Gaita kaynaklı Escherichia coli MDR izolatlarının multipleks PZR karakterizasyonu
Multiplex PCR characterization of fecal-derived MDR Escherichia coli isolates
- Tez No: 970946
- Danışmanlar: PROF. DR. BİRGÜL ÖZCAN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2025
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hatay Mustafa Kemal Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bakterilerde antimikrobiyal direnç mekanizmalarının gelişimi, çoklu ilaç direncine (MDR) sahip suşların ortaya çıkmasına neden olmuş ve bu durum, insanları yeni antimikrobiyal ajan arayışına yönlendirmiştir. Kontamine gıda ve su yoluyla insanlara bulaşabilen bu suşlardaki direncin hızlı ve hassas tespiti, halk sağlığı açısından büyük önem taşımaktadır. Bu çalışmada, gaita kaynaklı Escherichia coli suşlarında geniş spektrumlu beta-laktamaz (ESBL) gen varyantları (blaTEM, blaOXA, blaSHV ve blaCTX-M), sülfonamid direnç genleri (sul1, sul2, sul3) ve integron genleri (int1, int2, int3) PZR ile moleküler düzeyde karakterize edilmiştir. Çalışma kapsamında, E. coli izolatlarının identifikasyonu için uspA geni hedefli bir primer çifti, direnç ve integron genlerinin karakterizasyonu için on primer çifti olmak üzere toplamda on bir primer çifti kullanılmıştır. PZR ile uspA pozitif olduğu belirlenen 62 E. coli izolatı ile çalışılmıştır ve izolatların yaklaşık %82'de bla varyantları tespit edilmemiş, 5 izolatta blaCTX-M ve 6 izolatta blaOXA geninin mevcut olduğu saptanmıştır. İzolatların hiçbirinde birden fazla bla genine rastlanmamıştır. İzolatların yaklaşık %13'de en az bir bla geni ile sul1, sul2 veya her ikisinin birlikte bulunduğu belirlenmiş, ancak üç sul genini birden içeren izolat tespit edilmemiştir. Ayrıca, en az bir bla geni ile int1 ve/veya int2 genlerini birlikte içeren izolat oranı yaklaşık %13 olarak bulunmuştur. İntegron genlerinin tümünü içeren herhangi bir izolat tespit edilmemiştir. Genel olarak değerlendirildiğinde izolatlardan yalnızca %6,5'nin, bla, sul ve int genlerinden en az birini birlikte taşıdığı belirlenmiş olup, bu durum potansiyel çoklu ilaç direnci profiline sahip olduklarının göstergesidir. Elde edilen sonuçlar, klinik E. coli suşlarında önemli direnç genlerinin izlenmesinin gerekliliğini vurgulamaktadır. Bu bağlamda, klinik örneklerde antimikrobiyal direnç varlığının önlenebilmesi için etkili izleme sistemlerinin kurulması ve antibiyotik kullanımına yönelik rasyonel yönetim stratejilerinin geliştirilmesi büyük önem taşımaktadır.
Özet (Çeviri)
The development of antimicrobial resistance mechanisms in bacteria has led to the emergence of multidrug-resistant (MDR) strains, prompting the search for new antimicrobial agents. These strains can be transmitted to humans through contaminated food and water, and the rapid and accurate detection of resistance in such strains is of great importance for public health. In this study, molecular characterization was performed by PCR to detect extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) gene variants (blaTEM, blaOXA, blaSHV, and blaCTX-M), sulfonamide resistance genes (sul1, sul2, and sul3), and integron genes (int1, int2, int3) in Escherichia coli strains isolated from stool samples. A total of eleven primer pairs were used: one pair targeting the uspA gene for molecular confirmation of E. coli isolates, and ten pairs for characterization of resistance and integron genes. Using the PCR analysis, all 62 isolates confirmed to be uspA-positive were included in the study. Among these, 51 isolates (82.25%) did not harbor any of the four targeted bla genes. The blaCTX-M and blaOXA genes were detected in 5 (8.06%) and 6 (9.67%) isolates, respectively, while blaTEM and blaOXA were found only in different isolates; no isolate carried more than one bla gene simultaneously. The presence of at least one bla gene along with sul1, sul2, or both was observed in 12.91% of the isolates; however, none harbored all three sul genes. Additionally, the co-occurrence of at least one bla gene with int1 and/or int2 was identified in 12.90% of the isolates. No isolate contained all three integron genes. Overall, only four isolates (6.45%) were found to carry at least one bla, one sul, and one int gene, indicating the presence of potential multidrug-resistant profiles. These findings highlight the necessity of monitoring clinically relevant resistance genes in E. coli strains. In this context, establishing effective surveillance systems and developing rational antibiotic management strategies are essential to prevent the emergence and spread of antimicrobial resistance in clinical settings.
Benzer Tezler
- Çocuk ishallerinde Rotovirus Gastroenteritleri'nin sıklığı
Başlık çevirisi yok
MEHMET OKAN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
1988
Uludağ ÜniversitesiÇocuk Sağlığı ve Hastalıkları Ana Bilim Dalı
Yükleniyor...
- Kolonoskopi girişimlerinde bilinçli setasyon/analjezi için propofol-remifentanil ile propofol ketamin kombinasyonlarının bis monitörizasyonu ile karşılaştırılması
Comparison of propofol-remifentanil and propofol-ketamine combinations for conscious sedation/analgesia at colonoscopy under bispectral index (Bis) monitoring
HAKAN ÇİMEN