Hacettepe Üniversitesi Hastanelerinde ayrıstırılan Pseudomonas aeruginosa izolatlarında metallo-beta-laktamaz enziminin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması
Identification of metallo-beta-lactamases in Pseudomonas aeruginosa strains isolated in Hacettepe University Hospitals by phenotypic and genotypic methods
- Tez No: 194437
- Danışmanlar: PROF. DR. BURÇİN ŞENER
- Tez Türü: Doktora
- Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: P.aeruginosa, metallo-beta-laktamaz, integron, genkaset
- Yıl: 2005
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Hacettepe Üniversitesi
- Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 126
Özet
iiiÖZETÇAKAR, A., Hacettepe Üniversitesi Hastaneleri'nde ayrıştırılanizolatlarında metallo-beta-laktamazPseudomonas aeruginosaenziminin fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırılması, HacettepeÜniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü Mikrobiyoloji ProgramıDoktora Tezi, Ankara, 2005. Pseudomonas aeruginosa hastaneenfeksiyonlarının en başta gelen nedenlerinden biridir. P.aeruginosa'nınpek çok antibiyotiğe dirençli olması tedavide ciddi bir sorunyaratmaktadır. Metallo-beta-laktamaz enzimleri karbapenemlerin deiçinde bulunduğu monobaktamlar hariç tüm beta-laktam antibiyotikleredirenç gelişiminden sorumlu enzimlerdir. Metallo-beta-laktamaz enziminikodlayan genler sınıf 1 integronlar içindeki gen kasetlerindebulunmaktadır. Gen kasetleri bölgeye özgü rekombinasyon sistemiylefarklı integronlara taşınabilmekte, böylece direnç genlerinin bakterilerarası yayılımına neden olmaktadır. Bu çalışmanın amacı, çeşitli klinikörneklerden ayrıştırılan P.aeruginosa izolatlarında metallo-beta-laktamazenzimini fenotipik ve genotipik yöntemlerle araştırmaktır. Bu amaçla,seftazidim ve/veya imipenem dirençli 110 P.aeruginosa izolatı çalışmayaalınmıştır. Çalışmaya alınan izolatların 66'sında (%60) çoklu ilaç direncigözlenmiştir. Metallo-beta-laktamazın fenotipik tayininde beş fenotipiktest uygulanmış, ayrıca imipenem hidrolizi deneyi gerçekleştirilmiştir.Fenotipik test sonuçlarını doğrulamak amacıyla iki primer setikullanılarak PCR analizi yapılmıştır. PCR analiz sonuçlarına göre,çalışmaya alınan 110 izolatın 11'inde metallo-beta-laktamaz genisaptanmış, metallo-beta-laktamaz sıklığı %1.5 olarak belirlenmiştir.Fenotipik testlerin metallo-beta-laktamaz tayininde yeterli olmadığıgörülmekle birlikte, PCR sonucu ile en uyumlu testin kombine disk sinerjitesti olduğu gözlenmiştir.
Özet (Çeviri)
iiiABSTRACTÇAKAR, A., Identification of metallo-beta-lactamases inPseudomonas aeruginosa strains isolated in Hacettepe UniversityHospitals by phenotypic and genotypic methods, HacettepeUniversity Health Sciences Institute PhD Thesis in Microbiology,Ankara, 2005. Pseudomonas aeruginosa is a leading cause ofnosocomial infections and is resistant to many antibiotics posing seriousproblems for therapeutic regimens. Metallo-beta-lactamases are theenzymes which cause resistance to all beta-lactam agents exceptmonobactams. Metallo-beta-lactamase genes are carried in gene casetteslocated in class1 integrons.Identification of metallo-beta-lactamase inclinical microbiology laboratories is very important. The aim of this studyis to identify metallo-beta-lactamase enzyme in clinical P.aeruginosaisolates by phenotypic and genotypic methods. For this purpose, 110P.aeruginosa isolates resistant to ceftazidime and/or imipenem wereincluded in this study. Antibiotic susceptibility of the isolates andpresence of metallo-beta-lactamase production were investigated byphenotypic and genotypic tests. From a total of 110 P.aeruginosa isolates,66 (60%) were found multiple drug resistant. For identification ofmetallo-beta-lactamase, five phenotypic tests were performed. Also crudeextract of isolates were tested for the presence of EDTA-inhibitablecarbapenemase activity revealed the presence of imipenemase activity. Inorder to confirm the results of phenotypic tests, PCR analysis wereperformed. According to the PCR analysis 11 isolates were foundmetallo-beta-lactamase positive, and the prevelence of metallo-beta-lactamase was determined as 1.5%. Although phenotypic tests are notsufficient to detect metallo-beta-lactamase phenotypically, according tothe PCR analysis, the most suitable test which can be used is combineddisk diffusion test. The results of this study reveal that metallo-beta-lactamase are prevalent among P.aeruginosa isolates.Keywords : P.aeruginosa, metallo-beta-lactamase, integron, gene cassetteSupported by : H.Ü.B.A.B. 03.D02.101.012
Benzer Tezler
- Hacettepe Üniversitesi Erişkin ve Onkoloji Hastaneleri'nde yatan hastalarda saptanan metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA) bakteremisi risk faktörleri (2004-2011): Yuvalandırılmış vaka kontrol araştırması
Risk factors of Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) bacteraemia at Hacettepe University Adult and Oncology Hospitals in hospitalized patients (2004-2011): A nested case-control cohort study
ÖZGÜR ATMACA
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
MikrobiyolojiHacettepe Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. PINAR ZARAKOLU KÖŞKER
PROF. DR. SERHAT ÜNAL
- Hacettepe Üniversitesi Hastanelerinde takip edilen metastatik renal hücreli kanser hastalarının sağkalımlarının zaman içinde değişiminin incelenmesi
The analysis of metastatic renal cell cancer patients' survival changes over time at Hospitals of Hacettepe University
ZAFER ARIK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
OnkolojiHacettepe Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. MUSTAFA ERMAN
- Hacettepe Üniversitesi hastanelerinde mevcut bilgi sisteminin değerlendirilmesi, geçilmesi düşünülen elektronik hastane bilgi sisteminde mevcut ve oluşabilecek sorunların tespiti ve çözüm önerileri
The Evaluation of the existing information system in the hospitals of the Hacettepe University the determination of the problems and solution proposals in connection with the electronic hospital information system that is proposed and planned ...
ELİF DİKMETAŞ
Yüksek Lisans
Türkçe
2000
Sağlık Kurumları YönetimiHacettepe ÜniversitesiSağlık Kurumları Yönetimi Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. ERSEN ALOĞLU
- Hacettepe Üiversitesi hastanelerinde granülomatöz mastit tanısı ile tedavi edilen hastaların retrospektif değerlendirilmesi ve skorlama modeli oluşturulması
Retrospective evaluation of patients treated at Hacettepe University hospital with the diagnosis of granulomatous mastitis and establishment of a scoring model
HÜSEYİN ONUR AYDIN
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2013
Genel CerrahiHacettepe ÜniversitesiCerrahi Tıp Bilimleri Bölümü
PROF. DR. ATAÇ BAYKAL
- Hacettepe Üniversitesi Hastanelerinde yatan Karbapenem dirençli Escherichia coli veya Klebsiella pneumoniae ile infekte veya kolonize olan hastaların tanımlayıcı özellikleri
Epidemiologic charecteristics of carbapenem resistant E. coli / K. pneumoniae detected from Hacettepe University adult hospital and oncology hospital from june 2009 to december 2011
MURAT CİNEL
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2011
Klinik Bakteriyoloji ve Enfeksiyon HastalıklarıHacettepe Üniversitesiİç Hastalıkları Ana Bilim Dalı
PROF. DR. N. YEŞİM ÇETİNKAYA ŞARDAN