile tip I IFN'lerin kolokalizasyonunun araştırılması hedeflenmiştir. Hastaların %39,1'i (n=27) erkek ve %60,9'u (n=42) kadındı. Hastaların yaşlarının ortancası 13 yıldı. Ebeveyn akrabalığı oranı %43,5'ti. En sık saptanan başvuru şikâyeti cilt bulgusu idi. Cilt bulguları ve vaskülopati (%85,5), otoimmün/inflamatuar bulgular (%74,5) ve kas iskelet bulguları (%68,1) en sık saptanan bulgulardı. Hastaların %81,2'sinde CRP düzeylerinde, %49,3'ünde sedimantasyon oranında artış vardı. Hastaların %71'inde otoantikor pozitifliği saptandı. IFN imzası çalışılan hastaların (n=39) 26'sının IFN imzası pozitif iken 13'ünün negatifti. Hasta grubunda (n=45) CXCL10 seviyelerinin ortancası kontrol grubuna (n=29) göre yüksekti (p<0,0001). CXCL10 seviyeleri ve IFN imzası arasında pozitif korelasyon vardı (p<0,01). Hastaların %62,3'ünde tüm ekzom dizileme analizi ile patojenik varyantlar tespit edildi. Saptanan moleküler defektlerin hasta serumlarındaki antiviral etkinlikle ilgili değişken sonuçlara yol açtığı görüldü. Tip I IFN'ler ve RAB5a'nın kolokalizasyonu bakımından hasta (n=9) ve kontrol (n=4) grubu arasında anlamlı bir fark tespit edilmedi.
Özet (Çeviri)
Type I interferonopathies (IFNopathies) are a heterogeneous group of diseases characterized by enhanced signaling in type I interferon (IFN) pathway. It is aimed to evaluate the IFN signature by RT-qPCR, measurement of serum IFN-α, IFN-β and CXCL10 levels by ELISA, perform whole exome sequencing analysis, determine the antiviral activity of patient sera, and investigate the colocalization of type I IFNs with the endosome marker RAB5a in 69 patients with clinically suspected type I IFNopathy who applied to the Divisions of Immunology and Rheumatology, Department of Pediatrics, Faculty of Medicine, Hacettepe University. 39.1% (n=27) of the patients were male and 60.9% (n=42) were female. The median age of the patients was 13 years. Parental consanguinity was 43.5%. The most common complaint at admission was skin findings. Skin findings and vasculopathy (85.5%), autoimmune/inflammatory findings (74.5%) and musculoskeletal findings (68.1%) were the most common findings. There was an increase in CRP levels in 81.2% of the patients and in sedimentation rate in 49.3%. Autoantibody positivity was detected in 71% of the patients. Of the patients whose IFN signature was evaluated (n=39), 26 had a positive IFN signature while 13 had negative. The median of CXCL10 levels in the patient group (n=45) was higher than in the control group (n=29) (p<0.0001). There was a positive correlation between CXCL10 levels and IFN signature (p<0.01). Pathogenic variants were detected in 62.3% of the patients by whole exome sequencing analysis. It was observed that the molecular defects led to variable results regarding antiviral activity in patient sera. No significant difference was found between the patient (n=9) and control (n=4) groups in terms of colocalization of type I IFNs and RAB5a.
Benzer Tezler
- Characterisation of immune responses in type i interferon associated diseases
Tip-1 interferon ilişkili hastalıklarda immün yanıtların karakterizasyonu
ERSİN GÜL
Yüksek Lisans
İngilizce
2016
Allerji ve İmmünolojiOrta Doğu Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MAYDA GÜRSEL
- Chiari tip I malformasyonu (68 olgu üzerinde klinik çalışma)
Chiari type I malformation (A study in 68 patients)
FEYZA KARAGÖZ
- Tip I diabetli hastalarda T lenfosit subpopulasyonlarının immünohistokimyasal olarak incelenmesi
Immunohystochemical analysis of T lymphocytes subpopulations in type I diabetes mellitus patients
ÖMER ÜNLÜ
- Tip ı Gaucher hastalığında dentomaksillofasiyal tutulumun klinik ve radyolojik açıdan değerlendirilmesi
Clinical and radiological evaluation of the dentomaxillofacial involvement in the patients with TYPE gaucher disease
FİRDEVS AŞANTOĞROL
Diş Hekimliği Uzmanlık
Türkçe
2020
Diş HekimliğiErciyes ÜniversitesiAğız, Diş ve Çene Radyolojisi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMİN MURAT CANGER
- Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi İbn-i Sina Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Anabilim Dalı COVID kliniğinde yatan hastalarda COVID-19 enfeksiyonunun plazma aterojenite indeksi üzerine etkisi ve plazma aterojenite indeksinin hastalık şiddeti ile korelasyonu
The effect of COVID-19 infection on plasma atherogenity index and the correlation between plasma atherogenity index and COVID-19 severity in patients who were admitted to Ankara University, Faculty of Medicine, İbn-i Sina Hospital, Department of Infectious Diseases and Clinical Microbiology COVID Clinic
ESLEM KÖSEOĞLU
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Aile HekimliğiAnkara ÜniversitesiAile Hekimliği Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. AYŞE GÜLSEN CEYHUN PEKER