Cevizde (Juglans regia L.) selenyum ve magnezyum elementlerinin alınımını kontrol eden gen bölgelerinin genom boyu ilişkilendirilmesi
Genome wide association of gene regions controlling selenium and magnesium uptake in walnut (Juglans regia L.)
- Tez No: 951085
- Danışmanlar: PROF. DR. MUHAMMED BAHATTİN TANYOLAÇ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyomühendislik, Bioengineering
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ege Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Biyomühendislik Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 66
Özet
Ceviz (Juglans regia L.), besin değeri ve içerdiği makro ile mikro elementler sayesinde hem ekonomi hem de sağlık açısından önemli bir kuruyemiş türüdür. Bu tez çalışmasında, ceviz meyvesinde Selenyum (Se) ve Magnezyum (Mg) elementlerinin alınımını kontrol eden gen bölgelerinin GWAS metodu ile tespit edilmesi amaçlanmıştır. Bu kapsamda, 2021 ve 2022 yıllarına ait toplamda 154 farklı J. regia genotipi için Se ve Mg konsantrasyon ölçümleri yapılmıştır. Çalışma kapsamında, markör-özellik ilişkilerinin tespit edilmesi için ilişkilendirme analizleri 16.473 adet tek nükleotid polimorfizm (SNP) markörü kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Her iki elemente ait konsantrasyonlar normal dağılım göstermiştir ve yüksek düzeyde kalıtılabilirlik değerleri ile (Se için %96, Mg için %98) genetik kontrol altında oldukları ortaya konmuştur. İlişkilendirme haritalaması çalışmaları TASSEL (v.5.2.93) yazılımı kullanılarak karma doğrusal model yöntemi ile yürütülmüştür. Analizler sonucunda, Se ile anlamlı düzeyde ilişkili 16, Mg ile ilişkili ise 15 SNP markörü saptanmıştır. Bu markörlere karşılık gelen gen bölgelerinde, Se ile ilişkili 214, Mg ile ilişkili 162 aday gen tanımlanmıştır. Gen zenginleştirme analizleri sonucunda bu genlerin 33'ünün iyon bağlanmasıyla, birinin Mg iyonlarının taşınımı ile, 10'unun hormon metabolizması ile ve 53'ünün DNA/RNA bağlanmasıyla ilişkili olduğu saptanmıştır. Bu tez çalışması kapsamında elde edilen anlamlı düzeydeki ilişkili markörler ve aday genler, Se ve Mg yönünden zenginleştirilmiş ceviz çeşitlerinin geliştirilmesine yönelik markör destekli ıslah çalışmaları için kaynak oluşturarak, bu elementlerin birikiminin moleküler temellerinin anlaşılmasına katkı sağlamaktadır.
Özet (Çeviri)
Walnut (Juglans regia L.) is an important nut species in terms of both economy and health due to its rich nutritional value and the presence of essential macro- and microelements. In this thesis study, it was aimed to identify the gene regions controlling the uptake of Selenium (Se) and Magnesium (Mg) elements in walnut fruit by GWAS method. In this context, Se and Mg concentration measurements were made for a total of 154 different J. regia genotypes for the years of 2021 and 2022. Within the scope of the study, association analyses were carried out using 16,473 single nucleotide polymorphism (SNP) markers to determine marker-trait relationships. The concentrations of both elements showed a normal distribution and were found to be under genetic control, with high heritability values (96% for Se and 98% for Mg). Association mapping studies were conducted by using the mixed linear model method in TASSEL (v.5.2.93) software. As a result of the analyses, 16 SNP markers were found to be associated with Se, and 15 with Mg. A total of 214 candidate genes associated with Se and 162 candidate genes associated with Mg were identified in the gene regions corresponding to these markers. Gene enrichment analyses revealed that 33 of these genes were found to be involved in ion binding, one in Mg ion transport, 10 in hormone metabolism, and 53 in DNA/RNA binding. Significantly related markers and candidate genes obtained within the scope of this thesis study contribute to the comprehension of the molecular basis of the accumulation of these elements by providing a resource for marker-assisted breeding studies for the improvement of walnut varieties enriched in Se and Mg.
Benzer Tezler
- Ceviz yeşil kabuğu çıkartma makinesi
Walnut shell remove the green machine
ÖMER DİCAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
Makine MühendisliğiAfyon Kocatepe ÜniversitesiMakine Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ABDURRAHMAN KARABULUT
- Güneydoğu Anadolu Bölgesi ceviz ve Antep fıstığındaki bazı virüs ve viroid hastalıklarının araştırılması ve moleküler karakterizasyonu
Identification and molecular characterization of some virus and viroid diseases in walnut and pistachio trees in the Southeastern Anatolia Region
FEYZULLAH YILMAZ
Doktora
Türkçe
2024
ZiraatMalatya Turgut Özal ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. HATİCE DİĞDEM OKSAL
- Ceviz hastalıklarının derin öğrenme ile sınıflandırılması
Classification of walnut diseases with deep learning
KADİR AYGÜN
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolAmasya ÜniversitesiTeknoloji ve İnovasyon Yönetimi Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ YAVUZ ÜNAL
- Ahşap malzemelerde kullanılan bazı vernik katmanlarının aşınma dirençlerinin belirlenmesi
Determination of abrasion resistance of some varnish layers used on the wood materials
AHMET TEKİN
- Eskişehir ili Günyüzü ilçesinde doğal olarak yetişen ceviz (Juglans regia L.) popülasyonundan üstün genotiplerin seçimi
Selection of outstanding genotypes from the walnut (Juglans regia L.) population naturally growing in Gunyuzu (Eskisehir)
UMUT ATEŞ