Nohut (cicer arietinum L. ) bitkisinde farklı çeşitler arasındaki genetik polimorfizmin DNA markır teknolojisi ile tanımlanması
Determining the genetic polymorphism between different chickpea (cicer arietinum L. ) varieties by utilizing DNA marker technique
- Tez No: 109931
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. S. TÜLAY HEKİMBAŞI
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2001
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 124
Özet
IV t ? ? t> ? ÖZET Ji )0?fl\ Bu çalışmada adlan Canıtez, Uzunlu, Menemen, ER-99, 87AK71112, 87AK71114, ILC-195-2, ILC-482, Gökçe olan Türkiye'ye has 9 farklı nohut (Cicer arietimtm L.) çeşidinin parmakizleri çıkanhp, RAPD markırlanna dayah polimorfîzm oranlan belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışma adı geçen nohut çeşitleri üzerinde yapılan ilk RAPD analizi çalışmasıdır. Analizler morfolojik özellikleri bilinen bitkilerin genç yapraklarından izole edilen genomik DNA'lann, rastgele seçilmiş 10 bazhk 9 farklı oligonüklotidlerin kullanılması ile elde edilen markırlann yorumlanması yoluyla yapılmıştır. Çalışılan bütün primerler İle çoğaltım reaksiyonlan başardı olmuştur ve büyüklükleri ortalama olarak 250-5000 baz çifti arasında değişen, toplam 122 markır elde edilmiştir. Birbirlerine en çok benzeyen çeşitler ile birbirlerine en az benzeyen çeşitler belirlenmiştir. Birbirine en çok benzeyen çeşitler arasında polimorfîzm en düşük durumda iken, en az benzeyenler arasındaki polimorfîzm en yüksek durumdadır. Buna göre, çalışılan çeşitlerde en düşük polimorfizme Gökçe çeşidi ile ILC- 195-2 çeşidi arasında rastlanmıştır (benzerlik oram: %60,31). En yüksek polimorfîzm (benzerlik oram: %26,11) ise ER-99 çeşidi ve 87AK71112 çeşidi arasında gözlenmiştir. Aynca genel olarak İncelendiğinde ER-99 çeşidinin diğer çeşitlere göre çok daha polimorfîk olduğu sonucuna ulaşılmıştır. Bu sonucun dışında diğer çeşitler ile arasında nispeten daha az olmakla birlikte polimorfîzm gözlenmiş üç çeşit daha mevcuttur. Bunlar ILC-482, 87AK71112 ve Canıtez çeşitleridir. Birbirlerine morfolojik olarak ve yetişme koşullan bakımından en çok benzeyen 87AK71112, 87AK71114 çeşitleri arasında beklenenden çok daha düşük bir benzerlik (benzerlik oranı: %40,09) gözlenmiştir. Bu çeşitlerden 87AK71114 çeşidinin Menemen'e (benzerlik oranı:%56,36); 87AK71112 çeşidinin ILC-195-2 (benzerlik oranı: %45,45) çeşidine daha çok benzedikleri belirlenmiştir. Sonuç olarak bu çalışmada kullanılmış olan nohut çeşitlerinde çok yüksek olmamakla birlikte polimorfîzm saptanmıştır. -d*"*'
Özet (Çeviri)
? v % -i ' h £ SUMMARY In the presented study, DNA fingerprints of Canttez, Uzunlu, Menemen, ER- 99, 87AK71112, 87AK71114, ILC-195-2, ILC-482 and Gökçe varieties of chickpea (Cicer coietirmm L.) which are generic to Turkey have been investigated. Polymorphism degrees of these varieties have also been determined. RAPD analysis technique was applied to establish the polymorphism at DNA level. This study is the first RAPD analysis carried out on these varieties. Interpretations of markers were made using 9 different 10 base length oligonucleotides of genomic DNAs that have been isolated from the young leaves of the crop whose morphologic traits are known. Amplification reactions on all selected primers were succesfully performed. A total of 122 markers having an average size between 250-5000 base pairs were obtained. Calculations were made on varieties between similar and un similar varieties. In consequence it is found that the morphologically most similar varieties have the lowest polymorphism while the morphologically least similar ones have the highest. Among the studied varieties, the lowest polymorphism (Similarity: 60,31%) has been found in between Gökçe and ILC-195-2. In addition to that findings, the highest polymorphism (Similarity: 26,11%) was observed in between the varieties of ER-99 and 87AK71112. Compared to the other varieties, ER-99 was found to be more polymorphic. Considerably lower degree of polymorphism was observed among three more varieties (ILC-482, 87AK71112 and Canrtez). Similarity degree between the varieties of 87AK71 1 12 and 87AK71 1 14 was found out to be lower (40,09%) than expected. Although, these varieties have common morphological traits, 87AK71 1 12 was found to be more similar to ILC-195-2 (45,45%) and 87AK71 1 14 observed to be more similar to Menemen (56,36%). As a result of this study, polymorphism was determined to be not too high among the studied varieties.
Benzer Tezler
- Kuraklık stresi ve Orobanche crenata enfeksiyonuna maruz bırakılan kuraklığa toleransları farklı nohut (Cicer arietinum L.)çeşitlerinde antioksidan savunma yanıtları
The antioxidant responces against to drought stress and Orobanche crenata infection on chickpea (Cicer arietinum L.) varieties which have known diferent drought tolerances
BUŞRA ÇALIK
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. OKAN ACAR
- Türkiye'de siyah nohut (Cicer arietinum L.) bitkisinde in vitro rejenerasyon çalışmaları
In vitro regeneration studies of black chickpea (Cicer arietinum L.) plant of turkey
ARİFE KİRTİŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2019
BiyoteknolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiBiyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUHAMMAD AASIM
- In vitro koşullarda siyah ve beyaz nohut (Cicer arietinum L.) genotiplerinde tuz stresinin çimlenme ve büyüme üzerine etkileri
Effects of salt stress on germination and growth of black and white chickpea (Cicer arietinum L.) genotypes under In vitro conditions
FATMA AKIN
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyoteknolojiNecmettin Erbakan ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUHAMMAD ASIM
- Nohut (Cicer arietinum L.), bakla (Vicia faba L.) ve bezelye (Pisum sativum L.)'de besin elementlerinin verim ve verim unsurları üzerine etkisi
The effect of plant nutrients on the yield and yield components on the chickpea (Cicer arietinum L.), bean (Vicia faba L.) and pea (Pisum sativum L.)
SEVGİ SAYLAK
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatDicle ÜniversitesiTarla Bitkileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. BEHİYE TUBA BİÇER
- Gümüş nanopartiküllerin nohut (Cicer arietinum L.) bitkisinde bazı fizyolojik ve biyokimyasal özelliklere etkisi
Some physiological and biochemical properties of silver nanoparticles impact on chickpea (Cicer arietinum L.) plants
SEFA EKİNCİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
BiyolojiAksaray ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. FAZİLET ÖZLEM ÇEKİÇ