Managing clinical research using fair digital objects on blockchain
Blokzincir üzerinde fair dijital nesneleri kullanarak klinik araştırmaların yönetilmesi
- Tez No: 955340
- Danışmanlar: DOÇ. DR. ADNAN ÖZSOY, PROF. DR. OYA DENİZ BEYAN
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 128
Özet
Blokzincir teknolojisi, ilk çıkış noktası olan kripto para birimlerinde kullanılmasının ötesine geçerek sağlık hizmetleri gibi hassas ve kritik alanlarda da kayda değer katkılar sunma potansiyeline sahiptir. Sağlık hizmetlerinin kalitesinin iyileştirilmesinde temel olan klinik araştırmalar, süreç şeffaflığı, veri bütünlüğü ve hasta hakları açısından blokzincir entegrasyonundan büyük ölçüde yararlanabilir. Blokzincir teknolojisi, benzersiz teknik yetenekleri ile, klinik araştırmaların tasarımından hasta seçimine ve araştırma bulgularının raporlanmasına kadar çeşitli aşamalarda etkili çözümler sunabilir. Ayrıca, klinik araştırma sürecindeki mevcut zorlukları yöneterek, araştırma kalitesini önemli ölçüde artırabilir ve dolayısıyla hasta bakımını iyileştirebilir. Bu tez çalışması, blokzincir teknolojisinin klinik araştırmalardaki potansiyelini ve uygulama alanlarını kapsamlı biçimde ortaya koymayı amaçlamaktadır. Bu kapsamda, ilk aşamada, araştırma soruları temel alınarak Sistematik Literatür İncelemesi gerçekleştirilmiş ve literatürdeki birincil çalışmalar detaylı bir biçimde analiz edilmiştir. Daha sonra, literatür çalışmasından elde edilen bulgular ışığında ve adım tabanlı model oluşturma yaklaşımıyla bütünleşik bir Kavramsal Model geliştirilmiştir. Son olarak, geliştirilen kavramsal modelin geçerliliğini değerlendirmek amacıyla vaka çalışmaları gerçekleştirilmiştir. Bu bağlamda, klinik araştırmaları yönetmek için özel ve izinli bir Hyperledger Fabric blokzincir platformu geliştirilmiştir. Kullanım senaryosu olarak, çok merkezli araştırmalar için, epidemiyolojik parametrelerinin sayımı ve raporlanmasına yönelik klinik araştırma ağı ve katmanlı-dinamik bir onam yönetim sistemi tanımlanmıştır. Kullanım senaryolarının mantıksal yapısı, akıllı sözleşmeler (chaincode) aracılığıyla, geliştirilmiş ve Fabric Ağı üzerinde çalıştırılmıştır. Ayrıca, bu tez çalışması, klinik araştırmaların yönetilmesi için yalnızca teknik bir çözüm önermekle kalmamakta, aynı zamanda klinik araştırma verilerinin FAIR ilkeleri (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) ve Avrupa Birliği'nin kişisel verilerin korunmasına yönelik genel düzenlemesi olan GDPR ile uyumlu şekilde yönetilmesini de hedeflemektedir. Bu yönüyle, FAIR veri ilkelerini blokzincir teknolojisine entegre eden literatürdeki ilk kapsamlı çalışmadır. Ayrıca, sistemin ölçeklenebilirliğini ve pratik uygulanabilirliğini değerlendirmek amacıyla, farklı boyutlardaki veri kümeleri üzerinde performans testleri gerçekleştirilmiştir. Onam eşlemesi ve projeye uygunluk kontrollerinden kaynaklanan ek işlem yüküne rağmen, sistem kabul edilebilir gecikme süreleri ve işlem hacmi sağlamıştır. Bu sonuçlar, sistem tasarımında, performanstan çok düzenlemelere uyumun ve izlenebilirliğin önceliklendirilmesinden kaynaklanmaktadır. Klinik araştırma bağlamında, gerçek zamanlı işlem gereksiniminin sınırlı olduğu göz önüne alındığında, sistemin performansının yeterli olacağı kabul edilmektedir. Ayrıca, sistemin modüler mimarisi paralel işlem, indeksleme ve performans iyileştirmeleri yoluyla gelecekteki ölçeklenebilirlik gereksinimlerini karşılamaya elverişlidir. Bu tez çalışması, blokzincir teknolojisine ilişkin teorik gelişmeler ile bunların çok merkezli klinik araştırma uygulamalarına entegrasyonu arasında bir köprü kurarak önemli bir katkı sunmaktadır. Kavramsal çerçeveleri ve yaklaşımları somut çözümlere dönüştürerek, yeni teknolojilerin gerçek dünyadaki sorunları çözmede nasıl etkili bir biçimde uygulanabileceğini de göstermektedir.
Özet (Çeviri)
Blockchain technology has the potential to extend beyond its origins in cryptocurrency and provide considerable value in sensitive domains such as healthcare. In particular, clinical research, a cornerstone for improving healthcare quality, can greatly benefit from blockchain integration in terms of transparency, data integrity, and patient rights. The unique technical capabilities of blockchain can offer promising solutions across various phases of clinical research, from study design and patient recruitment to reporting study findings. By addressing current challenges in the clinical research process, blockchain technology can notably enhance research quality and, consequently, improve patient care. This thesis investigates the implementation scenarios and capabilities of blockchain technology within the domain of clinical research. Accordingly, in the first stage, a comprehensive Systematic Literature Review (SLR) has been conducted based on predefined research questions, and primary studies were analyzed in accordance with the research questions (RQs) in a detailed manner. Then, the Conceptual Model was developed, with insights derived from the findings of the SLR study and a step-based model creation approach. Finally, validation has been performed through case-based applications of the Conceptual Model. A private-permissioned Hyperledger Fabric blockchain platform has been developed to manage clinical research. As a use case, a blockchain-enabled distributed framework has been designed for counting and reporting epidemiological parameters, along with a tiered and dynamic consent management system across multi-site research institutions. This use case logic has been implemented by using a smart contract (chaincode) and deployed on the Fabric network. This study not only proposes a technical solution but also aims to manage clinical research data in alignment with the principles of making data findable, accessible, interoperable, and reusable, as outlined in the FAIR framework and GDPR, the EU's key privacy law. This study appears to be the first to offer a comprehensive integration of FAIR data principles and blockchain technology in a single conceptual framework. Moreover, to evaluate the system's scalability and practical applicability, performance tests were conducted across varying dataset sizes. Despite the added computational load from consent mapping and patient eligibility checks, the system achieved acceptable latency levels and consistent throughput. These results reflect a purposeful design trade-off that prioritizes regulatory compliance and traceability over raw performance. In the context of clinical research, where real-time processing requirements are limited, the system's performance is considered sufficient. Furthermore, the modular architecture allows for future scalability through parallel processing, indexing, and performance tuning. This thesis represents a significant contribution toward bridging the gap between theoretical advancements in blockchain technology and their practical application in real-world multi-site clinical research settings. By translating conceptual frameworks into implemented solutions, it demonstrates how emerging technologies can be effectively operationalized to address real-world challenges.
Benzer Tezler
- Erişkin bireylerin probiyotik bilgi düzeyi ve kullanım alışkanlıkları ile sindirim sistemi şikayetleri arasındaki ilişkinin değerlendirilmesi
Evaluating the relationship between probiotic knowledge levels, usage habits, and digestive system complaints in adults
CEREN BAYEZİT
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Aile HekimliğiSağlık Bilimleri ÜniversitesiAile Hekimliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUSTAFA ÇELİK
- Ar-Ge projelerinde risk ve performans yönetiminde ödül-ceza modelleri ve hibrit çok kriterli karar verme karşılaştırılması
Comparison of reward-penalty models and hybrid multi-criteria deci̇si̇on maki̇ng i̇n R&D project ri̇sk and performance management
EZGİ GÜL DİNÇER
Yüksek Lisans
Türkçe
2025
Endüstri ve Endüstri MühendisliğiSakarya ÜniversitesiMühendislik Yönetimi Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. SAFİYE SENCER
- Crohn hastalarında preoperatif radyolojik (MaRIAs skoru) , endoskopik ve biyokimyasal belirteçlerin hastalık aktivasyonu ile korelasyonu
Correlation between preoperative radiological (MaRIAs score), endoscopic, and biochemical markers and disease activity in Crohn's disease patients
EMRE ŞİMŞEK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2025
Genel CerrahiSağlık Bilimleri ÜniversitesiGenel Cerrahi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERDİNÇ ÇETİNKAYA
- Optimized RF safety monitoring for cerebellar magnetic resonance imaging at 7T
7T'de serebellum manyetik rezonans görüntülemesi için optimize edilmiş RF güvenlik izleme
ELNAZ MAHMOUDI MAHMOUDALILOU
Yüksek Lisans
İngilizce
2024
Elektrik ve Elektronik Mühendisliğiİhsan Doğramacı Bilkent ÜniversitesiElektrik ve Elektronik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ERGİN ATALAR
- Hemodynamic assessment of self-expandable pulmonary valve in treating surgically repaired tetralogy of Fallot using 3D printed models
Cerrahi olarak onarılmış Fallot tetralojisinin tedavisinde kendiliğinden genişleyebilen pulmoner kapağın 3D baskılı modeller kullanılarak hemodinamik değerlendirmesi
ENDER ÖDEMİŞ
Doktora
İngilizce
2024
BiyomühendislikKoç ÜniversitesiBiyomedikal Bilimler ve Mühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. KEREM PEKKAN