Shotgun metagenom analizi ile normozoospermik infertil erkeklerin semen mikrobiyomunun araştırılması
Investigation of the semen microbiome of normozoospermic infertilized men by shotgun metagenome analysis
- Tez No: 969765
- Danışmanlar: PROF. DR. SEZGİN GÜNEŞ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Moleküler Tıp, Molecular Medicine
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ondokuz Mayıs Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
İnfertilite, çiftlerin bir yıl boyunca korunmasız cinsel ilişkiye girmesine rağmen çocuk sahibi olamamaları durumudur. İnfertilitenin altında yatan genetik ve çevresel pek çok faktör bulunmaktadır ancak yapılan tüm incelemelere rağmen infertil erkeklerin büyük bir kısmını oluşturan“normozoospermik infertil”vakalarda altta yatan hiçbir neden bulunamamaktadır. İnfertilite tanısı ve tedavisi için yeni test ve tedavi metodolojilerine ihyiyaç bulunmaktadır. Yapılan çalışmalar erkek genital sistem mikrobiyotasının bağırsaktan bağımsız, semen parametrelerini etkileyen yeni bir niş olduğunu göstermektedir. Mikrobiyota elemanlarının, cinsel yolla bulaşan hastalıklara ve infertiliteye yatkınlık oluşturduğu saptanmıştır. Çalışmamıza; 18-50 yaş arasında, normal semen parametrelerine sahip, eşlerinde hiçbir sorun saptanmamış, 17 fertil ve 17 normozoospermik infertil vaka dahil edilmiştir. Örnekler 3-7 günlük cinsel perhiz sonrası mastürbasyonla toplanmıştır. Semen parametreleri hem konvansiyonel olarak mikroskopla hem de bilgisayar destekli semen analiz sistemi ile incelenmiştir. Örneklere eş zamanlı olarak akan hücre ölçer ile sperm DNA hasarı testi, total antioksidan kapasite ölçümü ve Shotgun metagenom analizleri uygulanmıştır. Semen mikrobiyomunun DNA hasarı, antioksidan kapasite ve semen parametreleri üzerine etkisi istatistik olarak incelenmiştir. Bu tez çalışmasında, bildiğimiz kadarı ile literatürde ilk kez, erkek genital sisteminde yenidoğan sağlığını olumsuz yönde etkileme potansiyeli taşıyan Toxoplasma gondii (T. gondii) parazit DNA'sı saptanmıştır. T. gondii'ye ek olarak infertil erkeklerde, bugüne kadar semen parametrelerini etkilediği bilinmeyen pek çok bakteri, mantar, virüs, Archaea ve Lactobacillus türleri bulunmuştur. Sonuçlarımız, mikrobiyotanın infertiliteye olan katkısının varsayılandan çok daha kapsamlı olduğunu düşündürmektedir. Bu nedenle erkek genital sistem sağlığı ve mikrobiyota ile ilgili yüksek gönüllü sayısının katılımıyla gerçekleştirilecek, gönüllülerin partnerlerini, gaita ve idrar örneklerini de kapsayan, hem genetik hem de metabolik analizlerin yapıldığı daha fazla çalışmaya ihtiyaç vardır.
Özet (Çeviri)
Infertility is the situation where couples are unable to have children despite having unprotected sexual intercourse for a year. There are many genetic and environmental factors underlying infertility, but despite all the examinations, no underlying cause can be found in“normozoospermic infertile”cases, which constitute the majority of infertile men. New testing and treatment methodologies are needed for the diagnosis and treatment of infertility. Studies show that the male genital system microbiota is a new niche that is independent of the intestine and affects semen parameters. Microbiota elements have been found to predispose to sexually transmitted diseases and infertility. The study included 17 fertile and 17 normozoospermic infertile cases aged between 18 and 50 years, with normal semen parameters whose partners were found to have no fertility related issues. Samples were collected by masturbation after 3-7 days of sexual abstinence. Semen parameters were examined both conventionally with a microscope and with a computer-assisted semen analysis system. Sperm DNA damage test by flow cytometry, total antioxidant capacity measurement and Shotgun metagenome analysis were applied to the samples simultaneously. The effect of semen microbiome on DNA damage, antioxidant capacity and semen parameters was statistically examined. In this thesis study, to our knowledge, Toxoplasma gondii (T. gondii) parasite DNA has been detected for the first time in the male genital system, a finding with potential implic. In addition to T. gondii, numerous bacteria, fungi, viruses, Archaea, and Lactobacillus species which had not been previously reported to influence semen parameter. These findings indicate that the contribution of the microbiome to male infertility may be more substantial than previously recognize. large-scale studies involving both partners, as well as stool and urine sampling, in conjunction with genetic and metabolic analyses, are warranted to elucidate the relationship between the male genital tract and the microbiome.
Benzer Tezler
- Fermente gıdalarda bakteriyosin çeşitliliğinin ve bakteriyosin varlığının mikrobiyota ile ilişkisinin in siliko analizi
In silico analysis of bacteriocin diversity and the relationship between bacteriocin presence and microbiota in fermented foods
NACİYE AFRANUR KANIBOL
Yüksek Lisans
Türkçe
2024
Gıda MühendisliğiYıldız Teknik ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÖMER ŞİMŞEK
- Determination of enterotype specific microbial biomarkers from metagenome data for early diagnosis and screening system in colon cancer
Kolon kanserinde erken tanı ve tarama sistemi için metagenom verilerinden enterotip spesifik mikrobiyal biyobelirteç tayini
ÜNZİLE GÜVEN GÜLHAN
Doktora
İngilizce
2024
BiyoistatistikGebze Teknik ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
DR. SALİHA DURMUŞ
- İnsan mikrobiyomunda bulunan bakteriyofaj komünitesinin konakçı hastalıklarıyla olan ilişkisinin araştırılması
Investigation of the relationship bacteriophage community in the human microbiome with host diseases
MEHMET HORA
Doktora
Türkçe
2025
BiyoistatistikErciyes ÜniversitesiBiyoinformatik Sistemler Biyolojisi Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AYCAN GÜNDOĞDU
- Recombinant production and biochemical characterization of novel CYP102S from hisaralan and antarctica identified by metagenomics approaches
Hisaralan ve antarktika'dan metagenomik yaklaşımla yeni tanımlanan CYP102S enzimlerinin rekombinant üretimi ve biyokimyasal karakterizasyonu
ELİF MEHVEŞ ÖZER
Yüksek Lisans
İngilizce
2026
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER
- Effect of extreme conditions on enzyme profiles:cytochrome P450 systems as a case study
Ekstrem koşulların enzim profilleri üzerindekietkisi: sitokrom P450 sistemleri
HANDE MUMCU
Doktora
İngilizce
2026
Biyokimyaİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. NEVİN GÜL KARAGÜLER