Geri Dön

Nohut (cicer arietinum L. ) bitkisinde farklı çeşitler arasındaki genetik polimorfizmin DNA markır teknolojisi ile tanımlanması

Determining the genetic polymorphism between different chickpea (cicer arietinum L. ) varieties by utilizing DNA marker technique

  1. Tez No: 109931
  2. Yazar: YAPRAK AKTEKİN
  3. Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. S. TÜLAY HEKİMBAŞI
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: DNA, Morfolojik özellikler, Nohut, Polimorfizm-genetik, RAPD, DNA, Morphological properties, Chickpea, Polymorphism-genetic, RAPD
  7. Yıl: 2001
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Gebze Yüksek Teknoloji Enstitüsü
  10. Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

IV t ? ? t> ? ÖZET Ji )0?fl\ Bu çalışmada adlan Canıtez, Uzunlu, Menemen, ER-99, 87AK71112, 87AK71114, ILC-195-2, ILC-482, Gökçe olan Türkiye'ye has 9 farklı nohut (Cicer arietimtm L.) çeşidinin parmakizleri çıkanhp, RAPD markırlanna dayah polimorfîzm oranlan belirlenmesi amaçlanmıştır. Çalışma adı geçen nohut çeşitleri üzerinde yapılan ilk RAPD analizi çalışmasıdır. Analizler morfolojik özellikleri bilinen bitkilerin genç yapraklarından izole edilen genomik DNA'lann, rastgele seçilmiş 10 bazhk 9 farklı oligonüklotidlerin kullanılması ile elde edilen markırlann yorumlanması yoluyla yapılmıştır. Çalışılan bütün primerler İle çoğaltım reaksiyonlan başardı olmuştur ve büyüklükleri ortalama olarak 250-5000 baz çifti arasında değişen, toplam 122 markır elde edilmiştir. Birbirlerine en çok benzeyen çeşitler ile birbirlerine en az benzeyen çeşitler belirlenmiştir. Birbirine en çok benzeyen çeşitler arasında polimorfîzm en düşük durumda iken, en az benzeyenler arasındaki polimorfîzm en yüksek durumdadır. Buna göre, çalışılan çeşitlerde en düşük polimorfizme Gökçe çeşidi ile ILC- 195-2 çeşidi arasında rastlanmıştır (benzerlik oram: %60,31). En yüksek polimorfîzm (benzerlik oram: %26,11) ise ER-99 çeşidi ve 87AK71112 çeşidi arasında gözlenmiştir. Aynca genel olarak İncelendiğinde ER-99 çeşidinin diğer çeşitlere göre çok daha polimorfîk olduğu sonucuna ulaşılmıştır. Bu sonucun dışında diğer çeşitler ile arasında nispeten daha az olmakla birlikte polimorfîzm gözlenmiş üç çeşit daha mevcuttur. Bunlar ILC-482, 87AK71112 ve Canıtez çeşitleridir. Birbirlerine morfolojik olarak ve yetişme koşullan bakımından en çok benzeyen 87AK71112, 87AK71114 çeşitleri arasında beklenenden çok daha düşük bir benzerlik (benzerlik oranı: %40,09) gözlenmiştir. Bu çeşitlerden 87AK71114 çeşidinin Menemen'e (benzerlik oranı:%56,36); 87AK71112 çeşidinin ILC-195-2 (benzerlik oranı: %45,45) çeşidine daha çok benzedikleri belirlenmiştir. Sonuç olarak bu çalışmada kullanılmış olan nohut çeşitlerinde çok yüksek olmamakla birlikte polimorfîzm saptanmıştır. -d*"*'

Özet (Çeviri)

? v % -i ' h £ SUMMARY In the presented study, DNA fingerprints of Canttez, Uzunlu, Menemen, ER- 99, 87AK71112, 87AK71114, ILC-195-2, ILC-482 and Gökçe varieties of chickpea (Cicer coietirmm L.) which are generic to Turkey have been investigated. Polymorphism degrees of these varieties have also been determined. RAPD analysis technique was applied to establish the polymorphism at DNA level. This study is the first RAPD analysis carried out on these varieties. Interpretations of markers were made using 9 different 10 base length oligonucleotides of genomic DNAs that have been isolated from the young leaves of the crop whose morphologic traits are known. Amplification reactions on all selected primers were succesfully performed. A total of 122 markers having an average size between 250-5000 base pairs were obtained. Calculations were made on varieties between similar and un similar varieties. In consequence it is found that the morphologically most similar varieties have the lowest polymorphism while the morphologically least similar ones have the highest. Among the studied varieties, the lowest polymorphism (Similarity: 60,31%) has been found in between Gökçe and ILC-195-2. In addition to that findings, the highest polymorphism (Similarity: 26,11%) was observed in between the varieties of ER-99 and 87AK71112. Compared to the other varieties, ER-99 was found to be more polymorphic. Considerably lower degree of polymorphism was observed among three more varieties (ILC-482, 87AK71112 and Canrtez). Similarity degree between the varieties of 87AK71 1 12 and 87AK71 1 14 was found out to be lower (40,09%) than expected. Although, these varieties have common morphological traits, 87AK71 1 12 was found to be more similar to ILC-195-2 (45,45%) and 87AK71 1 14 observed to be more similar to Menemen (56,36%). As a result of this study, polymorphism was determined to be not too high among the studied varieties.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    457047

    Kuraklık stresi ve Orobanche crenata enfeksiyonuna maruz bırakılan kuraklığa toleransları farklı nohut (Cicer arietinum L.)çeşitlerinde antioksidan savunma yanıtları

    The antioxidant responces against to drought stress and Orobanche crenata infection on chickpea (Cicer arietinum L.) varieties which have known diferent drought tolerances

    BUŞRA ÇALIK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2016

    BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. OKAN ACAR

  2. Tez No

    997808

    Nohut (cicer arietinum l.) bitkisinde LBD gen ailesi üyelerinin genom düzeyinde tanımlanması ve abiyotik stres cevabı ile olan ilişkilerinin gen ifadesi düzeyinde belirlenmesi

    Identification of LBD gene family members in chickpea (cicer arietinum L.) plant at genome level and determination of their relationship with abiotic stress response at gene expression level

    NESLİHAN ÜNAL

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2026

    BiyoteknolojiAnkara Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. EMİNE SÜMER ARAS

  3. Tez No

    418520

    Gümüş nanopartiküllerin nohut (Cicer arietinum L.) bitkisinde bazı fizyolojik ve biyokimyasal özelliklere etkisi

    Some physiological and biochemical properties of silver nanoparticles impact on chickpea (Cicer arietinum L.) plants

    SEFA EKİNCİ

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiAksaray Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. FAZİLET ÖZLEM ÇEKİÇ

  4. Tez No

    151700

    Kahramanmaraş koşullarında farklı sıra arası ve sıra üzeri mesafelerinin nohut(Cicer arietium L.) bitkisinde verim ve verim unsurları üzerine etkisi

    The effect of different row spaces and in-row spaces on the yield components of chickpea (cicer arietium L.) plant in Kahramanmaraş conditions

    AHMET PARLADI

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2004

    ZiraatKahramanmaraş Sütçü İmam Üniversitesi

    Tarla Bitkileri Ana Bilim Dalı

    PROF.DR. MUSTAFA ÇÖLKESEN

  5. Tez No

    301738

    Bitki büyümesini teşvik edici bakterilerin izolasyonu, identifikasyonu ve nohut (Cicer arietinum L. Cv. Aziziye-94) bitkisinde biyogübre ajanı olarak kullanılabilme potansiyellerinin belirlenmesi

    Isolation and identification of plant growth promoting bacteria (PGPB) and determination of their potential for use a biofertilizer agent for chickpea

    ALEV SEZEN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2012

    BiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. MERYEM ŞENGÜL KÖSEOĞLU

Geri Dön