Geri Dön

Mitokondri genomundan evrimsel olarak nükleer genoma transfer olan genlerde kodon kullanım farkına bağlı mutasyon etkisi

The mutation effect of different codon usage on the genes evolutionarily transferred from mitochondrial genome to nuclear genome

PDF İndir

  1. Tez No: 233778
  2. Yazar: ABDULLAH OLGUN
  3. Danışmanlar: Y.DOÇ.DR. LEVENT ÖZBEK
  4. Tez Türü: Yüksek Lisans
  5. Konular: Biyokimya, Biyoloji, Biyoteknoloji, Biochemistry, Biology, Biotechnology
  6. Anahtar Kelimeler: Mitokondri DNA'sı (mtDNA), Reclinomonas americana, Genetik kod, Gen transferi, Mutasyon, Mitochondrial DNA (mtDNA), Reclinomonas americana, Genetic code, Gene transfer, Mutation
  7. Yıl: 2007
  8. Dil: Türkçe
  9. Üniversite: Ankara Üniversitesi
  10. Enstitü: Biyoteknoloji Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: 40

Özet

Mitokondri genomu evrimsel süreç boyunca yatay gen transferiyle nükleusa transfer sonucu küçülmüstür. nsan mitokondri DNA'sı (mtDNA) sadece 13 proteini kodlar. Reclinomonas americana (R. americana) mtDNA'sı var olan en büyük mitokondri genomlarından biridir ve mtDNA'sının evriminin çok erken evrelerini temsil eder. nsan mitokondri DNA'sı standart genetik kod kullanan R. americana mtDNA'sından farklı kod kullanır. Bu çalısmada; i) R. americana ve insan mtDNA'sı, ii) R. americana mtDNA'sı tarafından kodlanan oksidatif fosforilasyon komplekslerinin 25 altbirimiyle bunların insandaki mitokondriyal ve nükleer ortologları nükleotid ve amino asit düzeylerinde karsılastırılmıstır. Bu organizmaların mtDNA'ları arasında, sadece, COX3 geninin de bir kısmı olan çok küçük bir bölgede benzerlik bulunmustur. Protein seviyesindeki benzerlik DNA'ya göre çok daha fazla korunmustur. R. americana mtDNA genlerinin insandaki nükleer ortologları mitokondriyal ortologlara göre çok daha fazla benzerlik göstermektedirler. Bu çalısmanın sonuçlarına göre mtDNA'sının nükleer DNA'ya göre daha yüksek mutasyon hızı oldugu, insan mitokondriyal genetik kodunun evrimsel olarak degisiminin mutasyonel etkilerinin oldugu ve bu degisimin muhtemelen mitokondriyal genomun nükleusa transferindeki engellerden biri oldugu ileri sürülebilir.

Özet (Çeviri)

The size of mitochondrial genome was reduced during the evolutionary process because of horizontal gene transfer to nucleus. Human mitochondrial DNA (mtDNA) encodes only 13 proteins. MtDNA of Reclinomonas americana (R. americana) is one of the biggest mitochondrial genomes representing very early stages of mtDNA evolution. Human mtDNA has some differences in codon reassignment from R. americana mtDNA which uses standart genetic code. This study compared i) R. americana and human mtDNA, ii) 25 subunits of oxidative phosphorylation complexes encoded by R. americana mtDNA and their both mitochondrial and nuclear orthologs in humans at nucleotide and amino acid level. The similarity of mtDNA in these organisms exists only in only one short region which is a part of COX3 gene. The similarity at protein level is more conserved than DNA level. Human nuclear orthologs of R. americana mtDNA genes were more similar than mitochondrial orthologs. The results of this study suggest that mitochondrial DNA has a higher mutation rate than nuclear DNA, the evolutionary change of human mitochondrial genetic code had mutational consequences and this change is likely one of the barriers in the transfer of mitochondrial genome to nucleus.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    350410

    Evolutionary engineering of phenylethanol-resistant saccharomyces cerevisiae

    Evrimsel mühendislik yöntemi ile feniletanole dirençli saccharomyces cerevisiae suşlarının eldesi

    CAN HOLYAVKİN

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    Biyolojiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ZEYNEP PETEK ÇAKAR

  2. Tez No

    405143

    Corynis lateralis (Hymenoptera:Cimbicidae) türünde mitokondri genomunun evrimi

    Evolution of the mitochondrial genome in Corynis lateralis (Hymenoptera:Cimbicidae)

    ÖZGÜL DOĞAN

    Yüksek Lisans

    Türkçe

    Türkçe

    2015

    BiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    YRD. DOÇ. DR. ERTAN MAHİR KORKMAZ

  3. Tez No

    356969

    Development of a Drosophila CMT4A model using IMAGO approach

    İAGSY yaklaşımını kullanarak bir CMT4A Drosophila modelinin geliştirilmesi

    KEREM YILDIRIM

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2013

    BiyolojiBoğaziçi Üniversitesi

    Moleküler Biyoloji ve Genetik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ESRA BATTALOĞLU

    DOÇ. DR. ARZU ÇELİK FUSS

  4. Tez No

    291718

    Çayır çekirgesi Chorthippus parallelus (Zetterstedt, 1821) (Acrididae:Orthoptera)'un Anadolu popülasyonlarının filocoğrafyası ve coğrafik genetiği

    Phylogeography and landscape genetics of Anatolian populations of the meadow Grosshopper Chorthippus parallelus (Zetterstedt, 1821) (Acrididae:Orthoptera)

    ERTAN MAHİR KORKMAZ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2011

    BiyolojiCumhuriyet Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. HASAN HÜSEYİN BAŞIBÜYÜK

    PROF. DR. NACİ DEĞERLİ

  5. Tez No

    496559

    Phylogenetic analysis and phylogeographic structure of Cynips quercusfolii (Hymenoptera:Cynipidae) as inferred from mtDNA and nDNA sequences

    Cynips quercusfolii'nin (Hymenoptera:Cynipidae) filogenetik analizi ve filocoğrafik yapısının mtDNA ve nDNA sekans yoluyla araştırılması

    SERDAR DİNÇ

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    BiyolojiAbant İzzet Baysal Üniversitesi

    Biyoloji Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. SERAP MUTUN

Geri Dön