Geri Dön

Pattern formation of two-dimensional model phospholipid molecules by molecular dynamics simulation

Moleküler dinamik simulasyon ile iki boyutlu model fosfolipid moleküllerin yapı oluşturmalarının incelenmesi

PDF İndir

  1. Tez No: 23569
  2. Yazar: MİNE YURTSEVER
  3. Danışmanlar: PROF. DR. JÜRGEN BRİCKMANN
  4. Tez Türü: Doktora
  5. Konular: Kimya, Chemistry
  6. Anahtar Kelimeler: Fosfolipidler, Fosfolipid Membranlar, Model Membranlar.Yapı Oluşumu.Moleküler Dinamik Simulasyonu.Kompütür Simulasyonu, Benzetim, Membranlar, Moleküler dinamik benzetimi, Moleküler yapı, Phospholipids, Phospho!ipid Membranes, Model Membranes, Pattern Formation.Molecular Dynamics Simulation.Computer Simulation, Simulation, Membranes, Molecular dynamic simulation, Molecular structure
  7. Yıl: 1992
  8. Dil: İngilizce
  9. Üniversite: Orta Doğu Teknik Üniversitesi
  10. Enstitü: Fen Bilimleri Enstitüsü
  11. Ana Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  12. Bilim Dalı: Belirtilmemiş.
  13. Sayfa Sayısı: Belirtilmemiş.

Özet

öz MOLEKÜLER DİNAMİK SİMULASYONU İLE İKİ BOYUTLU MODEL FOSFOLİPİD MOLEKÜLLERİNİN YAPI OLUŞTURMALARININ İNCELENMESİ YURTSEVER, Mine Doktora Tezi, Kimya Anabilim Dalı Tez Yöneticisi: Prof.Dr.Jürgen BRICKMANN Yardımcı Tez Yöneticisi:Prof.Dr.H.Önder PAMUK Şubat, 1992,86 sayfa. Bu çalışmada fosfolipid membranlar için bir model önerilmiştir. Bu modelle gerçek membranların gösterdiği bazı temel özellikler ve davranışlar incelenmiştir. Bu özelliklerden bazıları model parametrelerine bağlı olarak değişik yapılar oluşturmaları, faz geçişleri ve membranın yapısında bulunan diğer moleküllerle olan etkileşmesi sonucu yapıda meydana gelen değişikliklerdir. Bu özellikler moleküler dinamik simulasyon metodu ile çalışılmıştır. Membranların. yapısında bulunan diğer moleküllerle ve çevresi ile olan etkileşmeleri genellikle membranların yüzeyinde olduğundan,fosfolipid baş gruplarının oluşturduğu yüzey iki boyutlu bir model olarak çalışılmıştır. Baş grupları arasındaki etkileşmeler Lennard-Jones ve Coulomb tipi etkileşmelerdir. Sistem parametreleri seçildikten sonra yüzeydeki yapı oluşumları ve faz geçişleri sıcaklığın bir fonksiyonu olarak çalışılmıştır. Farklı parametre setleri arasında ilişki kuran matematiksel bir formülasyon geliştirilmiştir. Bu formülasyon, çalışılacak sistemlerin parametrelerini tayin etmede büyük kolaylık sağlamaktadır. Son olarak yüzeye yabancı bir molekül eklenerek, bu molekülün yüzeye ve faz geçiş sıcaklığına olan etkisine bakılmıştır.

Özet (Çeviri)

ABSTRACT PATTERN FORMATION OF TWO-DIMENSIONAL MODEL PHOSPHOLIPID MOLECULES BY MOLECULAR DYNAMICS SIMULATION YURTSEVER,Mine Ph.D in Chemistry Supervisor.-Prof.Dr.Jürgen BRICKMANN Co-Supervisor:Prof.Dr.H.Önder PAMUK Februarys 992,86 pages. In this work, we aim to present a model for phospholipid monolayers that attempts to illustrate some basic characteristics of lipid membranes such as pattern formation and phase transitions as a function of characteristic system parameters and interaction with a foreign molecule in the membrane by employing the molecular dynamics simulation technique. Since interactions which cause structural changes usually occur in the head group region of the membrane, a quasi three-dimensional model is developed to represent the surface formed by the head group of the phospholipid molecules. Interactions between the parts of the different head groups are taken as Lennard-Jones and Coulomb type. After establishing a iiiset of system parameters, pattern formation and phase transitions are studied as functions of the temperature. A scaling argument is used to relate different regions of the parameter space. Finally a bulky molecule (Gramicidin-A like) is placed into the model surface layer and changes in the transition temperature due to its presence are investigated.

Benzer Tezler

  1. Tez No

    20539

    Normal ve patolojik eritrosit zarlarının lipit ve protein paternlerinin belirlenmesi

    Başlık çevirisi yok

    AHMET KILINÇ

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    1992

    BiyokimyaMarmara Üniversitesi

    DOÇ.DR. A. SÜHA YALÇIN

  2. Tez No

    895241

    Yatay eksenli sualtı akıntı türbinlerinde kavitasyon olgusunun deneysel ve lineer olmayan sayısal yöntemler ile incelenmesi

    Investigation of cavitation phenomenon in horizontal axis marine current turbine by experimental and nonlinear numerical methods

    MEHMET SALİH KARAALİOĞLU

    Doktora

    Türkçe

    Türkçe

    2023

    Gemi Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Gemi İnşaatı ve Gemi Makineleri Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. ŞAKİR BAL

  3. Tez No

    464967

    Optimal control and reduced order modelling of fitzhugh-nagumo equation

    Fitzhugh-nagumo denkleminin eniyilemeli kontrolü ve indirgenmiş dereceli modellemesi

    TUĞBA KÜÇÜKSEYHAN

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2017

    MatematikOrta Doğu Teknik Üniversitesi

    Matematik Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. BÜLENT KARASÖZEN

  4. Tez No

    445091

    Numerical modeling of stratified dam reservoirs and lakes

    Tabakalı hazneli barajlar ve göllerin nümerik olarak araştırılması

    REDVAN GHASEMLOUNIA

    Doktora

    İngilizce

    İngilizce

    2016

    İnşaat Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    İnşaat Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    PROF. DR. MEHMET SEDAT KABDAŞLI

  5. Tez No

    405037

    Mechanistic modeling of drilling forces and study of residual stresses in drilling of compacted graphite iron

    Kompakt grafitli dökme demirde delik delme işleminin mekanistik modellemesi ve kalinti gerilmelerin incelenmesi

    KAVEH RAHIMZADEH BERENJI

    Yüksek Lisans

    İngilizce

    İngilizce

    2015

    Makine Mühendisliğiİstanbul Teknik Üniversitesi

    Makine Mühendisliği Ana Bilim Dalı

    DOÇ. DR. MUSTAFA BAKKAL

Geri Dön