Phylogenetic supertree construction using constraint programming
Kısıt programlama kullanarak süperağaç oluşturulması
- Tez No: 183702
- Danışmanlar: PROF. DR. MEHMET REŞİT TOLUN
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve Kontrol, Biyoloji, Computer Engineering and Computer Science and Control, Biology
- Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
- Yıl: 2006
- Dil: İngilizce
- Üniversite: Çankaya Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Bilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
KISIT PROGRAMLAMA KULLANARAKSÜPERAĞAÇ OLUŞTURULMASIAlkım ÖzaygenBiyolojide filogenetik ağaç, canlılar arası bağlantıları göstermek için kullanılır. Evrimtarihi hakkında veri kodlamasıdır. Hayat Ağacı günümüzdeki çeşitliliğe ulaşmadaki evriminizlediği süreci gösterir ve birbirinden tamamen farklı yaşayan organizma soylarınınaraştırılmasında yardımcı olur.Bu tezde amaç Hayat Ağacının oluşturulmasında farklı bir yaklaşım sunmak. Kararverme problemleri ve optimizasyon problemlerine kısıt koşul programlama çözümüöneriyoruz, ki bunu da kısıt koşul sağlama problemleri şeklinde kodlayacağız.
Özet (Çeviri)
PHYLOGENETIC SUPERTREE CONSTRUCTIONUSING CONSTRAINT PROGRAMMINGAlkım ÖzaygenIn biology, a phylogenetic tree, or phylogeny, is used to show the genealogicrelationships of living things. It is a codification of data about evolutionary history. The treeof life shows the path evolution took to get to the current diversity of life and can help usalso to search for the genealogy of disparate living organisms.In this thesis our aim is to provide a different approach for the construction of TheTree of Life. That is, we will propose a constraint programming solution to the decisionproblem of constructing a supertree that is compatible with a collection of givenphylogenetic trees that share some species, which we will encode as constraint satisfactionproblems.
Benzer Tezler
- Tomato chlorosis virus (ToCV) izolatlarının örtü protein gen bölgesinin moleküler olarak belirlenmesi
Molecular analysis of coat protein region of Tomato chlorosis virus isolates
SALİSU SULLEY
Yüksek Lisans
Türkçe
2016
ZiraatAnkara ÜniversitesiBitki Koruma Ana Bilim Dalı
Prof. Dr. İBRAHİM ÖZER ELİBÜYÜK
- Phylogenetic analysis of 16S rRNA for determination of microbial community in anoxic marin sediments of Haliç
Mikrobiyal komünitenin belirlenmesi ile Haliç anoksik deniz sedimentlerinde 16S rRNA'nın filogenetik analizi
SEHER BAHAR AÇIKSÖZ
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
Çevre Mühendisliğiİstanbul Teknik ÜniversitesiBiyoteknoloji Bölümü
DOÇ. DR. HAKAN BERMEK
PROF. DR. ORHAN İNCE
- Phylogenetic analysis of bacterial communities in kefir by metagenomics
Kefir bakteri komünitelerinin metagenomik yöntemlerle filogenetik analizi
BURCU ÜNSAL
Yüksek Lisans
İngilizce
2008
Biyolojiİzmir Yüksek Teknoloji EnstitüsüMoleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ALPER ARSLANOGLU
- Phylogenetic analysis of Colchicum L. species with chloroplast genome-specific markers
Colchicum L. türlerinin kloroplast genomuna özgü markörler ile filogenetik analizi
MEHMET AYDEMİR
Yüksek Lisans
İngilizce
2015
BiyomühendislikMarmara ÜniversitesiBiyomühendislik Ana Bilim Dalı
PROF. DR. AHU ALTINKUT UNCUOĞLU
- Phylogenetic relationships, molecular dating and DNA barcoding of spiranthes (Orchidaceae)
Başlık çevirisi yok
DENİZ AYGÖREN