Adenosin bileşik serisinin anti-tümör aktivitesinin elektron konformasyon-genetik algoritma (EC-GA) yöntemi ile QSAR incelenmesi
QSAR studies with EC-GA method on adenosine compounds as anti-tumor inhibitor
- Tez No: 232200
- Danışmanlar: PROF. DR. EMİN SARIPINAR
- Tez Türü: Yüksek Lisans
- Konular: Kimya, Biyokimya, Chemistry, Biochemistry
- Anahtar Kelimeler: Neoplazmlar, Neoplasms
- Yıl: 2008
- Dil: Türkçe
- Üniversite: Erciyes Üniversitesi
- Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
- Ana Bilim Dalı: Kimya Ana Bilim Dalı
- Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
- Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.
Özet
Adenosin bileşik serilerinin ?Elektron Konformasyonel -EC? metotu ile kantitatif aktivite tahmini yapılmıştır.Bu metot ile Pha, aktiviteyi artıran (AG) ve aktiviteyi azaltan (APS) grupların parametrelerinin bir fonksiyonu olarak kantitatif aktivite hesaplanabilir ve moleküllerin biyolojik maddelerle etkileşim mekanizmasının açıklanmasına yardımcı olur.Bu çalışmada konformasyonel analiz, elektronik yapı hesaplamaları ve matris karşılaştırması 21 bileşik için yapılmıştır. Bileşikler için elektron konformasyonel matrisi (ECMC) ESCP V1.0 programında hazırlandı. Farmakofor grubu belirlemek için elektron-konformasyonel alt matrisi (ECSA). Serisinde farmakofor grup N1, C2, N4, C7 ve C4 atomları olarak bulunmuştur. Bu bileşik serileri için bileşiklerin elektronik, geometrik ve fizikokimyasal özelliklerini gösteren parametreler Delphi dilinde yazılan EMRE V1.2 programında hazırlandı. Hazırlanan değişkenlerden yararlanarak Matlab programında genetik algoritma optimizasyon tekniği kullanılarak aktivite hesaplamaları yapıldı. Teorik olarak çıkan sonuçların deneysel sonuçlarla uyum içinde olduğu görülmüştür. Seride en aktif bileşik referans alınarak bileşiklerin aktivitesini en iyi veren parametreler bulunmuştur.Adenosin serisinde en iyi sonuç 18 parametre (kappa ) değeri ile elde edilmiş ve R2 değeri 1.0000 olarak hesaplanmıştır.
Özet (Çeviri)
Quantitative activity prediction for a series of Adenosine derivatives are revealed by ?Electron Conformational? EC method.Quantitative activite can calculate as a function of Pha, APS groups that decrease the activity and AG groups that increase the activity with this method and this method conduce to explain of the model of biological interaction of the molecule. The main features of this method is that in addition to revealing the activity by Pha groups, explains activity as set of atomic electronic features, superimposing in a special geometry and explains to 3D structure-activity relationship. This method allows for prediction of the parameters of the Pha, APS groups that decrease the activity and AG groups that increase the activity and offers a significant advance both in the understanding the model of biological interaction of the molecule and in the predicting its activity. In this study conformational analysis, electronic structure calculations and matrix comparisons are performed for the 21 Adenosine series. ETMC was prepared for each of these two series. ECSA was prepared in ESCP in order to determine Pha group. While N1, C2, N4, C7 and C4 atoms of Pha group are present in series. Parametres was prepared in EMRE V1.2 programme which was formatted in Delphi Programme by depending on Pha atoms. The activity calculation was made by using prepared parameter in Matlab programme by englaying genetic algoritma optimization. We that saw it was confirmed that the theorical results. The best result in Adenosine series was found by using A11 compounds as referance with 18 kappa level and R2 value was calculated as 1.0000
Benzer Tezler
- Yeni bazı bifenil sübstitüe kromon bileşiklerinin sentezi, yapı aydınlatması ve adenozin monofosfat ile aktive protein kinaz (AMPK) aktivasyonu üzerinde çalışmalar
Studies on the synthesis, structure elucidation and adenosine monophosphate-activated protein kinase (AMPK) activation of some new biphenyl chromone compounds
SÜMEYYE GÜNEY KALKAN
- Acil servise supraventriküler taşikardi ile başvuran hastalarda medikal kardiyoversiyon sonrası EKG analizleri
ECG analysis after medical cardioversion in patients applicable to the emergency department with supraventricular tachicardia
AHMET TAHA ÖZATAK
Tıpta Uzmanlık
Türkçe
2022
Acil TıpBezm-İ Alem Vakıf ÜniversitesiAcil Tıp Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. ERTAN SÖNMEZ
- Hibrit derin öğrenme mimarileri kullanılarak meme kanseri histopatolojik görüntülerinin analizi ve sınıflandırılması
Analysis and classification of breast cancer histopathological images using hybrid deep learning architectures
FEYZA YILMAZ
Yüksek Lisans
Türkçe
2026
Bilgisayar Mühendisliği Bilimleri-Bilgisayar ve KontrolKonya Teknik ÜniversitesiBilgisayar Mühendisliği Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. EMİNE BAŞ
- Molecular genetic characterization of nod-like receptor 11 (NLRP11) in the regulation of adaptive immune responses
Edinsel bağışıklık cevabının düzenlenmesinde nod-benzeri reseptör 11 (NLRP11)'in moleküler genetik karakterizasyonu
İREM ÖZEL
Yüksek Lisans
İngilizce
2018
Biyolojiİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyokimya ve Genetik Ana Bilim Dalı
DOÇ. DR. CEREN ÇIRACI
- Analysis of total ada activity in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) of DADA2 patients
DADA2 hastalarının periferik kan mononükleer hücrelerinde total ada aktivitesinin analizi
TURNA DEMİRCİ
Yüksek Lisans
İngilizce
2022
Genetikİstanbul Teknik ÜniversitesiMoleküler Biyoloji-Genetik ve Biyoteknoloji Ana Bilim Dalı (disiplinlerarası)
PROF. DR. EDA TAHİR TURANLI