Geri Dön

Mide kanserinde ilişkili genlerin ve kodlamayan RNA'ların analizi

Başlık çevirisi mevcut değil.

PDF İndir

  1. Tez No: 974658
  2. Yazar: ESRA DİRİMTEKİN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. BİLGEN BİLGE GEÇKİNLİ, PROF. DR. AHMET İLTER GÜNEY
  4. Tez Türü: Tıpta Uzmanlık
  5. Konular: Genetik, Genetics
  6. Anahtar Kelimeler: Mide kanseri, miRNA, biyobelirteç, miR-21, miR-148a, let-7, Gastric cancer, miRNA, biomarker, miR-21, miR-148a, let-7
  7. Yıl: 2025
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Marmara Üniversitesi
  10. Enstitü: Tıp Fakültesi
  11. Ana Bilim Dalı: Tıbbi Genetik Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Amaç: Mide kanseri, dünya genelinde en yaygın malignitelerden biridir. Klinik seyri genellikle sessiz olduğundan, hastaların önemli bir kısmı ileri evrede tanı almaktadır. Erken tanı için kullanılabilecek ve prognoz tahmini yapabilecek güvenilir biyobelirteçlerin eksikliği, mide kanseri yönetiminde önemli bir engel oluşturmaktadır. Bu çalışmanın amacı, mide kanseri hastalarında genetik yatkınlığı incelemek ve seçilmiş miRNA'ların kan ve/veya tümör dokusundaki ekspresyon düzeylerini belirlemek ve bu düzeylerin klinikopatolojik özellikler ile olası ilişkilerini değerlendirmektir. Böylece, incelenen miRNA'ların biyobelirteç olarak kullanılabilirliğinin araştırılması hedeflenmektedir. Yöntem: Çalışmaya mide kanseri tanısı almış 22 hasta dahil edildi. Hastalardan 12'unun hem tümör dokusu hem periferik kanı, 10'unun sadece periferik kanı alındı. Tümör dokusundan RNA sekanslama yapıldı, en yüksek ve en düşük düzeyde eksprese edilen toplam 10 miRNA belirlendi. Belirlenen miRNA'ların hastaların periferik kanındaki düzeyleri eş zamanlı kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (RT-PCR) ile belirlendi. MiRNA'ların ekspresyon seviyeleri hastaların evre, cinsiyet, h.pylori durumu, neoadjuvan tedavi alıp almama durumuna göre ve lauren histolojik alt tipine göre karşılaştırıldı. Bulgular: Tümör doku örnekleriyle yapılan RNA sekanslama verilerinden elde edilen 10 farklı miRNA'nın ekspresyon düzeyleri analiz edilmiştir. Bu analiz sonucunda 6 miRNA'da yüksek ekspresyon, 4 miRNA'da ise düşük ekspresyon saptanmıştır. Doku örneklerinde ekspresyonu yüksek saptanan miRNA'lar; hsa-miR-143, hsa-miR-21, hsa-miR-148a, hsa-miR-27b, hsa-let-7i ve hsa-miR-30a olarak, ekspresyonu düşük saptanan miRNA'lar ise; hsa-miR-26b, hsa-miR-340, hsa-let-7c ve hsa-miR-199b olarak belirlenmiştir. Çalışılan 10 hastada; doku ve periferik kandaki ekspresyon seviyeleri benzerlik göstermiştir. Sonuç: Bu çalışmanın bulguları, dolaşımdaki belirli miRNA'ların (miR-21, miR-148a, let-7 ailesi gibi) mide kanseri için minimal invaziv biyobelirteçler olarak kullanılabileceğini göstermektedir. Bu miRNA'lar, hastalığın prognozunun öngörülmesinde ve tedaviye yanıtın izlenmesinde klinik olarak değerli olabilir.

Özet (Çeviri)

Objective: Gastric cancer is one of the most common malignancies worldwide. Since its clinical course is often asymptomatic, a significant proportion of patients are diagnosed at an advanced stage. The lack of highly reliable biomarkers that can be used for early diagnosis and prognosis prediction poses a major obstacle in the management of stomach cancer. The aim of this study is to investigate genetic predisposition in gastric cancer patients and to determine the expression levels of selected miRNAs in blood and/or tumor tissue and to evaluate the possible relationships of these levels with clinical-pathological characteristics. Thus, the aim is to investigate the usability of the studied miRNAs as biomarkers. Methods: Twenty-one patients diagnosed with gastric cancer were included in the study. Tumor tissue and peripheral blood samples were collected from 12 patients, while only peripheral blood samples were collected from 10 patients. RNA sequencing was performed on tumor tissue, and the most highly and least highly expressed 10 miRNAs were identified. The levels of the identified miRNAs in the patients' peripheral blood were determined by Real-Time Polymerase Chain Reaction (RT-PCR). The expression levels of the miRNAs were compared according to the patients' stage, gender, H. pylori status, treatment with neoadjuvant therapy, and Lauren histological subtype. Results: The expression levels of 10 different miRNAs obtained from RNA sequencing data of tumor tissue samples were analyzed. This analysis revealed high expression in 6 miRNAs and low expression in 4 miRNAs. The miRNAs with high expression in tissue samples were hsa-miR-143, hsa-miR-21, hsa-miR-148a, hsa-miR-27b, hsa-let-7i, and hsa-miR-30a, while the miRNAs with low expression were identified as hsa-miR-26b, hsa-miR-340, hsa-let-7c, and hsa-miR-199b. In the 10 patients studied, the expression levels in tissue and peripheral blood were found to be similar. Conclusion: The findings of this study indicate that certain circulating miRNAs (such as miR-21, miR-148a, and the let-7 family) can be used as minimally invasive biomarkers for gastric cancer. These miRNAs may be clinically valuable in predicting disease prognosis and monitoring response to treatment.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    824507

    Comprehensive association analysis of selected singlenucleotide polymorphisms with cancer prevalence inJapanese elderly population.

    Japon yaşlı nüfusundan seçilen grupların kapsamlı tek nükleotid polimorfizmleri ile kanser prevalansı analizi

    CÜNEYD PARLAYAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2014

    BiyoistatistikTokyo Medıcal And Dental Unıversıty

    Epidemiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MASAAKI MURAMATSU

  2. Tez No

    808949

    Investigation of NFİB function and regulation of its putative target genes in human neural stem cell and SH-SY5Y neuroblastoma cell lines

    İnsan sinir kök hücre ve SH-SY5Y nöroblastom hücre hatlarında NFIB işlevinin ve potansiyel hedef genlerinin regülasyonunun incelenmesi

    BETÜL ULUCA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Genetikİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ASLI KUMBASAR

  3. Tez No

    823936

    Investigation of helicobacter pylori virulence genes and t-cell responses in pediatric gastritis patients

    Pediatrik gastrit hastalarında helikobakter pylori virülans genleri ve t-hücre cevaplarının araştırılması

    NİRAN ÖZDEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2023

    Allerji ve İmmünolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)

    PROF. DR. AYÇA SAYI YAZGAN

    DR. ÖĞR. ÜYESİ SİNEM ÖKTEM OKULLU

  4. Tez No

    568716

    Meme kanserine yatkınlıkta survıvın gen polimorfizmlerinin incelenmesi

    Investigation of survivin gene polymorphisms with breast cancer susceptibility

    ROYA MASHADIYEVA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Moleküler Tıpİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. İLHAN YAYLIM

  5. Tez No

    904188

    Cbioportal aracı kullanarak ferroptoz direnci ve hassasiyeti ile ilişkili genlerin araştırılması

    Investigation of genes associated with ferroptosis resistance and sensitivity using the cbioportal tool

    MEHMET GÖKHAN ERTUĞRUL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiZonguldak Bülent Ecevit Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ KEREM MERT ŞENSES

Geri Dön