Geri Dön

İnsan x kromozomu (Xq21) polimorfizminin bazı kanser tipleriyle ilişkisinin belirlenmesi

Determination of the correlation between human x chromosome (Xq21) and some cancer types

PDF İndir

  1. Tez No: 177867
  2. Yazar: NURTEN ÇANAKÇI
  3. Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. EKREM DÜNDAR
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyoloji, Biology
  6. Anahtar Kelimeler: Kanser, TUSC2, TUSC4, Xq21, Cancer, TUSC2, TUSC4, Xq21
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Balıkesir Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 69

Özet

İnsan genomunun DNA dizisinin tamamlanmasıyla bir çok aday genle birlikte kanserojen aday genler de tahmin edilmis ancak tahminlerin teyidi için gereken deneysel çalısmalar henüz tamamlanmamıstır. Bu tez kapsamında, Balıkesir ve Bursa hastanelerinden farklı kanser tiplerine sahip 12 birey, ve 9 saglıklı bireyden, TUSC2'ye oldukça yüksek benzerlik ihtiva eden X kromozomu bölgesi (TXq21 olarak kısaltılmıstır) PCR ile elde edilerek DNA dizisi seviyesinde karsılastırılmıstır. Saglıklı ve çesitli kanser hastası bireylerden elde edilen TXq21 DNA dizileri, BioEdit programının Sequence Alignment, Contig Assembly Program (CAP, dogru dizi tespiti için), DNADist, DNAPars (benzerlik derecesi ve yakınlık uzaklık agacının tespiti için), ve ClustalW (nükletotit polimorfizmini tespit ve görüntülemek için) alt programları kullanılarak analiz edilmistir. BioEdit programının, DNADist ve DNAPars (benzerlik derecesi ve yakınlık uzaklık agacının tespiti) alt programlarının analizi sonucunda ortaya çıkan genetik agaçta kanserli bireylerin tek dalda toplandıgı bariz sekilde ortaya çıkmıstır ve TXq21 bölgesinin hemen hemen bütün kanserli bireylerde bir takım farklılıklar gösterdigi tespit edilmistir. BioEdit programının, ClustalW (nükletotit polimorfizmini tespit ve görüntülemek için) alt programıyla yapılan analizde ise kanserli ve saglıklı bireyler arasında bir polimorfik bölge (SNP, single nucleotide polymorphism) saptanmıstır. Bu polimorfik bölge incelenen bütün kanser tipleriyle çesitli düzeylerde, ancak akciger kanseriyle oldukça yüksek korelasyon göstermis olup, erken teshiste kullanılabilecek bir potansiyel göstermektedir.

Özet (Çeviri)

With the completion of human genome sequence, candidate carcionogen genes along with many putative genes, have also been identified. The experimental work needed to confirm the function of these genes, however, have not been completed yet. With this thesis, TXq21 (TUSC2 like Xq21 region) DNA sequences from 9 healthy individuals and 12 cancer patients from Balıkesir and Bursa hospitals have been amplified via PCR and compared using bioinformatics software. TXq21 DNA sequences obtained this way were analyzed through Sequence Aligment, Contig Assembly Program (for contig construction), DNA Dist, DNAPars (for similarity degrees), and ClustalW (for alingnmet to view polymorphism) accessory applications of BioEdit program. Analysis using DNADist and DNAPars of BioEdit (for constructing similarity and distance trees) revealed that most of the cancer patients were grouped together clearly separating out from the healthy individuals. The analysis run with ClustalW (to align the sequences and to determine the polymorphic regions) of BioEdit revealed an SNP (single nucleotide polymorphism) between healthy individuals (non cancer patients) and cancer patients. This SNP has a correlation to various extends for all cancer types studied, but a very high correlation for lung cancer. With this respect, this SNP has a good potential to be a quick test for early diagnosis of various cancer types, prime of that being the lung cancer.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    200406

    Molecular karyotyping of human hepatocellular carcinoma cell lines using single-nucleotide polymorphism arrays

    İnsan hepatoselüler karsinom hücre hatlarının tek nükleotid polimorfizm yongaları kullanılarak karyotiplendirilmesi

    KUBİLAY DEMİR

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2007

    Biyolojiİhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi

    Moleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. M. CENGİZ YAKICIER

  2. Tez No

    245517

    İnsan Xq21-Yp11.2 lokusunun akciğer kanseri ile ilgisi ve moleküler analizi

    Molecular analysis of human Xq21-Yp11.2 locus with regard to polymorphism and lung cancer correlation

    SEVİLAY BARAK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2009

    BiyolojiBalıkesir Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. EKREM DÜNDAR

  3. Tez No

    611538

    X kromozomu ındel lokuslarının Türkiye'deki gen sıklığı

    Gene frequency of X chromosome indel loci in Turkey

    SELEN ÖZYER

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi

    Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ GÖNÜL FİLOĞLU TÜFEK

  4. Tez No

    611666

    X kromozomu üzerinde bulunan ındel lokuslarına ait multipleks panel geliştirilmesi

    Development of an x-chromosome indel multiplex panel

    ZÜLAL SEVAL USLU

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    Adli Tıpİstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa

    Fen Bilimleri Ana Bilim Dalı

    DR. ÖĞR. ÜYESİ GÖNÜL FİLOĞLU TÜFEK

  5. Tez No

    561684

    N. benthamiana'da üretilmiş insan fix'nın hafif ve ağır zincirlerinin tasarlanması, üretimi ve karakterizasyonu

    Design, production and characterization of light and heavy chain of human fix produced in N. benthamiana

    RABİA AKÇORA

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2019

    BiyoteknolojiAkdeniz Üniversitesi

    Tarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. TARLAN MAMMEDOV

Geri Dön