Geri Dön

Ubiquitylation of Alpha Synuclein Via in Vitro Chemical Ligation Approach

İN VİTRO KİMYASAL LİGASYON YÖNTEMİYLE ALFA SİNUKLEİNİN UBİKİTİNLENMESİ

  1. Tez No: 989485
  2. Yazar: ESRA OKTAY
  3. Danışmanlar: PROF. ZHİHAO ZHUANG
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biochemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2018
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Unıversıty Of Delaware
  10. Enstitü: Yurtdışı Enstitü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyokimya Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Kimya Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Nörodejeneratif hastalıklar, beyinde anormal protein birikimi sonucu ortaya çıkar. Bu anormal proteinler (yanlış katlanmış proteinler), bir araya geldiklerinde hücreler için toksik hale gelir. Bu proteinler, sentezlerinin ardından başta 'Ubikitin Proteazom Sistemi-UPS' olmak üzere, şaperon aracılı otofaji veya makrootofaji gibi diğer protein yıkım sistemlerinden kaçarak protein yapılı inklüzyon cisimcikleri ya da bazı durumlarda aggresomlar oluştururlar. Proteinöz inklüzyon cisimcikleri, Parkinson hastalığı gibi çeşitli nörodejeneratif hastalıkların karakteristik bir özelliğidir. Parkinson hastalığında aggresom ilişkili inklüzyon cisimcikleri olarak bilinen Lewy cisimciklerinin, mono- ve poli-ubikitinlenmiş alfa sinüklein karışımını içerdiği bulunmuştur. Lewy cisimciklerindeki alfa sinüklein ile ilgili bulgular, bilim insanlarını, parçalanmak yerine birikerek inklüzyon oluşturan monoubikitinlenmiş alfa sinükleini daha kapsamlı incelemeye yönlendirmiştir. Lewy cisimciklerinde alfa sinükleinin agregasyon eğilimi ile monoubikitinlenmesi arasında pozitif bir korelasyon olduğu aydınlatılmıştır. Tüm bunların ardından, poliubikitinlenmiş alfa sinüklein formu, Lewy cisimciklerindeki alfa sinükleinin agregasyon özelliklerindeki rolünün ortaya çıkarılması amacıyla ilgi odağı haline gelmiştir. Bu tezin amacı, in vitro kimyasal ligasyon yöntemi kullanılarak ubikitinlenmiş alfa sinüklein üretmektir.

Özet (Çeviri)

Neurodegenerative diseases are resulted from abnormal proteins' accumulation in the brain. These abnormal proteins (misfolded proteins) become toxic to the cells upon their aggregation. They escape from protein quality control machinery known primarily 'Ubiquitin Proteasome System- UPS' or other protein degradation systems such as chaperone mediated autophagy or macroautophagy after their translation and form proteinaceous inclusion bodies or, in some cases, aggresomes. Proteinaceous inclusion bodies are landmark of several neurodegenerative diseases such as Parkinson's disease. Lewy bodies known as aggresome-related inclusion bodies in Parkinson's are found having a mixture of mono- and poly-ubiquitinated alpha synuclein. The findings about alpha synuclein in Lewy bodies led scientist to think comprehensively monoubiquitinated alpha synuclein which accumulates forming inclusions instead of being degraded. The relationship between aggregation tendency and monoubiquitination of alpha synuclein in Lewy bodies were enlightened as positive correlation. After all that polyubiquitinated form of alpha synuclein attracted attention to be found out its role in aggregation properties of alpha synuclein in Lewy bodies. The aim of this thesis to generate ubiquitinated alpha synuclein using in vitro chemical ligation approach.

Benzer Tezler

  1. Investigation of the effects of SUMO modification on two critical proteins: A pathogenic NEK1 mutant that drives ALS pathogenesis and the CRISPR-associated CAS9 protein

    SUMO modifikasyonunun iki kritik protein üzerinde etkilerinin incelenmesi: ALS patojenezine sebep olan patojenik NEK1 mutantı ve CRISPR ile ilişkili CAS9 proteini

    TUNAHAN ERGÜNAY

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2022

    Tıbbi BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ RİZA UMUT ŞAHİN

  2. A novel post-translational modification on the central CRISPR enzyme: Discovery of CAS9 ubiquitylation

    CRISPR sisteminin kilit enzimi üzerinde yeni birposttranslasyonel modifikasyon: CAS9 ubikitinasyonununkeşfi

    ARDA BARAN ÇELEN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2019

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. ALİ RİZA UMUT ŞAHİN

  3. RIG-I-CARD1, RIG-I-CARD2, RNF125-Ring finger ve TRIM25-SPRY domainlerinin yapısal çalışmalarda kullanılmak amacıyla üretilmesi ve NMR ile karakterizasyonu

    Production and nmr characterization of RIG-I-CARD1, RIG-I-CARD2, RNF125-Ring finger and TRIM25-SPRY for structural studies

    GÜL DEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2013

    BiyokimyaMuğla Sıtkı Koçman Üniversitesi

    Kimya Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. EMİNE SONAY ELGİN

  4. Functional and biochemical analysis of a novel deubiquitinating enzyme, USP32

    Yeni bir deubikitinaz enzimi olan USP32 nin fonksiyonel ve biyokimyasal analizi

    AYŞEGÜL SAPMAZ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2012

    BiyolojiOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. A. ELİF ERSON BENSAN