Doğal ortamlardan izole edilen alkalifilik toprak bakterilerinde plazmid kodlu Na-tellurit dirençliliği ve transformasyon olanaklarının araştırılması
Research of possibility the transformation and resistance Na-tellurite originated plasmide at the soil bacteria isolated from natural environment
- Tez No: 200912
- Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. NURSEL DOSTBİL
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Biyoloji, Biyoteknoloji, Mikrobiyoloji, Biology, Biotechnology, Microbiology
- Anahtar Kelimeler: Na-tellurite, Alkalifilik Bacillus spp. Plasmid, Protoplast Transformasyonu i, Na-tellurite, Alkalophilic Bacillus spp. Plasmide, Protoplast Transformation
- Yıl: 2007
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Yüzüncü Yıl Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Biyoloji Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: 95
Özet
Bu çalısmada Na-tellurit bilesiginin toprak bakterilerinden alkalifilik Bacillus spp. suslarında inhibitör etkisi arastırıldı. Bakteriler Na-tellurit bilesigine 1, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 175, 178 ve 180 ?g/ml artan konsantrasyonlara denendi. zolatların 1, 5, 10, 20, 30, 40, 50 ve 60 ?g/ml konsantrasyonlardaki Na-tellurit denemesinde çogunlukla dirençlilik gösterirken 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 175, 178 ve 180 ?g/ml olarak denenen konsantrasyonlarda ise hassasiyet profili gösterdigi saptandı. Aynı sekilde 60, 70, 80, 90, 100, 120, 130, 150 ve 160 ?g/ml konsantrasyonlarda da plasmid kodlu dirençlilik gözlendi. 80 ?g/ml konsantrasyon denemesinde en fazla plasmid kodlu dirençlilik gösteren 5 ayrı sus belirlendi. zolatlar için MICs degeri ve 0.8 ?g/ml olarak belirlendi. Diger parametrelerde ise plasmid kodlu dirençlilige rastlanmadı. 180 ?g/ml konsantrasyon denemesinde de denenen hiç bir izolatın üremedigi ve %100 hassasiyet gösterdigi bulundu. zolatların Na-tellurit bilesigine ve Chloramphenikol antibiyotigine plasmid kodlu dirençliliginin saptanması için Acridine orange (20 ?g/ml)ve Ethidium Bromid (10-5 M) ile plasmid eliminasyonu yapıldı. zolatlarda Bacillus spp.'ye ait %60.86 Na-tellurit bilesigine hassasiyet, %39.13 dirençlilik fenomeni ve %21.10 oranında plasmid kodlu Na-tellurit dirençliligi bulundu. Na-tellurit bilesigine ve antibiyotige karsı dirençlilik genini tasıyan plasmidler (B. cereus T112-Na-TeR), Na-tellurit bilesigine ve antibiyotige hassasiyet gösteren susa (B. megaterium DSM 32-Na-TeS)transformasyonu yoluyla aktarıldı. zolatları arasında protoplast transformasyon yoluyla 108 transformant elde edildi. Agaroz jel elektroforezde seperasyonu yapıldı. Na-tellurit bilesigine ve antibiyotige dirençli suslardan izole edilen plasmidin 22.514 bp moleküler agırlıga sahip oldugu saptandı.
Özet (Çeviri)
In this study, researched the inhibitor effect at the Bacillus spp.strains from the soil bacteria of Na-tellurit compound. Bacteria treatmented at the remaining concentrations 1, 5, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 175, 178 ve 180 ?g/ml the Na-tellurite compound. Isolates which was at the experiment Na-tellurite in the 1 5, 10, 20, 30, 40, 50 ve 60 ?g/ml concentrations mostly showed resistant but determined the sensitiveness profile at the its experiment concentration as 70, 80, 90, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 175, 178 ve 180 ?g/ml Na-tellurite compound. In the same way we observed resistance originated plasmid at the 60, 70, 80, 90, 100, 120, 130, 150 ve 160 ?g/ml concentrations. At the experiment of 80 ?g/ml concentration determined five different satrains showing most resistance originated plasmid. At the other parameter wasn?t happen at the same and at the experiment of 180 ?g/ml concentration weren?t growth of any izolate too. However they determined to showing %100 sensitiveness. For Bacillus spp. determined MICs of 0.8 ?g Na-tellurit. Of present izolate were maked to plasmid eliminate with for determine of the resistance originated plasmid with acridine orange (20 ?g/ml) and ethidium bromid (10-5 M) with plasmid eliminated Na-tellurite compound and Chloramphenicol antibiotic. At the isolates were determined the Na-tellurite resistance originated plasmid at the %21.10 ratio and the %39.13 resistance phenomenon, sensitive the % 60.86 Na-tellurite compound belong to Bacillus spp.. Plasmids B. cereus T112-Na-TeR carriering the resistance gene against to antibiotic and Na-tellurite compound were transfered by way of protoplast transformation to B. megaterium DSM 32-Na-TeS strain showing sensitiveness to antibiotic and Na-tellurit compound. From the soil izolates, 108 transformants via protoplast transformation were obtained. The seperation of plasmid was made in the agarous gel electrophoresis after the isolation. It was determined that the plasmids isolated from the strains resistant to Na-tellurit and antibiotic had 22.514 bp molecular weight.
Benzer Tezler
- Doğal ortamlardan izole edilen alkalifilik Aeromonas spp. suşlarında plazmid kodlu ağır metal dirençliliği ve akümülasyonu
The accumulation and resistance of heavy metal originated plasmide at the alkalifilic Aeromonas spp. strains isolated from natural environment
SEMA TEMEL
Yüksek Lisans
Türkçe
2014
BiyokimyaYüzüncü Yıl ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
YRD. DOÇ. DR. NURSEL DOSTBİL
- Yöresel peynirlerden laktik asit bakterilerinin izolasyonu, tanısı ve bazı gıda patojenleri üzerindeki antimikrobiyal etkilerinin araştırılması
The isolation and diagnosis of lactic acid bacteria from regional cheese and the investigation of antimicrobial effects on some food pathogens
CENGİZ TABAKOĞLU
- Doğal ortamlardan izole edilen Bacillus thuringiensis'lerin karakterizasyonu ve insektisidal özelliklerinin belirlenmesi
Caharacterization and determination of insecticidal features of Bacillus thuringiensis isolated from natural environment
HATİCE KATI
Doktora
Türkçe
2003
BiyolojiKaradeniz Teknik ÜniversitesiBiyoloji Ana Bilim Dalı
PROF. DR. ZİHNİ DEMİRBAĞ
- Doğal maya suşlarının mevcut fermantasyon yeteneklerinin mutasyonla geliştirilmesi ve bacillus sp. amilaz geninin maya hücrelerine transferi
Improvement of fermantation abilities presents in wild type yeast strains by mutation and transfer of amylase gene from bacillus sp. to yeast cells
MUTLU NİSA ÜNALDI
- Laktobasiller tarafından üretilen bakteriyosinlerin tanımlanması, sınıflandırılması ve bunların bazı gıda kaynaklı patojenler üzerindeki etkilerinin belirlenmesi
The Identification and classification of bacteriocins produced by lactobacilli and determination of their effects on some food-borne pathogens
HAKAN KULEAŞAN
Doktora
Türkçe
2002
Gıda MühendisliğiAnkara ÜniversitesiGıda Mühendisliği Ana Bilim Dalı
PROF. DR. M. LÜTFÜ ÇAKMAKÇI