Phylogenetic supertree construction using constraint programming
Kısıt programlama kullanarak süperağaç oluşturulması
- Tez No: 183702
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET REŞİT TOLUN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Biyoloji, Computer Engineering and Computer Science and Control, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2006
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankaya Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 62
Özet
KISIT PROGRAMLAMA KULLANARAKSÜPERAĞAÇ OLUŞTURULMASIAlkım ÖzaygenBiyolojide filogenetik ağaç, canlılar arası bağlantıları göstermek için kullanılır. Evrimtarihi hakkında veri kodlamasıdır. Hayat Ağacı günümüzdeki çeşitliliğe ulaşmadaki evriminizlediği süreci gösterir ve birbirinden tamamen farklı yaşayan organizma soylarınınaraştırılmasında yardımcı olur.Bu tezde amaç Hayat Ağacının oluşturulmasında farklı bir yaklaşım sunmak. Kararverme problemleri ve optimizasyon problemlerine kısıt koşul programlama çözümüöneriyoruz, ki bunu da kısıt koşul sağlama problemleri şeklinde kodlayacağız.
Özet (Çeviri)
PHYLOGENETIC SUPERTREE CONSTRUCTIONUSING CONSTRAINT PROGRAMMINGAlkım ÖzaygenIn biology, a phylogenetic tree, or phylogeny, is used to show the genealogicrelationships of living things. It is a codification of data about evolutionary history. The treeof life shows the path evolution took to get to the current diversity of life and can help usalso to search for the genealogy of disparate living organisms.In this thesis our aim is to provide a different approach for the construction of TheTree of Life. That is, we will propose a constraint programming solution to the decisionproblem of constructing a supertree that is compatible with a collection of givenphylogenetic trees that share some species, which we will encode as constraint satisfactionproblems.
Benzer Tezler
- Türkiye'de yayılış gösteren Bolboschoenus palla cinsine ait türlerin filogenetik analizi ve DNA barkodlaması
Phylogenetic analysis and DNA barcoding of species of the genus Bolboschoenus palla distributing in Turkey
HİLAL NUR VURAL
Yüksek Lisans
Türkçe
2022
GenetikErciyes ÜniversitesiMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. CEM VURAL
DR. ÖĞR. ÜYESİ HANDAN ŞAPCI SELAMOĞLU
- Ham derilerden izole edilen arke izolatlarının filogenetik olarak tanımlanması ve ekstraselüler proteaz aktivitelerinin incelenmesi
Phylogenetic identification of halophilic archaea isolated from raw hide and investigation of their proteolitic activities
FEVZİYE IŞIL MEYDANİ
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyolojiÇanakkale Onsekiz Mart ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. BİNNUR MERİÇLİ YAPICI
- Nonomuraea cinsine ait izolatların multi gen dizi analizine dayalı filogenetik sistematiği
Phylogenetic systematics of members of the genus Nonomuraea based on multilocus sequence analysis
FATMA ŞEYMA GÖKDEMİR
- Kanatlı kökenli salmonella infantis suşlarının MLST ile filogenetik analizi
Phylogenetic analysis of salmonella infantis strains from poultry by MLST
SEYYİDE SARIÇAM
Yüksek Lisans
Türkçe
2017
MikrobiyolojiAnkara ÜniversitesiMikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. H.KAAN MÜŞTAK
- Streptomyces cinsi üyesi izolatların multi gen dizi analizlerine dayalı filogenetik sistematiği
Phylogenetic systematics of members of the genus streptomyces based on multilocus sequence analysis
HAYRETTİN SAYGIN