Phylogenetic supertree construction using constraint programming
Kısıt programlama kullanarak süperağaç oluşturulması
- Tez No: 183702
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET REŞİT TOLUN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Biyoloji, Computer Engineering and Computer Science and Control, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2006
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankaya Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
KISIT PROGRAMLAMA KULLANARAKSÜPERAĞAÇ OLUŞTURULMASIAlkım ÖzaygenBiyolojide filogenetik ağaç, canlılar arası bağlantıları göstermek için kullanılır. Evrimtarihi hakkında veri kodlamasıdır. Hayat Ağacı günümüzdeki çeşitliliğe ulaşmadaki evriminizlediği süreci gösterir ve birbirinden tamamen farklı yaşayan organizma soylarınınaraştırılmasında yardımcı olur.Bu tezde amaç Hayat Ağacının oluşturulmasında farklı bir yaklaşım sunmak. Kararverme problemleri ve optimizasyon problemlerine kısıt koşul programlama çözümüöneriyoruz, ki bunu da kısıt koşul sağlama problemleri şeklinde kodlayacağız.
Özet (Çeviri)
PHYLOGENETIC SUPERTREE CONSTRUCTIONUSING CONSTRAINT PROGRAMMINGAlkım ÖzaygenIn biology, a phylogenetic tree, or phylogeny, is used to show the genealogicrelationships of living things. It is a codification of data about evolutionary history. The treeof life shows the path evolution took to get to the current diversity of life and can help usalso to search for the genealogy of disparate living organisms.In this thesis our aim is to provide a different approach for the construction of TheTree of Life. That is, we will propose a constraint programming solution to the decisionproblem of constructing a supertree that is compatible with a collection of givenphylogenetic trees that share some species, which we will encode as constraint satisfactionproblems.
Benzer Tezler
- Türkiye'de yayılış gösteren Tricholoma (Fr) staude cinsine ait bazı türlerin filogenetik karakterizasyonları
Phylogenetic characterizations of some species of Tricholoma (Fr) staude genus found in Turkey
ŞUHEDA SÜMEYYE ALDEMİR
Yüksek Lisans
Türkçe
2018
BiyolojiVan Yüzüncü Yıl ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. AYTEN TEKPINAR
DR. ÖĞR. ÜYESİ İSMAİL ACAR
- Tuz Gölü'nden izole edilen arkelerin (halobacteriales: halobacteriaceae) filogenetik tür tanımlaması, karotenoidlerinin antioksidan aktivitelerinin belirlenmesi
Phylogenetic identification of archaea (halobacteriales: halobacteriaceae) isolated from salt lake and antioxidant activity of their carotenoids
FEVZİYE IŞIL KESBİÇ
Doktora
Türkçe
2020
BiyolojiKastamonu ÜniversitesiGenetik ve Biyomühendislik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. NEJDET GÜLTEPE
- Tavuklarda dermanyssus gallınae'nin moleküler karakterizasyonu ve salmonella SPP. yönünden vektörlük potansiyellerinin moleküler olarak araştırılması
Molecular characterization of dermanyssus gallinae in chickens and molecular investigation of their potential as vectors of salmonella SPP
ZEKİYE KOÇER
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
ParazitolojiErciyes ÜniversitesiParazitoloji (Veterinerlik) Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ALPARSLAN YILDIRIM
- Fırat nehri'nde yaşayan Barbus ve Luciobarbus cinsine ait türlerinin mtDNA markörler ile filogenetik analizi
Phylogenetic analysis of species belonging to the genus Barbus and Luciobarbus living in the Euphrates river with mtDNA markers
ELİF KORKMAZ
- Türkiye'de yayılış gösteren Carum L. (Apiaceae) cinsine ait türlerin ıts, trnL-F, trnL intron ve rbcL sekans dizilerine dayalı filogenetik analizi
Phylogenetic analysis of the species belonging to the genus Carum L. (Apiaceae) growing in Turkey based on its, trnL-F, trnL intron and rbcL sequences
FEYZANUR TOPSEÇER
Yüksek Lisans
Türkçe
2021
ZiraatAydın Adnan Menderes ÜniversitesiTarımsal Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMRE SEVİNDİK