Geri Dön

KOLOREKTAL KANSERDE miR-4295, miR-4720-5p, miR-4773, miR-6831-5p ve miR-7161-5p EKSPRESYON PROFİLLERİNİN KANTİTATİF PCR ve BİYOİNFORMATİK YAKLAŞIMLARLA ARAŞTIRILMASI

Investigation of mir-4295, miR-4720-5p, miR-4773, mir-6831-5p and mir-7161-5p expression profiles in colorectal cancer using quantitative pcr and bioinformatics approaches

PDF İndir

  1. Tez No: 1020274
  2. Yazar: RECEP EŞKİN
  3. Danışmanlar: DOÇ. DR. TÜRKAN GÜRER, PROF. DR. FİLİZ ÖZBAŞ GERÇEKER
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Kolorektal kanser, miRNA, RT-qPCR, biyoinformatik, Colorectal cancer, miRNA, RT-qPCR, bioinformatics
  7. Yıl: 2026
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gaziantep Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

Bu çalışmada miR-4295, miR-4720-5p, miR-4773, miR-6831-5p ve miR-7161-5p'nin ekspresyon profillerinin belirlenmesi ve kolorektal kanser patogenezindeki rollerinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya, 86 hastaya ait eşleştirilmiş tümör ve komşu normal dokulardan elde edilen toplam 172 örnek dahil edilmiştir. miRNA ekspresyon düzeyleri ile klinikopatolojik parametreler arasındaki ilişkiler ve miRNA'lar arasındaki korelasyonlar değerlendirilmiştir. Ayrıca, tahmini hedef genlerin biyolojik önemini ortaya koymak amacıyla DIANA-miRPath v3 platformu kullanılarak GO ve KEGG yolak analizleri gerçekleştirilmiştir. Sonuçlara göre miR-4295 ve miR-4720-5p'nin tümör dokularında anlamlı düzeyde yüksek, miR-4773 ve miR-6831-5p'nin ise düşük düzeyde eksprese edildiği belirlenmiştir (p <0.05). Buna karşın, miR-7161-5p ekspres-yonu açısından tümör ve komşu normal dokular arasında anlamlı fark saptanmamıştır (p> 0.05). Zenginleştirme analizleri, bu miRNA'ların TGF-β, mTOR, ErbB ve FoxO sinyal yolakları ile endositoz ilişkili süreçlerde görev alan gen ağlarını düzenlediğini göstermiştir. Genel olarak, miR-4295 ve miR-4720-5p'nin onkojenik, miR-4773 ve miR-6831-5p'nin ise tümör baskılayıcı özellik gösterebileceği değerlendirilmiştir. Bu bulgular, söz konusu miRNA'ların kolorektal kanser patogenezi ve progresyonunda önemli düzenleyici roller üstlenebileceğini düşündürmektedir.

Özet (Çeviri)

This study aimed to determine the expression profiles of miR-4295, miR-4720-5p, miR-4773, miR-6831-5p, and miR-7161-5p and to investigate their roles in colorectal cancer pathogenesis. A total of 172 paired tumor and adjacent normal tissue samples obtained from 86 patients were included in the study. Associations between miRNA expression levels, clinicopathological parameters, and inter-miRNA correlations were evaluated. In addition, GO and KEGG pathway analyses were performed using the DIANA-miRPath v3 platform to reveal the biological significance of predicted target genes. The results showed that miR-4295 and miR-4720-5p were significantly upregu-lated, whereas miR-4773 and miR-6831-5p were downregulated in tumor tissues (p <0.05). In contrast, no significant difference was detected in miR-7161-5p expression between tumor and adjacent normal tissues (p> 0.05). Enrichment analyses demonstra-ted that these miRNAs regulate gene networks involved in TGF-β, mTOR, ErbB, and FoxO signaling pathways as well as endocytosis-related processes. Overall, miR-4295 and miR-4720-5p may exhibit oncogenic effects, whereas miR-4773 and miR-6831-5p may function as tumor suppressors. These findings suggest that these miRNAs may play important regulatory roles in colorectal cancer pathogenesis and progression.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    706920

    Kolorektal kanserde miR-519a ve miR 379 ekspresyon düzeylerinin araştırılması

    Investigation of miR-519a and miR-379 expression levels in colorectal cancer

    MEHMET EMİN KIZAKOĞLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TÜRKAN GÜRER

    DR. ÖĞR. ÜYESİ ALPER AYTEKİN

  2. Tez No

    888048

    Kolorektal kanserde miR-2861 ve miR-5011-5p ekspresyon düzeylerinin araştırılması

    Investigation of expression levels miR-2861 ve miR-5011-5p incolorectal cancer

    HİKMET KADAKAL

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2024

    BiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TÜRKAN GÜRER

    DR. ÖĞR. ÜYESİ DENİZ MIHÇIOĞLU

  3. Tez No

    691734

    Kolorektal kanserli hastaların tümörlü ve sağlıklı dokularında miR-485-3p ve miR-4728-5p ekspresyon düzeylerinin araştırılması

    Investıgatıon of miR-485-3p and miR-4728-5p expressıon levels ın tumor and healthy tıssues of patıents wıth colorectal cancer

    ENES ÇAKI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2021

    BiyolojiGaziantep Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ TÜRKAN GÜRER

    DOÇ. DR. SEVGİ GEZİCİ

  4. Tez No

    637073

    Evaluation of microRNAs (MIR-92A, MIR-126, MIR-195, MIR-214, MIR-224 and MIR-1247), as predictive markers of colorectal cancer (CRC) and/or prognostic factor in Turkish population

    Türk popülasyonunda mikroRNA'larin (MİR-92a, MİR-126, MİR-195, MİR-214, MİR-224 ve MİR-1247), kolorektal kanser (CRC) tanı ve / veya prognostik faktör olarak değerlendirilmesi

    AMAL FATHALLA MOFTAH SRGEWA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2020

    Moleküler Tıpİstanbul Üniversitesi

    Moleküler Tıp Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SADRETTİN PENÇE

  5. Tez No

    918624

    Kolon kanser modeli oluşturulan ratlarda mir-21 ve ilgili genin değerlendirilmesi

    Evaluation of mir-21 and related gen in colon cancer model rats

    İCLAL ŞAHİN

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2025

    Veteriner HekimliğiSelçuk Üniversitesi

    Veterinerlik Biyokimyası Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZAFER BULUT

Geri Dön