Gram negatif basillerdeki karbapenemazların kromojenik, MALDI-TOF ve moleküler testlerle saptanması
Detection of carbapenemases in gram-negative bacilli by chromogenic, MALDI-TOF and molecular tests
- Tez No: 945577
- Danışmanlar: PROF. DR. GÜL DURMAZ
- Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Eskişehir Osmangazi Üniversitesi
- Enstitü: Tıp Fakültesi
- Ana Bilim Dalı: Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 68
Özet
Karbapenemaz üreten organizmaların erken tespiti, bu organizmaların hastane ortamlarında yayılmasını önlemek için önemlidir. Bu çalışmada hastanemizdeki Enterobacterales ve Pseudomonas izolatlarındaki karbapenemaz tiplerinin dağılımının ve 3 farklı fenotipik testin (Carba NP, MALDİ-TOF ve DKT) bu izolatlarda karbapenemaz tespitindeki duyarlılık ve özgüllüklerinin saptanması amaçlanmıştır. Çalışmamıza Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Sağlık Uygulama ve Araştırma Hastanesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'nda 10.09.2022-02.08.2024 tarihleri arasında çeşitli klinik örneklerden izole edilen 85 Enterobacterales ve 32 Pseudomonas spp. izolatı dahil edilmiştir. Enterobacterales izolatlarının %30,6'sı (n=26) KPC, %36,5'i (n=31) OXA-48, %10,6'sı (n=9) NDM, %9,4'ü (n=8) NDM+OXA-48, %2,3'ü (n=2) KPC+OXA-48, %1,2'si (n=1) OXA-51 pozitif, %9,4'ü (n=8) negatif bulunmuştur. 32 Pseudomonas spp. izolatının %40,7'si (n=13) VIM, %3,1'i (n=1) NDM, %3,1'i (n=1) VIM+OXA-48 pozitif, %53,1'i (n=17) karbapenemaz negatif bulunmuştur. Hiçbir Enterobacterales ve Pseudomonas spp. izolatında IMP geni bulunamamıştır. Karbapenemaz üreten Enterobacterales üyelerinin %92,2'si (71/77) Carba NP, %85,7'si (66/77) MALDİ-TOF, %63,6'sı DKT (49/77) ile pozitif sonuç vermiştir. KPC, NDM+OXA-48 ve KPC+OXA-48 üreten suşların tamamı 3 testle de pozitif sonuç vermiştir. OXA-48 üreten Enterobacterales üyelerinin %87,1'i (27/31) Carba NP, %71'i (22/31) MALDİ-TOF, %16,1'i (5/31) DKT testi ile pozitif sonuç vermiştir. 3 test de OXA-51 pozitif K. aerogenes ile negatif sonuç vermiştir. Carba NP testi karbapenemaz pozitif Pseudomonas sp. izolatlarının hepsi ile pozitif sonuç vermiştir. DKT testi ise karbapenemaz pozitif Pseudomonas izolatlarının %73,3'ü (11/15) ile pozitif sonuç vermiştir. Pseudomonas spp. izolatlarında MALDİ-TOF yöntemi ile karbapenemaz tespiti yapılmamıştır.
Özet (Çeviri)
Early detection of carbapenemase-producing organisms is important to prevent their dissemination in health care settings. This study aimed to determine the distribution of carbapenemase genes in Enterobacterales and Pseudomonas isolates in our hospital and to evalute the sensitivity and specificity of 3 different phenotypic tests (Carba NP, MALDI-TOF and DKT) in detecting carbapenemases in these isolates. 85 Enterobacterales and 32 Pseudomonas isolates from various clinical samples in the Medical Microbiology Laboratory of Eskişehir Osmangazi University Health Practice and Research Hospital between 10.09.2022 and 02.08.2024 were included in our study. Among Enterobacterales isolates, 30.6% (n=26) were found to be KPC, 36.5% (n=31) were found to be OXA-48, 10.6% (n=9) were found to be NDM, 9.4% (n=8) were found to be NDM+OXA-48, 2.3% (n=2) were found to be KPC+OXA-48, 1.2% (n=1) were found to be OXA-51 positive, and 9.4% (n=8) were found to be carbapenemase negative. Of the 32 Pseudomonas spp. isolates, 40.7% (n=13) were found to be VIM, 3.1% (n=1) were found to be NDM, 3.1% (n=1) were found to be VIM+OXA-48 positive, and 53.1% (n=17) were found to be carbapenemase negative. IMP gene was not detected in any Enterobacterales or P. aeruginosa isolates. Of the carbapenemase-producing Enterobacterales members, 92.2% (71/77) gave positive results with Carba NP, 85.7% (66/77) with MALDI-TOF, and 63.6% (49/75) with DKT. All KPC, NDM+OXA-48 and KPC+OXA-48 producing strains gave positive results with all three tests. Of the OXA-48 producing Enterobacterales members, 87.1% (27/31) gave positive results with Carba NP, 71% (22/31) with MALDI-TOF, and 16.1% (5/31) with DKT tests. All three tests gave negative results with OXA-51 positive K. aerogenes. The Carba NP test gave positive results with all carbapenemase-positive Pseudomonas isolates. DCT test gave positive results in 73.3% (11/15) of carbapenemase positive Pseudomonas isolates. Pseudomonas isolates were not tested for carbapenemase production by the MALDI-TOF method.
Benzer Tezler
- Klinik örneklerden izole edilen karbapenem dirençli gram olumsuz basillerde karbapenem direncinin moleküler analizi
Molecular analysis of carbapenem resistance in carbapenem resistant gram negative bacilli isolated from clinical samples
MÜMTAZ GÜRAN
Doktora
Türkçe
2014
MikrobiyolojiÇukurova ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. FATİH KÖKSAL
- Kanser hastalarında orafarengiyal kandida ve bakteriyel kolonizasyonunun özellikleri
The characteristics of candidal and bacterial oropharyngeal colonisation of cancer patients
ŞEFİK ÇAKMAKÇI
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2004
OnkolojiAnkara Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. FİLİZ ÇAY ŞENLER
- Gram-negatif basillerde aminoglikozit direncine sebep olan mekanizmalar
Başlık çevirisi yok
ALİ SÜTCÜ
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1997
MikrobiyolojiSelçuk ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MAHMUT BAYKAN
- Gram negatif basillerde CTX-M tipi beta-laktamazların genotiplerinin araştırılması
The investigation of CTX-M type beta-lactamases in gram negative bacills
AYŞE NUR YURTMAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
MikrobiyolojiEge ÜniversitesiFarmasötik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
Y.DOÇ.DR. HÜSEYİN TAŞLI
- Gram negatif basillerde indüklenebilir beta laktamaz (ıbl) aktivitesinin ve antibiyotiklere direnç profilinin araştırılması
Investigation of induced beta-lactamase (ibl) activity in gram negative rods and its profile of antibiotic resistance
BUSE CUNDA USTA
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
MikrobiyolojiAfyonkarahisar Sağlık Bilimleri ÜniversitesiTıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MERİH ŞİMŞEK