Bakteriyel biyofilm üzerine proteazların etkisinin araştırılması ve diğer uygulamalarla karşılaştırılması
Investigation of the effects of proteases on bacterial biofilm formation and comparison with other applications
- Tez No: 1020561
- Danışmanlar: DR. ÖĞR. ÜYESİ AYŞENUR KAYA
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Kilis 7 Aralık Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada Bacillus spp. suşlarından elde edilen proteazların enzimatik özellikleri ile biyofilm oluşumu ve quorum sensing ile ilişkili pigment üretimi üzerindeki etkileri değerlendirilmiştir. Skimmilk agar analizlerinde izolatların proteaz aktivitesinin 5–15 mm zon çapı aralığında değiştiği ve en yüksek aktivitenin pH 9 ve 35°C koşullarında elde edildiği belirlenmiştir. Pseudomonas aeruginosa suşunda biyofilm oluşumunun kontrol grubunda OD570 = 1,58 olduğu, proteaz uygulamalarında ise biyofilm yoğunluğunun 1,31–3,17 aralığında değiştiği ve tüm grupların güçlü biyofilm oluşturduğu belirlenmiştir. Chromobacterium violaceum suşunda biyofilm yoğunluğu kontrol grubunda OD570 ≈ 3,57 olup, proteaz uygulamalarında 2,98–3,45 aralığında bulunmuştur. Pyocyanin analizinde kontrol değeri OD520 = 0,6827 olup, B3 ve B29 izolatlarının sırasıyla yaklaşık %51,7 ve %33,2 inhibisyon gösterdiği belirlenmiştir. Violacein analizinde ise kontrol değeri OD585 = 1,6318 olup yalnızca B3 izolatının yaklaşık %14,8 inhibisyon oluşturduğu tespit edilmiştir. Antibakteriyel aktivite testlerinde proteazların inhibisyon zonu oluşturmadığı gözlenmiştir. SDS-PAGE analizinde protein bantlarının yaklaşık 25–40 kDa aralığında yer aldığı ve bantların dağınık olması nedeniyle enzim preparatlarının tam saf olmadığı belirlenmiştir.
Özet (Çeviri)
In this study, the enzymatic properties of proteases obtained from Bacillus spp. strains, as well as their effects on biofilm formation and quorum sensing-related pigment production, were evaluated. Skim milk agar analyses revealed that protease activity of the isolates ranged between 5 15 mm in zone diameter, with maximum activity observed at pH 9 and 35°C. In Pseudomonas aeruginosa, the biofilm formation in the control group was measured as OD570 = 1.58, while biofilm intensity in protease-treated groups ranged between 1.31 3.17, with all groups classified as strong biofilm producers. In Chromobacterium violaceum, the control biofilm density was approximately OD570 ≈ 3.57, and values ranged between 2.98–3.45 following protease treatment. In pyocyanin analysis, the control value was OD520 = 0.6827, and isolates B3 and B29 exhibited approximately 51.7% and 33.2% inhibition, respectively. In violacein analysis, the control value was OD585 = 1.6318, and only isolate B3 showed inhibition at approximately 14.8%. No inhibition zones were observed in antibacterial activity assays. SDS-PAGE analysis showed that protein bands were distributed within the 25–40 kDa range, and the presence of diffuse bands indicated that the enzyme preparations were not fully purified.
Benzer Tezler
- Titanyum esaslı medikal malzeme yüzeyinde bakteriyel tutunma ve biyofilm oluşumunun incelenmesi
Investigation of microbial adhesion and biofilm formation on the surface of titanium based medical material
SEMİH BAYRAKTAR
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
Mikrobiyolojiİstanbul ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ESRA SUNGUR
- Development of enzyme-based coating methods for the prevention of bacterial biofilm formation
Bakteriyel biyofilm oluşumunu engellemeye yönelik enzim bazlı kaplama yöntemlerinin geliştirilmesi
ABDULLAH SERT
Doktora
İngilizce
2014
Biyoteknolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
DOÇ. DR. NEVİN GÜL-KARAGÜLER
PROF. DR. MELEK TÜTER
- Değişik klinik örneklerden izole edilen pseudomonas aeruginosa suşlarında virülans faktörleri ve bu faktörlerin sentezlenmesinde rol oynayan bakteriyel iletişim“Quorum Sensing”sistemindeki sinyal moleküllerinin hastalık patogenezindeki rolü
Başlık çevirisi yok
SÜLEYMAN ÖNAL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2005
MikrobiyolojiSüleyman Demirel ÜniversitesiMikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ.DR. BUKET CİCİOĞLU ARIDOĞAN
- Development of antimicrobial peptides specific to biofilm formation bacteria and binding to catheter surface
Biyofilm oluşturan bakterilere özgü antimikrobiyal peptitlerin geliştirilmesi ve kateter yüzeyine bağlanması
TUBA POLAT
Yüksek Lisans
İngilizce
2021
BiyoteknolojiAcıbadem Mehmet Ali Aydınlar ÜniversitesiMedikal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ NİHAN ÜNÜBOL
DR. ÖĞR. ÜYESİ ERKAN MOZİOĞLU
- Bakteriyel biyofilm oluşumunu engelleyecek moleküllerin sentezi ve anti-biyofilm etkinliklerinin incelenmesi
Synthesis of the bacterial biofilm inhibitor molecules and investigation of their anti-biofilm activity
MERVE BİÇER
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
Gıda MühendisliğiHitit ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ SEÇİL TÜRKSOY