Geri Dön

Trichophyton rubrum'un trichophyton mentagrophytes'ten ayırt edilmesinde kullanılan tanı testlerinin karşılaştırılması

Comparision of identification methods for the differentiation of trichophyton rubrum from trichophyton mentagrophytes

PDF İndir

  1. Tez No: 195430
  2. Yazar: AYLİN ATEŞ
  3. Danışmanlar: PROF.DR. KADRİ ÖZCAN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Mikrobiyoloji, Microbiology
  6. Anahtar Kelimeler: Belirtilmemiş.
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Çukurova Üniversitesi
  10. Enstitü: Sağlık Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 96

Özet

Günümüzde, dermatofitlerin taksonomisinde hızlı ve çarpıcı bir değişim yaşanmaktadır. Dermatofitler ya yeniden gruplandırılmakta ya da yeniden isimlendirilmekte, ayrıca çeşitli türlere ilişkin varyete isimleri terk edilip yeni bir tür şeklinde sınıflandırılmaktadır. Laboratuvar tanıda altın standart yöntem dizi analizidir. Ancak, moleküler temelli araştırmaların gerek alt yapı gereksinimi ve gerekse yüksek maliyeti nedeni ile dermatofit türleri; koloni özellikleri, mikroskop morfolojileri, büyüme gereksinimleri, fizyolojik ve biyokimyasal özelliklerine göre tür düzeyinde tanılanmaktadır. Aynı dermatofit türünün gerek morfoloji (koloni örgüsü, pigment ve üreme hızı) ve fizyolojisinde (kıl delme) ve gerekse genotiplerinde (rRNA ve mating şekilleri) değişimler görülmekte ve anılan yöntemlerin güvenilirliği sorgulanmaktadır. Trichophyton rubrum kompleks içerisinde yer alan bir çok mikroorganizma da yeniden isimlendirilmiş; T. fischeri, T. kanei, T. raubitschekii ve diğer türler tanınmıştır. Trichophyton mentagrophytes sensu lato içerisinde yer alan T. interdigitale ve diğer mikro-organizmalar da dizi analizi ile yeniden sınıflandırılmıştır. Ancak, mikoloji laboratuvarlarında yaşanan önemli sorunlardan birisi de klasik tanı yöntemleri ile T. rubrum'un T. mentagrophytes'den ayırt edilmesidir. Bu çalışmada, çağdaş sınıflandırmadan önce her iki kompleks içerisinde yer alan mikro-organizmaların laboratuvar tanısında kullanılan morfolojik, fizyolojik ve biyokimyasal tanı testlerinin etkinliğinin tartışılması amaçlanmış, ayrıca rutin laboratuvar uygulamalarındaki güvenilirliği sorgulanmıştır. Çalışmada, Centraalbureau voor Schimmelcultures (CBS), Utrecht, Hollanda'dan sağlanan T. fischeri CBS 100081, T. fluvimunionse CBS 592.68, T. kanei CBS 289.86, T. kuryangei CBS 422.67, T. kuryangei CBS 517.63, T. kuryangei CBS 518.63, T. pervesii CBS 303.38, T. raubitschekii CBS 202.88, T. raubitschekii CBS 287.86, T. raubitschekii CBS 100084, T. raubitschekii CBS 102856, T. rodhainii CBS 376.49, T. rubrum CBS 302.60, T. rubrum CBS 363.53, T. rubrum CBS 363.62, T. rubrum CBS 392.58, T. rubrum var. nigricans CBS 100237, T. megninii CBS 389.58, T. asteroides CBS 424.63, T. langeronii CBS 764.84, T. mentagrophytes CBS 318.56, T. mentagrophytes var. mentagrophytes CBS 110.65, T. mentagrophytes var. mentagrophytes CBS 160.66, T. papillosum CBS 347.55, T. quinckeanum CBS 572.75, Arthroderma benhamiae (MT-) CBS 807.72, A. benhamiae (MT+) CBS xii 808.72, A. simii (MT-) CBS 417.65, A. simii (MT+) CBS 448.65, A. vanbreuseghemii CBS 428.63 ve A. vanbreuseghemii CBS 558.66 kullanıldı. Üreaz tepkimesi (sıvı, tüpte agar ve petride agar), kıl delme deneyi (sarışın çocuk saçı, koyun kılı ve keçi kılı), corn-meal agar, bromkrezol purple milk solid glikoz agar (BCPMSG), Tween opasite deneyi, sorbitol asimilasyonu, tuz toleransı, Trichophyton agar'ın 1-7 setinde üreme özelliği değerlendirildi. Ayrıca, makrokonidiyum/mikrokonidiyum varlığının araştırılmasında; Beyin-kalp infüzyon agar (BKİA), malt extract agar (MEA), Löwenstein-Jensen agar (LJ), patates dekstroz agar (PDA), Oat meal agar (OA), cornmeal agar (CMDA), Oxoid kromojenik Candida agar (OCCA), Christensen üre agar ve Trichophyton agar 1- 7 besiyerlerine ekim yapıldı ve 5, 10 ve 15 gün ara ile incelendi ve performansları karşılaştırıldı. Çalışmada, tür düzeyinde tanıda; üreaz tepkimesinin petride hazırlanmış üre besiyeri ile daha çabuk ve güçlü olduğu, kıl delme deneyinin her iki kompleksin ayırt edilmesinde, ancak ilk 10 günde yararlı olabileceği, makrokonidiyum oluşumunun BKİA ve LJ besiyerinde daha çok olduğu saptandı (P < 0.05). Tween opasite, sorbitol asimilasyonu ve tuz toleransı testinde bir ipucu elde edilemedi. Ayrıca, CMDA ve BCPMSG'de T. rubrum kompleks kırmızı pigment oluşturdu, T. mentagrophytes kompleks ise oluşturmadı. Örneğin; T. raubitschekii üreaz olumlu olması, üçüncü günde BCPMSG'de koloni çevresinde kırmızı pigment yapması ve daha sonra pH'yı alkali yönde değiştirmesi, kıl delme deneyinin olumsuz olması, Tween opasite testinde koloni çevresinde üç günde opak zon oluşturması ve kültürlerinde bol makro- ve mikro-konidiyum bulunması ile T. rubrum kompleksinden, ayrıca CMDA'da kırmızı pigment oluşturması ile de T. mentagrophytes kompleksinden ayırt edildi. Sonuç olarak, yukarıda anılan tanı testlerinin bir algoritma çerçevesinde uygulanması ile hem T. rubrum kompleksin T. mentagrophytes kompleksten ayırt edilebileceği, hem de her iki kompleks içerisinde yer alan mikro-organizmaların tür düzeyinde tanılanabileceği belirlendi.

Özet (Çeviri)

Nowadays a rapid and striking change is observed in the taxonomy of dermatophytes. They are either re-grouped or re-named, in addition some varieties remain out of nomenclature giving origin to new species. The gold standard in laboratory diagnosis is sequencing analysis. But dermatophyte species are identified at the level of species according to colony characteristics, microscopic morphologies, growth requirements, physiological and biochemical characteristics due to infer-structural needs and high cost of molecular based researches. As changes are observed for a single dermatophyte species both for its morphology (colony pattern, pigments and growth rate) or physiology (in vitro hair perforation) and for its genotype (rRNA and mating patterns); the reliability of the method is questioned. Many micro-organisms belonging to Trichophyton rubrum complex are renamed i.e., T. fischeri, T. kanei, T. raubitschekii and similar are identified. Trichophyton interdigitale, and other micro-organisms pertaining to Trichophyton mentagrophytes sensu lato are re-classified by sequencing analysis. But one of the principal problems observed in mycology laboratory is the differentiation of T. rubrum from T. mentagrophytes using classical diagnostic methods. This study aimed to discuss the efficacy of morphological, physiological and biochemical diagnostic tests used in the laboratory identification of micro-organisms pertaining to both complexes before the current classification, in addition to interrogate their reliability in routine laboratory practice. In the study, T. fischeri CBS 100081, T. fluvimunionse CBS 592.68, T. kanei CBS 289.86, T. kuryangei CBS 422.67, T. kuryangei CBS 517.63, T. kuryangei CBS 518.63, T. pervesii CBS 303.38, T. raubitschekii CBS 202.88, T. raubitschekii CBS 287.86, T. raubitschekii CBS 100084, T. raubitschekii CBS 102856, T. rodhainii CBS 376.49, T. rubrum CBS 302.60, T. rubrum CBS 363.53, T. rubrum CBS 363.62, T. rubrum CBS 392.58, T. rubrum var. nigricans CBS 100237, T. megninii CBS 389.58, T. asteroides CBS 424.63, T. langeronii CBS 764.84, T. mentagrophytes CBS 318.56, T. mentagrophytes var. mentagrophytes CBS 110.65, T. mentagrophytes var. mentagrophytes CBS 160.66, T. papillosum CBS 347.55, T. quinckeanum CBS 572.75, Arthroderma benhamiae (MT-) CBS 807.72, A. benhamiae (MT+) CBS 808.72, A. simii (MT-) CBS 417.65, A. simii (MT+) CBS 448.65, A. vanbreuseghemii CBS 428.63 and A. vanbreuseghemii CBS 558.66 obtained from Centraalbureau voor Schimmelcultures (CBS), Utrecht, the Netherlans were used. Urease reaction (in broth, in tube-agar and Petri agar), in vitro hair perforation test (blond child hair, sheep and goat hair), growth in corn-meal agar and bromcresol purple-milk solids-glucose agar (BCPMSG), Tween opacity test, xiv sorbitol assimilation, salt tolerance, growth in 1 to 7 set of Trichophyton agars were evaluated. Additionally, the presence of macro- and micro- conidia were investigated by inoculation into brain-heart infusion agar (BHIA), malt extract agar (MEA), Lowenstein-Jensen agar (LJ), potatoe dextrose agar (PDA), oat-meal agar (OA), cornmeal dextrose agar (CMDA), Oxoid chromogenic Candida agar (OCCA), Christensen urea agar and Trichophyton agars 1 to 7, and by confronting their performance at days 5, 10 and 15. It was found that urease reaction had provided more rapid and more powerful identification at the level of species when urea media prepared in Petri dishes had been used. Hair perfororation test resulted useful in the differentiation of the two complexes only in the first ten days. Macroconidia production was more prevalent in BHIA and LJ media (P < 0.05). Tween opacity, sorbitol assimilation and salt tolerance tests provided no clue. Additionally, T.rubrum complex produced red pigments in CMDA and BCPMSG, while T. mentagrophytes complex produced none. For example, T. raubitschekii was differentiated from T. rubrum complex by being urease positive, producing red pigments around colonies in BCPMSG, later shifting pH towards alcaline, being unable to perforate hair, producing opaque zone around colonies in Tween opacity test in three days, presenting abundant macro- and micro- conidia in culture. It was also differentiated from T. mentagrophytes complex by producing red pigments in CMDA. It can be concluded that by using over-cited tests in the context of an algorithm T. rubrum complex could be differentiated from T. mentagrophytes complex, in addition to the identification of micro-organisms pertaining to both complexes at the level of species.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    409608

    Trichophyton rubrum'un çabuk tanısında ksantomegninin hplc ile saptanması

    Detection of xanthomegnin by high performance liquid chromatography for rapid ıdentification of trichophyton rubrum complex

    AYŞEGÜL HAZAL KANDEMİR

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    MikrobiyolojiÇukurova Üniversitesi

    Tıbbi Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET MACİT İLKİT

  2. Tez No

    841377

    Podoloji ünitesi çalışanlarının mesleki riskleri ve alınabilecek önlemlerin araştırılması

    Investigation of occupational risks of podology unit employees and measures to be taken

    SERAP ARSAL YILDIRIM

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Halk SağlığıMarmara Üniversitesi

    İş Güvenliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. KOZET BAKIRCI

    PROF. DR. BEYHAN PEKEY

  3. Tez No

    91556

    Yeni 3-fenil-5-metil-1H-indol-2-karbohidrazid türevlerinin sentezi ve yapı aydınlatması

    Synthesis and structure elucielation of new 3-phenyl-5-methyl-1H-indole-2-carbohydrazide derivatives

    DEVRİM ÖZTÜRK

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2000

    Eczacılık ve Farmakolojiİstanbul Üniversitesi

    Farmasötik Kimya Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. GÜLTAZE ÇAPAN

  4. Tez No

    138534

    Yöremizde yüzeyel mantar enfeksiyonlu hastalardan izole edilen dermatofitoz etkenleri

    The incidence of causative pathogens responsible from the dermatopyte infections in our region, Erzurum

    HAKAN USLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2002

    MikrobiyolojiAtatürk Üniversitesi

    Mikrobiyoloji ve Klinik Mikrobiyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. AHMET AYYILDIZ

  5. Tez No

    105439

    Malatya'da insan yüzeyinde tespit edilen mantar türleri

    The fungi species determined on body surface of people living in Malatya region

    AYCAN ŞAHİN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2001

    Biyolojiİnönü Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. ELŞAD HÜSEYİNOV

Geri Dön