Bazı kendilenmiş domates hatlarında ssr markörlerle filogenetik analizi
Phylogenetic analysis of some inbred tomato lines with ssr markers
- Tez No: 963373
- Danışmanlar: PROF. DR. AHMET OKUMUŞ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoteknoloji, Biotechnology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Aydın Adnan Menderes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Bitkisel Biyoteknoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: 84
Özet
Bu çalışmada özel bir firmadan elde edilmiş 12 adet kendilenmiş domates hattın 20 adet SSR markörü kullanılarak birbirleri arasındaki farklılıkların tespit edilmesi ve SSR markör yöntemi ile çeşit adayı olarak birbirinden ayırabilmek amacı ile yapılmıştır. Çalışmada toplam 139 adet allel elde edilmiş ve en düşük allel sayısı 3, en yüksek allel sayısı 10 olarak gözlemlenmiştir. Ayrıca en düşük ve en yüksek polimorfizm bilgi içerikleri (PIC) sırası ile 0,562 ile 0,893 arasında değişmiştir. Ortalama polimorfizm bilgi içeriği ise 0,810 olarak hesaplanmıştır. UPGMA yöntemi kullanılarak yapılan dendogram ile kendilenmiş domates hatları 2 ana gruba ve bu grupların altında alt gruplara ayrıldığı tespit edilmiştir. Kendilenmiş domates hatlarının üzerinde bağlanan SSR markörlerinin oluşan allellerin moleküler büyüklükleri kullanılarak her bir kendilenmiş domates hattı belirli bir düzende kod verilmiştir ve bu hatlar arasında bu şekilde tanı yapılmıştır. Bu çalışma sonucunda SSR markör kullanılarak kendilenmiş domates hatlarının birbirinden ayrılarak diğer tanımlama yöntemlerinin yetersiz kaldığı durumlarda yol gösterici olacağı ortaya konulmuştur.
Özet (Çeviri)
This study aimed to identify genetic differences among 12 selfed tomato lines obtained from a private company using 20 Simple Sequence Repeat (SSR) markers and to distinguish these lines as distinct candidate varieties through molecular analysis. A total of 139 alleles were detected, with the number of alleles per marker ranging from 3 to 10. The polymorphism information content (PIC) values ranged from 0,562 to 0,893, with an average PIC value of 0,810, indicating a moderate level of genetic diversity among the lines. Cluster analysis was performed using the UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) method, and the resulting dendrogram grouped the tomato lines into two major clusters, each containing several subgroups. Each selfed tomato line was assigned a unique identification code based on the molecular sizes of the alleles produced by the SSR markers, enabling effective identification among these lines. The results of this study demonstrate that SSR markers are a reliable and effective tool for distinguishing selfed tomato lines and can be particularly valuable in cases where traditional identification methods are inadequate. These findings suggest that SSR-based molecular characterization can support breeding programs, seed certification, and the conservation of genetic resources.
Benzer Tezler
- Bazı yerel biber tiplerinden elde edilenmelezlerin morfolojik özelliklerinin ve domates lekeli solgunluk virüsüne (TSWV) dayanıklılığının belirlenmesi
DETERMINATION OF MORPHOLOGICAL CHARACTERISTIC AND RESISTANCE TO TOMATO SPOTTED WILD VIRUS OF SOME LOCAL PEPPER TYPES
GÖKHAN KARTAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatTokat Gaziosmanpaşa ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NAİF GEBOLOĞLU
- Bazı domates genotiplerinde kendilenmiş hatların elde edilmesinde embriyo kültürünün kullanılması
The use of embryo culture to obtain inbred lines in some tomato genotypes
SÜLEYMAN BOZMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
BiyoteknolojiGaziosmanpaşa ÜniversitesiBahçe Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NAİF GEBOLOĞLU
- Characterization and genetic mapping of health related traits in tomato
Domateste sağlıklı ilgili karakterlerin belirlenmesi ve genetik haritalanması
DANE RUSÇUKLU
Yüksek Lisans
İngilizce
2005
Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. AHMET YEMENİCİOĞLU
DOÇ.DR. ANNE FRARY
Y.DOÇ.DR. SAMİ DOĞANLAR
- Bazı kendilenmiş şeker mısır hatlarının şeker içeriklerinin belirlenmesi ve ilgili moleküler markörler ile taranması
Determination of sugar content of some inbread sweet corn lines and screening with ssr markers
GİZEM ÇİVİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyoteknolojiEge ÜniversitesiTohumluk Bilimi ve Teknolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUZAFFER TOSUN
- Bazı kendilenmiş cin mısır (zea mays everta sturt.) hatları ve yoklama melezlerinin karşılaştırılması
Comparison of selfed popcorn (zea mays everta sturt.) lines and their testcrosses)
ERCAN ÖZKAYNAK
Yüksek Lisans
Türkçe
1999
ZiraatAkdeniz ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BÜLENT SAMANCI