Hıyar mozaik virüsü (CMV)'nün kavun (CMV-K), domates (CMV-D), biber (CMV-B) izolatlarının biyolojik, serolojik, moleküler yöntemlerle karakterizasyonu ve satellit-RNA'lerin virüs üzerindeki etkisi
Characterization of melon (CMV-K), tomato (CMV-D), pepper (CMV-B) isolates of cucumber mosaic virus (CMV) by biological, serological, molecular methods and effect of satellite-RNAs on virus
- Tez No: 183546
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET ASİL YILMAZ
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Ziraat, Agriculture
- Anahtar Kelimeler: CMV, RT-PCR, RFLP, Alt grup, Satellit-RNAI, CMV, RT-PCR, RFLP, Subgroup, Satellite-RNA.II
- Yıl: 2006
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Çukurova Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bitki Koruma Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 103
Özet
Hıyar Mozaik Virüsü (CMV) Bromoviridae familyası içerisinde Cucumoviruscinsinin en önemli üyelerinden birisidir ve IA, IB ve II olarak üç alt grup içerisindeçok çeşitli ırklara sahiptir. CMV konukçu dizisi geniş bir virüs olup 85 familyaiçerisinde 1000'den fazla bitkiyi enfekte edebilmektedir. Ayrıca CMV satellit-RNA'ler için yardımcı virüs olarak rol almaktadır.Araştırma Adana, Mersin, Hatay ve Şanlıurfa illerinde üretimi yapılan kavun,domates ve biberlerde zararlı CMV izolatlarının tanımlanmaları, sınıflandırılmaları,çoğalttıkları satellit-RNA'lerin büyüklerini ve satellit-RNA'ların virüs üzerindekietkisini araştırmak amacıyla yapılmıştır.Yapılan surveylerle toplanan örnekler ELISA ile testlenmiş ve CMV ileenfekteli oldukları belirlenen kavun, domates ve biber bitkilerinden alınan örneklermekanik inokulasyon yöntemi ile test bitkileri dahil olmak üzere kavun, domates,biber bitkilerine de aşılanmıştır. CMV izolatları enfekteli bitkilerden arılaştırılarakvirionların elektrik ortamındaki hareket hızları kontrol edilmiştir. İzolatların RNA-1,RNA-2, kılıf proteini ve 2a proteinini kodlayan genleri üzerinde bazı bölgeler RT-PCR ile çoğaltılmıştır. PCR ürünleri RFLP çalışmasında MluI, Eco RI, Hind III, BamHI ve Msp I endonükleaz restriksiyon enzimleri ile kesilmiş ve agaroz jeldegörüntülenmiştir. Sonuçlar CMV-K, CMV-D ve CMV-B izolatlarının alt grup IA' yaait olduğunu, üç izolatında 700 bp satellit-RNA'ni çoğalttıkları, CMV-K' nın zayıfırk olduğunu ve bu ırkta simptomun satellit-RNA'den kaynaklanabileceğini, CMV-K' nın çapraz koruma (cross-protection)'da kontrol ajanı olarak kullanılabileceğiniortaya koymuştur.
Özet (Çeviri)
Cucumber Mosaic Virus (CMV) is a member of the genus Cucumovirus inBromoviridae family and has many different strains in the subgroup IA, IB and II.CMV may infect over 1000 plant species in 85 plant families and has a role as helpervirus for satellite-RNA.The research was undertaken to identify and classify CMV isolates in threesubgroups and determine molecular weight, and effects of satellit-RNA on virusinfectivity on melon, tomato and pepper in Adana, Mersin, Hatay and Şanlıurfacities.The collected melon, tomato and pepper samples during the survey of 2003-2006 were tested by ELISA separately and found to be infected with CMV. Laterthese samples were inoculated to indicator plants as well as melon, tomato, pepper.The virions of different CMV isolates were purified from the infected plants andspeed of virions was detected by electrophoresis. Some regions on RNA-1, RNA-2,coat protein and 2a protein genes of different isolates were amplified by RT-PCR.The PCR product fragments were digested by restriction enzymes MluI, Eco RI,Hind III, Bam HI and MspI in RFLP researches and bands observed on agarose gel.The results of research indicated that CMV-K, CMV-D and CMV-B isolatesare belong to subgroup IA. Three of them support satellite-RNA 700bp molecularweight, CMV-K is a mild strain, the reason of symptom expression is the satellite-RNA on CMV-K and this isolates can be used as control agent of cross-protection.
Benzer Tezler
- Hakkari ilinde kabakgillerde hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus; CMV)'nün taqman real tıme RT-PCR yöntemi ile araştırılması
Investigation of Cucumber mosaic virus (CMV) by taqman real-time RT-PCR method in cucurbits in Hakkari province
AYŞENUR BİLTEKİN
Yüksek Lisans
Türkçe
2023
BiyolojiHakkari ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DR. ÖĞR. ÜYESİ NEVİN AKDURA
DOÇ. DR. MURAT ŞEVİK
- Kırgızistan'ın Chui bölgesindeki Cucumber mosaic virüs'ün serolojik ve moleküler teşhisi ile karakterizasyonu
Characterization of Cucumber mosaic virus in the Chui region of Kyrgyzstan by serological and molecular diagnosis
ATAIAR MAZENOV
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
ZiraatNiğde Ömer Halisdemir ÜniversitesiTarım Bilimleri ve Teknolojileri Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ÇİĞDEM ULUBAŞ SERÇE
- Bitki yaprak aktivatörü olarak mikronize CaCO3'ün hıyar mozayik virüsü (Cucumber mosaic virus, Cucumovirus) ile enfekteli biber (Capsicum annum) bitkisine etkileri
Effect of micronize CaCO3 on cucumber Mosaic virus, Cucumovirus; as a plant activator
AHMET ÖZKILIÇ
Yüksek Lisans
Türkçe
2015
ZiraatHarran ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MEHMET ERTUĞRUL GÜLDÜR
- Bandırma yöresinde salçalık domates yetiştirilen alanlarda hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus, CMV)' nün saptanması ve karakterizasyonu
Detection and characterization of Cucumber mosaic virus (CMV) in industrial tomato fields grown in Bandırma region
ASUDE NUR PAPAN
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
ZiraatÇukurova ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUHARREM ARAP KAMBEROĞLU
- Adana ve Mersin illeri domates alanlarında hıyar mozaik virüsü (Cucumber mosaic virus, cmv)'nün karakterizasyonu
Characterization of cucumber mosaic virus (CMV) in tomato areas of Adana and Mersin provinces
FATİME DAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2020
ZiraatÇukurova ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
PROF. DR. MUHARREM ARAP KAMBEROĞLU