Palandöken dağı toprak örneklerinden izole edilen Stenotrophomonas maltophilia strainlerinde karbapenemaz genlerinin moleküler karakterizasyonu
Molecular characterization of carbapenemase genes in Stenotrophomonas maltophilia strains isolated from soil samples collected from palandöken mountain
- Tez No: 1024462
- Danışmanlar: PROF. KENAN KARAGÖZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2026
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Ağrı İbrahim Çeçen Üniversitesi
- Enstitü: Lisansüstü Eğitim Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Moleküler Biyoloji Bilim Dalı
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Bu çalışmada, Palandöken Dağı toprak örneklerinden izole edilen Stenotrophomonas maltophilia strainlerinde karbapenemaz üretiminden sorumlu genlerin araştırılması amaçlanmıştır. Bu kapsamda daha önceki çalışmalarda izole edilmiş olan 11 strainde karbapenemaz üretimi modifiye karba NP testi ve çift disk sinerji testi ile doğrulanmıştır. MIS ve tür spesifik PZR ile tanısı yapılan strainler bazı biyokimyasal özellikleri açısından da değerlendirilmiştir. Karbapenemaz üretiminden soruınlu genlerin moleküler karakterizasyonu için farklı sınıflara ait 12 karbapenemaz geninin (IMP, VIM, SPM, NDM, BIC, OXA, KPC, AIM, GIM, SIM, DIM ve GES) varlığı PZR ile araştırılmıştır. Strainler S. maltophilia' da doğal olarak bulunan L1 karbapenemaz geninin varlığı açısından test edilmemiştir. Yapılan çalışmalar sonucunda kullanılan farklı yöntemlerle tüm strainlerin tanı sonucu S. maltophilia olarak doğrulanmıştır. Buna ilaveten varlığı test edilen 12 karbapenemaz geninden NDM' ye tüm strainlerde rastlanırken, diğer 11 karbapenemaz geninin varlığına hiçbir strainde rastlanmamıştır. Elde edilen bulgular örnekleme alanında NDM geninin, özellikle S. maltophilia' da bilinenden sıra dışı şekilde yüksek bir frekansta ortaya çıktığını ve NDM geninin görece izole alanlarda bile yaygın şekilde bulunabileceğini göstermektedir. Bu çalışmanın antibiyotik direnç genlerinin yayılımının kontrol altına alınması için etkin stratejilerin geliştirilmesinde yeni yaklaşımlar benimsenmesine katkı sunacağı düşünülmektedir.
Özet (Çeviri)
The aim of this study was to investigate carbapenemase-encoding genes in Stenotrophomonas maltophilia strains isolated from soil samples collected from Palandöken Mountain. Within the scope of the study, carbapenemase production in 11 previously isolated strains was confirmed using the modified Carba NP test and the double-disk synergy test. The strains, identified by the Microbial Identification System (MIS) and species-specific PCR, were also evaluated for selected biochemical characteristics. To achieve the molecular characterization of carbapenemase production, the presence of 12 carbapenemase genes representing different molecular classes (IMP, VIM, SPM, NDM, BIC, OXA, KPC, AIM, GIM, SIM, DIM, and GES) was investigated by PCR. The strains were not tested for the presence of the L1 carbapenemase gene, which is intrinsically encoded in S. maltophilia. The results obtained using the different identification methods consistently confirmed all strains as S. maltophilia. Furthermore, among the 12 carbapenemase genes investigated, the NDM gene was detected in all strains, whereas none of the remaining 11 carbapenemase genes were identified in any of the isolates. These findings indicate an unexpectedly high prevalence of the NDM gene within S. maltophilia populations in the sampled area and suggest that this resistance determinant may be widely distributed even in relatively isolated environments. It is anticipated that the findings of this study will contribute to the development of novel strategies for controlling the dissemination of antibiotic resistance genes.
Benzer Tezler
- Düşük sıcaklıklarda toprak zeminlerin dayanım ve deformasyon karakteristiklerinin incelenmesi
The investigation of strength and deformability of soil at low temperatures
RÜŞTÜ ORKUN KARAMUT
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
Jeoloji MühendisliğiHacettepe ÜniversitesiJeoloji Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ADİL BİNAL
- Bakteriler ile biyoaktif pigmentlerin üretimi
Production of bioactive pigments using bacteria
ELVAN EROĞLU
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
BiyoteknolojiAtatürk ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA ÖZKAN BALTACI
- Palandöken dağı ve çevresinin atmosferik görüş kalitesinin belirlenmesi
Determination of atmospherical seeing quality of Palandöken mountain and its environment
HANİFİ DEMİRCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
Fizik ve Fizik MühendisliğiAtatürk ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CAHİT YEŞİLYAPRAK
- Palandöken Dağı ve çevresinin atmosferik özelliklerinin belirlenmesi
The atmospherical properties of Palandöken Mountain and its environment
TUBA AKKUŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2010
Astronomi ve Uzay BilimleriAtatürk ÜniversitesiFizik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. CAHİT YEŞİLYAPRAK
- Palandöken dağı kriyokonit oluşumlarındaki mikrobiyal biyoçeşitliliğin kültüre bağımlı ve kültürden bağımsız (metagenomik) yöntemlerle araştırılması
Investigation of microbial biodiversity in cryoconite formations in Palandöken mountain by culture dependent and culture independent (metagenomic) methods
ŞEYMA AKSU
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
BiyolojiAtatürk ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ MEHMET KARADAYI