A Framework management of multiple views of cellular pathway graphs
Hücresel yolak çizgilerinin yönetimi için çoklu görüntüleme yöntemi
- Tez No: 139270
- Danışmanlar: YRD. DOÇ. DR. UĞUR DOĞRUSÖZ
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Computer Engineering and Computer Science and Control
- Anahtar Kelimeler: Biyo-enformatik, hücresel yolaklar, çizge görüntülemesi, çoklu görüntüleme, görüntü koordinasyonu, yazılım mühendisliği. iv, Bioinformatics, software engineering, cellular pathways, graph visual ization, multiple views, view coordination. m
- Yıl: 2003
- Dil: İngilizce
- Üniversite: İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi
- Enstitü: Mühendislik ve Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
ÖZET HÜCRESEL YOLAK ÇİZGELERİNİN YÖNETİMİ İÇİN ÇOKLU GÖRÜNTÜLEME YÖNTEMİ Gürcan Güleşir Bilgisayar Mühendisliği, Yüksek Lisans Tez Yöneticisi: Yard. Doç. Dr. Uğur Doğrusöz Eylül, 2003 Gen araştırmalarındaki gelişmeler, moleküler seviyedeki hücresel işlemlerin in celenmesi sonucu elde edilen verinin saklanması, birleştirilmesi ve analiz edilmesi için ileri tekniklerin ihtiyacını doğurmuştur. Sözkonusu veri büyük ve karmaşık olduğundan dolayı, anlaşılabilirliğini arttırmak için ileri görselleme ve karmaşıklık yönetimi tekniklerinin geliştirilmesine ihtiyaç vardır. Bu tezde, yönlü çizge halinde bulunan karmaşık yolak verisini değiştirmek için bir tek özne - çoklu görüntü yöntemi sunuyoruz. Sunulan yöntem değişen şekillerde ve ebatlardaki potansiyel olarak büyük olan yolak verisinin görsellenmesini sağlar. Bir taraftan özne ve görüntüleri korurken, diğer yandan da izleyen yazılım desenini kullanarak bütün görüntüleri düzenleme yetisine de sahiptir. Sunulan yöntem özne verisinin üzerindeki görüntülerin doğruluğunu ve tutarlılığını da garanti altına almaktadır. Karmaşıklığın (yüksek dereceli yolak nesneleri) azaltılması için ihtiyaç duyulan biyolojik verinin yinelen mesi de yöntemimizin başka bir faydasıdır. Çalışan bir yolak değiştiricisinin düzgünce modüllenmiş bir parçası olarak bu iskelet, yolak biyo-enformatiğinin alana has ihtiyaçlarına karşılık vermesi ile her hangi bir tek özne - çoklu görüntü yöntemine sahip çizge değiştirme ortamından ayrılmaktadır.
Özet (Çeviri)
ABSTRACT A FRAMEWORK FOR MANAGEMENT OF MULTIPLE VIEWS OF CELLULAR PATHWAY GRAPHS Gürcan Güleşir M.S. in Computer Engineering Supervisor: Assist. Prof. Dr. Uğur Doğrusöz September, 2003 The enhancements in genomic studies have given birth to the necessity of advanced techniques for storing, integrating and analyzing the accumulated data regarding molecular level cellular processes. Since this data is huge and complex, advanced visualization and complexity management techniques need to be devel oped to improve its understandability. In this thesis, we present a single subject - multiple view framework for manipulating complex pathway data, which is in the form of a directed graph. The framework facilitates visualization of potentially huge pathway data in possibly varying forms and sizes. While maintaining the subject data (i.e., path way graph) and its views, the presented framework coordinates all the views using an observer software pattern. It ensures the validity and consistency of subject data across all views. Support for replication of biological data, which is desired to reduce complexity (i.e., high degree ubique pathway objects), is another benefit of our framework. Being a neatly modularized, isolated component of a functional pathway edi tor, this framework is distinguished from any other single subject - multiple view graph editing environment by addressing the domain specific needs of pathway informatics.
Benzer Tezler
- A software defined network framework in 5G wireless systems
5G kablosuz sistemlerde yazılım temelli ağ iskeleti
GÖKHAN SEÇİNTİ
Doktora
İngilizce
2017
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrolİstanbul Teknik ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BERK CANBERK
- İnsan kaynakları yönetim süreçleri çerçevesinde öğretmen değerlendirilmesinde performans değerlendirme: Özel bir ilköğretim okulundaki sınıf öğretmenlerinin görüşleri
Within the framework of human resource management process performance evaluation in teacher evaluation: Perceptions of primary school teachers in a private primary school
AYKUT ZUHAT SÜZEN
Yüksek Lisans
Türkçe
2007
Eğitim ve ÖğretimAnadolu ÜniversitesiEğitim Yönetimi, Teftişi, Planlaması ve Ekonomisi Ana Bilim Dalı
PROF.DR. COŞKUN BAYRAK
- Uydu bazlı jeodezik ve jeodinamik veri analiz ve yönetim sistemi tasarımı ve uygulaması
Design and implementation of a satellite-based geodetic and geodynamic data analysis and management system
DENİZ BAŞAR
Doktora
Türkçe
2026
Jeodezi ve Fotogrametriİstanbul Teknik ÜniversitesiGeomatik Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. RAHMİ NURHAN ÇELİK
- Örgüt topluluklarında yeni örgüt formlarının oluşumu: Türkiye ve Avrupa bağlamında bir araştırma
Formation of new organizational forms in organizational populations: A study in the context of Türkiye and Europe
SENCER ÖZEL
Doktora
Türkçe
2024
İşletmeGalatasaray Üniversitesiİşletme Ana Bilim Dalı
PROF. DR. NACİYE AYLİN ATAAY SAYBAŞILI
- Kamu kurumlarında elektronik belge yönetim sisteminin kullanım durumu: TRT örneği
Usage status of electronic document management system in public institutions: TRT example
HALİL TÜFEKÇİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
Eğitim ve ÖğretimHatay Mustafa Kemal ÜniversitesiEnformatik Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ HAMİDE ŞAHİNKAYASI
DOÇ. DR. GÖKHAN DAĞHAN